Fv)。 经过重叠延伸PCR,用15个氨基酸(氨基酸序列(GGGGS)3,基因序列GGTGGAGGCG GTTC AG GCGGAGGTGGCTCTGGCGGTGGCGGATCG))组成的柔性连接肽将筛选到的重链、轻链连接成scFv 抗体基因片段,并将所得的scFv基因片段插入到pLIP6/GN表达载体上,构建重组质粒并化 学转化至表达型宿主菌中,获得了融合表达的抗氯霉素 scFv抗体。
[0042] 本发明还提供了氯霉素抗体基因重链可变区和轻链可变区序列,分别如SEQ ID No. 1和SEQ ID No. 2 ;以及scFv重链、轻链的氨基酸序列,如序列18和序列19。
[0043] 本发明还提供了借助NCBI设计的兼并引物,用于扩增上述基因。其中轻链扩增引 物除了常用的kappa链引物还引入了 lambda链引物,以覆盖抗体可变区的多样性。
[0044] 本发明还提供了含有上述基因的载体和载体的宿主细胞。本发明还提供了上述 scFv抗体、编码该抗体的基因、含有该基因的载体、含有该载体的宿主细胞在制备抗氯霉素 scFv抗体中的应用。
[0045] 以下实施例中的实验方法,如无特殊说明,均为常规方法。
[0046] 以下实施例中使用的试剂材料,如无特殊说明,均为常规生化试剂供应商购买得 到。
[0047] 以下实施例中由于氯霉素通用半抗原在合成时简称为CAP,所以以下相应细胞、基 因、菌种等提到有关了氯霉素时均简称为CAP。
[0048] 实施例1 :CAP单克隆细胞总RNA的提取及cDNA的合成
[0049] I、CAP单克隆细胞株10A3B6E总RNA的提取
[0050] 取通过本实验室筛选得到的新鲜单克隆细胞株10A3B6E,利用Qigen Rneasy Mini Kit提总RNA,细胞株10A3B6E可产生抗CAP的单克隆抗体。
[0051] ⑴培养细胞至3-4 X IO6个,300 Xg离心5min,移去上清;
[0052] ⑵配制裂解液:Buffer RLT: β -疏基乙醇=Iml: 10 μ 1 ;
[0053] ⑶向离心后的细胞中加入350 μ I Buffer RLT裂解缓冲液,轻弹管壁,用移液枪吹 打,使缓冲液与细胞充分接触;
[0054] ⑷加入同等体积的70%的乙醇溶液,移液枪轻轻吸打混匀,注意不要离心;
[0055] ⑶取Qigen Rneasy Mini Kit中的硅胶柱,装入2ml收集管上,转移所有的样品到 柱子中,室温下12000rpm离心15s,弃去废液;
[0056] (6伽入700 μ I Buffer RWl到柱中,室温下12000rpm离心15s,弃去流出液;
[0057] ⑴加入500 μ 1用乙醇稀释的RPE缓冲液,洗涤柱子,lOOOOrpm,离心15s,弃上清;
[0058] ⑶加入500 μ I RPE缓冲液移入柱子,轻盖盖子,室温下lOOOOrpm,离心2min,冲洗 柱子;
[0059] ⑶把柱子放入一个试剂盒提供的新2ml收集管中,全速离心Imin ;
[0060] (W)把柱子转移到Qigen Rneasy Mini Kit提供的I. 5ml离心管中,取50 μ 1的无 RNA酶水(试剂盒提供)小心悬空滴加到柱子的膜上,静置3-5min,轻轻盖上盖子,室温下 1000 Orpm 离心 lmin,洗脱 RNA ;
[0061] (11)洗脱的RNA分装、标记后,冻存于-80 °C。
[0062] 2、CAP-cDNA 的合成
[0063] ⑴添加以下组分到I. 5ml离心管:
[0064] 組分 体积 RNA 3μ1 Primer[01igo(dT)i5] 1 μΙ Random Primer I μL 终体积 5μ1
[0065] ⑵合好盖,将离心管放入70°C水浴5min,然后立即放到冰上,至少5min,离心10s 收集浓缩物保持原始体积,一直放冰上;
[0066] ⑶准备反转录体系,各组分一直放冰上;
[0067] 反应体系组分 体积 Nuclease-Frco water 6μ1 Go Scrip! 5x Reaction BuJTor 4μ1 MgCh 2.5μΙ
[0068] PCR Nucleotide Mix ?μL Recombinant RNasion 0,5μ1 Go Sript Reverse TranscripLasc ΙμL 终体积 15μ1
[0069] ⑷上一步准备的反应体系与第一步的反应体系混合,终体积20 μ I ;
[0070] (5)退火:25°C,5min ;
[0071] (6)延伸:42 °C,Ih ;
[0072] (7)分装,-80 °C 冻存。
[0073] 实施例2 :CAP-scFv表达质粒的构建
[0074] I、PCR 扩增 Vh、\
[0075] 所用引物:(VL后引物和scFv后引物为引物在使用时均为等量使用)
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[0078] 其中K为kappa引物,L为lambda引物,用kappa前引物也能扩增lambda链,所 以没有单独的lambda前引物。
[0079] CN 105177016 A 说明书 7/14 页
[0084] 经PCR扩增,产物利用琼脂糖凝胶电泳检测,结果如图1所示。
[0085] 2、利用Qiagen凝胶纯化试剂盒胶回收目的片段
[0086] (1)准备干净的离心管,称重;
[0087] ⑵用干净的刀片切下琼脂糖凝胶上的目的片段,放入离心管中;
[0088] ⑶称重,计算切下的胶重量,加入3倍体积的Buffer QG到1倍体积凝胶中;
[0089] (4) 50°C孵育,lOmin,直至胶完全溶解,每隔2_3min颠倒一次;
[0090] (5)胶完全溶解后,检查溶液颜色是否为黄色,如溶液颜色成橘黄色或紫色,加 IOul 3M醋酸钠混匀;
[0091] (6)加一倍凝胶体积异丙醇到溶液中,混匀(IOOmg-IOOul异丙醇);
[0092] (7)将试剂盒中的硅胶柱子放到2ml收集管;
[0093] ⑶结合DNA :将溶液加到柱子上,离心lmin,13000rpm(溶液体积超过800ul再离 心一次);
[0094] (9)倒尽流出液,将柱子再放回到离心管中;
[0095] (10)加 0· 5ml Buffer QG 到柱子上,离心 lmin,13000rpm ;
[0096] (11)洗脱:倒尽流出液,加入750ul Buffer PE到柱子上,离心Imin ;
[0097] (11)倒尽流出液,离心 lmin,13000rpm ;
[0098] (I2)将柱子放到一个干净的I. 5ml离心管;
[0099] (1?洗提 DNA,加 50ul Buffer EB 或 pH 为 7. 0-8. 5 水到膜中间,离心 Imin ;
[0100] 3、利用 eppendorf Bio-PhotoMeter plus 测定 Vh和 V [浓度
[0101] 4、序列的测定与分析
[0102] (1)抗体的质谱鉴定
[0103] 将氯霉素单克隆抗体进行纯化,利用木瓜蛋白酶进行水解后,利用ProteinA吸附 抗体恒定区,获得纯化的Fab,利用SDS-PAGE进行检测(图2),分别将重链和轻链切割下来 进行质谱鉴定。
[0104] ⑵抗体基因可变区的序列测定
[0105] 将重链可变区和轻链可变区连接到T载体中,进行规模化测序,每种片段测序 20-30个克隆,将测序获得的核酸序列翻译成氨基酸序列,与质谱测序结果,进行比对(图 3、4)。根据比对结果,选择与质谱测序结果最相近的VH15号和号继续后续实验。
[0106] 5、CAP_scFv 合成
[0107] (1)预拼接体系:
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[0117] 经PCR扩增,产物用琼脂糖凝胶电泳检测,结果见图5。切取约750bp左右的目的 条带,用Qiagen凝胶纯化试剂盒胶回收,