人类x染色体20个短串联重复序列复合扩增体系及应用
【技术领域】
[0001] 本发明涉及生物技术领域，涉及人类X染色体20个短串联重复序列复合扩增体 系，具体涉及利用X染色体上具有多态性的遗传标记、通过聚合酶链式反应进行复合扩增 的荧光检测试剂盒，该体系可以应用于与X染色体相关的日常亲权鉴定、个体识别以及X染 色体伴性遗传疾病的辅助检测。
【背景技术】
[0002] 人类基因组STR(短串联重复序列）是以少数几个碱基为核心单位，串联重复形成 的DNA遗传标记。不同种族、不同人群甚至不同个体之间的区分是通过核心单位序列和重 复数的差异，这也构成了 STR的遗传多态性。在基因组中，平均每15~20kb就有一个 STR位点，占基因组的10%，多存在于非编码区及内含子中，重复单位为2~6bp，重复 次数10~60次，片段大小在70~500bp，并按孟德尔规律呈共显性遗传。因此STR复合 扩增检测技术可以广泛应用于法医个体识别、亲子鉴定等领域。
[0003] 在人类的23对染色体中，其中一对为性别染色体即为X染色体和Y染色体。女性 的一对X染色体在卵细胞生成的过程中可以像常染体一样发生重组，但是在男性的精子细 胞生成的过程中，X染色体和Y染色体不能随意重组。父亲的X染色体只遗传给女儿，母亲 的X染色体可以遗传给女儿，也可以遗传给儿子。所以X染色体这种独特的遗传方式使得 其在亲权鉴定中具有特殊的应用价值。比如双亲缺失的姐妹认亲、同父异母姐妹关系鉴定、 祖母-孙女关系鉴定、乱伦关系鉴定、强奸案件的鉴定以及与X染色体相关的遗传疾病的鉴 定等。
[0004] 与现在市面上常染色体STR试剂盒的数量相比，X-STR试剂盒的数量仅有几家可 供选择，另外X染色体相关的专利数量也比较少。
[0005] 现有X-STR试剂盒和X染色体相关的专利其针对的STR位点数量较少，且在遗传 多态性、个体识别力和检测的准确性上有一定欠缺，因此有必要开发一种位点数量多、遗传 多态性高、个体识别力强的X-STR试剂盒。
【发明内容】
[0006] 为了克服上述缺陷，本发明的目的在于提供一种一次能检测19个X-STR基因座及 Amelogenin基因座的人类X染色体20个短串联重复序列复合扩增体系，适用于使用常染体 STR试剂盒难以排除亲权关系案例的检测，并且本发明荧光标记复合扩增体系检测快速、准 确。
[0007] 本发明的又一个目的是提供人类X染色体短串联重复序列复合扩增体系在X染色 体相关的亲权鉴定、个体识别中的应用。
[0008] 为了实现上述发明目的，本发明所采取的技术方案：人类X染色体短串联重复序 列复合扩增体系，其特征在于，该复合扩增体系包括19对引物，可同时扩增19个STR位点： DXS6795、DXS6803、DXS6807、DXS9907、DXS7423、GATA172D05、DXSlOl、DXS9902、DXS7133、 DXS6810、GATA31E08、DXS6800、DXS981、DXS10162、DXS6809、GATA165B12、DXS10079、 DXS10135、HPRTB ;
[0009] 所述扩增DXS6795的上游引物序列如SEQ ID NOl所示；
[0010] 所述扩增DXS6795的下游引物序列如SEQ ID N02所示；
[0011] 所述扩增DXS6803的上游引物序列如SEQ ID N03所示；
[0012] 所述扩增DXS6803的下游引物序列如SEQ ID N04所示；
[0013] 所述扩增DXS6807的上游引物序列如SEQ ID N05所示；
[0014] 所述扩增DXS6807的下游引物序列如SEQ ID N06所示；
[0015] 所述扩增DXS9907的上游引物序列如SEQ ID N07所示；
[0016] 所述扩增DXS9907的下游引物序列如SEQ ID N08所示；
[0017] 所述扩增DXS7423的上游引物序列如SEQ ID N09所示；
[0018] 所述扩增DXS7423的下游引物序列如SEQ ID NOlO所示；
[0019] 所述扩增GATA172D05的上游引物序列如SEQ ID N013所示；
[0020] 所述扩增GATA172D05的下游引物序列如SEQ ID N014所示；
[0021] 所述扩增DXSlOl的上游引物序列如SEQ ID N015所示；
[0022] 所述扩增DXSlOl的下游引物序列如SEQ ID N016所示；
[0023] 所述扩增DXS9902的上游引物序列如SEQ ID N017所示；
[0024] 所述扩增DXS9902的下游引物序列如SEQ ID N018所示；
[0025] 所述扩增DXS7133的上游引物序列如SEQ ID N019所示；
[0026] 所述扩增DXS7133的下游引物序列如SEQ ID N020所示；
[0027] 所述扩增DXS6810的上游引物序列如SEQ ID N021所示；
[0028] 所述扩增DXS6810的下游引物序列如SEQ ID N022所示；
[0029] 所述扩增GATA31E08的上游引物序列如SEQ ID N023所示；
[0030] 所述扩增GATA31E08的下游引物序列如SEQ ID N024所示；
[0031] 所述扩增DXS6800的上游引物序列如SEQ ID N025所示；
[0032] 所述扩增DXS6800的下游引物序列如SEQ ID N026所示；
[0033] 所述扩增DXS981的上游引物序列如SEQ ID N027所示；
[0034] 所述扩增DXS981的下游引物序列如SEQ ID N028所示；
[0035] 所述扩增DXS10162的上游引物序列如SEQ ID N029所示；
[0036] 所述扩增DXS10162的下游引物序列如SEQ ID N030所示；
[0037] 所述扩增DXS6809的上游引物序列如SEQ ID N031所示；
[0038] 所述扩增DXS6809的下游引物序列如SEQ ID N032所示；
[0039] 所述扩增GATA165B12的上游引物序列如SEQ ID N033所示；
[0040] 所述扩增GATA165B12的下游引物序列如SEQ ID N034所示；
[0041] 所述扩增DXS10079的上游引物序列如SEQ ID N035所示；
[0042] 所述扩增DXS10079的下游引物序列如SEQ ID N036所示；
[0043] 所述扩增DXS10135的上游引物序列如SEQ ID N037所示；
[0044] 所述扩增DXS10135的下游引物序列如SEQ ID N038所示；
[0045] 所述扩增HPRTB的上游引物序列如SEQ ID N039所示；
[0046] 所述扩增HPRTB的下游引物序列如SEQ ID N040所示。
[0047] 进一步地，人类X染色体短串联重复序列复合扩增体系还包括一对能扩增 Amelogenin的一对引物，分别为：
[0048] 扩增Amelogenin的上游引物序列如SEQ ID NOll所示；
[0049] 扩增Amelogenin的下游引物序列如SEQ ID N012所示。
[0050] 前述的人类X染色体短串联重复序列复合扩增体系，其引物浓度比例是： DXS6795SEQ ID N01-2,0. 179 μmol/L^DXS6803SEQ ID N03-4,0. 126 μmol/L^DXS6807SE-Q ID N05-6,0.245 ymol/L、DXS9907SEQ ID N07-8,0.150 ymol/L、DXS7423SEQ ID Ν09-10， 0. 162 μmol/L^Amelogenin SEQ ID N011-12,0. 060 μmol/L^GATA172D05SEQ ID N013-14, 0. 192ymol/L^ DXS101SEQ ID N015-16,0. 190 μmol/L^ DXS9902SEQ ID N017-18, 0. 169 ymol/L^ DXS7133SEQ ID