tion Buffer (预先60°C预热),放置2min后离心,备用。用I %琼脂糖凝胶电泳检测,结果如表 6所示。
[0130] 所述的溶液 Pl: 50mmol/L 葡萄糖,25mmol/L Tris · HCl (pH8. 0) 10mmol/L EDTA(pH8. 0);须确使细菌沉淀在溶液I中完全分散,将两个微量离心管的管底部互相接触 震荡,可使沉淀迅速分散。
[0131] 所述的溶液P2 :0· 2mol/L NaOH(临用前用lOmol/L贮存液现用现稀释),1 % (w/ w) SDS盖紧管口,快速颠倒离心管5次,以混合内容物。应确保离心管的整个内表面均与溶 液II接触。不要振荡,将离心管放置于冰上。
[0132] 所述的溶液P3 :5mol/L乙酸钾,60mL冰乙酸,11. 5mL水,28. 5mL,所配成的溶液对 钾是3mol/L,对乙酸根是5mol/L。盖紧管口,将管倒置后和地振荡10秒钟溶液III在粘稠的 细菌裂解物中分散均匀,之后将管置于冰上3~5分钟。
[0133] 表 6 待测菌株 B. Iongum HB25 和 L. acidophilus HL9 没有质粒
[0135] 2、耐药基因的鉴定
[0136] 耐药基因 PCR和耐药基因定位
[0137] 以待测菌的基因组DNA为模板;
[0138] 氨苄引物:上游:引物 F :5' -GCAACTTTATCCGCCTCCAT-3' ;
[0139] 下游:引物 R :5, -CATTTCCGTGTCGCCCTTAT-3' ;
[0140] PCR反应体系:
[0142] PCR 反应条件:94°C预变性 5min ;94°C变性 30s,68°C退火 30s,72°C延伸 6min,退 火温度每个循环降低l°c,12个循环,直至57°C ;然后94°C变性30s,56°C退火30s,72°C延 伸6min,进行30个循环;最后72°C延伸lOmin。
[0143] PCR反应结束以后,根据Marker分子量比较产物的大小,与已知片段大小进行比 照,可确定菌株中是否含有相应抗性基因。
[0144] 从图 2 中可以看出我们从 Bifidobacterium longum HB25 和 Lactobacillus acidophilus HL9基因组DNA中扩增得到amp耐药基因。
[0145] 3、耐药基因定位的鉴定
[0146] (1)探针制备:
[0147] 经过耐药性分析,得到具有染色体耐药性的2株菌长双歧杆菌Bifidobacterium longum HB25 和嗜酸乳杆菌 Lactobacillus acidophilus HL9,用 NuSieve-低恪点琼脂糖 纯化HB25、HL9的氨苄抗性基因 amp PCR产物两次,并地高辛标记探针(DIG系统)。
[0148] (2)模板制备:
[0149] 长双歧杆菌 Bifidobacterium longum HB25 和嗜酸乳杆菌 Lactobacillus acidophilus HL9菌株的基因组DNA(参照TIANGEN公司的细菌基因组DNA提取试剂盒的说 明书)用HindIII酶酶切消化。取10 μ L待测DNA,于1 %的琼脂糖凝胶上进行电泳,凝胶 用IiB染料染色,记录结果,结果如图3-Α所不。
[0150] (3)杂交用胶的制备和DNA转膜:
[0151] Α、将电泳结束后的凝胶,小心放入30mL 0. 25mol/L HCl溶液中完全浸入15min。
[0152] B、用蒸馏水短暂洗凝胶2次。
[0153] C、将清洗后的凝胶放入含有30mL的变性溶液(1.5mol/L NaCl,0.5mol/L NaOH) 中使凝胶变性30min。
[0154] D、将变性后的凝胶放入含有30mL中和液溶液(lmol/L Tris ·Η(:1,ρΗ8. 0,1. 5mol/ L NaCl)中使其中和15min。
[0155] 准备DNA从凝胶向膜转移的平台。切割与待转移胶大小相同的1张待用尼龙膜和 3张厚滤纸并在尼龙膜一角做一标记。另1张厚滤纸切成与凝胶相同宽度长度约18cm足以 达到转移液盒子的底部。准备10 X SSC转移液(称取87. 66g NaCl和44. 12g柠檬酸三钠, 分别溶解,一起定容至1000 mL)。将待用尼龙膜放入蒸馏水中浸湿后,再浸入10 X SSC转移 液中。
[0156] (4) DIG 系统杂交:
[0157] 加入适量的探针到已预热的杂交液中混合均匀,根据的标准程序进行,在42°C下 进行严格的杂交、过夜,漂洗5min在2XSSC溶液中,然后使用2XSSC/0. 1% SDS在42°C 条件下进行IOmin洗膜;而后用I X SSC/0. 1 % SDS在42°C条件下进行IOmin洗膜;再次用 0· 5XSSC/0. 1% SDS在42°C条件下进行IOmin洗膜;结束后尼龙膜用0· 2XSSC/0. 1% SDS 在56°C洗膜IOmin ;转入0.1 X SSC/0. 1 % SDS在56°C洗膜lOmin。在尼龙膜的清洗过程中 不断振摇,不断用放射性检测仪探测膜上的放射强度。在暗房中取出X光片在显影液中进 行显影3~5min,用水冲洗去除显影液置于定影液中定影5~10min,取出X光片冲洗干净, 晾干。
[0158] 所述的显影液:温水(52°C )750mL、米吐尔3g、无水亚硫酸钠45g、对苯二酚12g、 无水碳酸钠67. 5g、溴化钾19g,水加至1000 mL ;
[0159] 所述的定影液:水750mL、硫代硫酸钠240g、无水亚硫酸钠15g、28% (w/w)醋酸 48mL、硼酸7. 5g、钾矾15g、水加至1000mL。
[0160] 结果如图3-B所示,通过杂交试验证明了在B. longum HB25基因组DNA大约6. 6~ 9. 4kb处有amp基因编码序列,同样在L. acidophilus HL9基因组DNA大约2. 3~4. 4kb处 有amp基因编码序列。而在氨苄敏感性LGG菌株基因组DNA里面没有检测得到amp基因, 证明试验方案有效。
[0161] 实施例4
[0162] 益生菌对肠道菌群的调节作用的过程如图7所示,A)肠道病原菌,有益菌和宿主 维持微生物的动态平衡;B)抗生素处理破坏肠道平衡,使肠道定植抵抗丢失,容易受到病 原菌的感染;C)肠道益生菌①通过分泌产生pH、细菌素拮抗病原菌,②通过竞争性拮抗病 原菌上皮细胞粘附位点抑制病原菌生长,③通过刺激机体免疫细胞T、B细胞,提高机体免 疫应答。
[0163] -、材料
[0164] 1、主要试剂
[0165] 氨节西林(Ampicillin),克林霉素(clindamycin)和链霉素(streptomyci),购自 上海新先锋药业有限公司(Oxoid)。
[0166] (1)培养基
[0167] 脑心浸液(Brain heart infusion,BHI)培养基:用于肠道厌氧总菌的分离,精 确称取C6H12O6 2. Og,NaCl 5. Og,BHI营养物27. 5g,磷酸二氢钠2. 5g,琼脂15. Og,加水至 lOOOmL,加入琼脂前调pH为7. 4±0. 2,115°C湿热灭菌15min。
[0168] BSM培养基:用于双歧杆菌分离,精确称取琼脂15g,L-半胱氨酸0. 5g,莫匹罗星 50mg,加水至lOOOmL,调节pH5. 0,115°C湿热灭菌15min,培养基冷却50°C左右加入莫匹罗 星。
[0169] SCE培养基:用于肠球菌分离,叠氮钠0. 5g,NaCl 5g,牛肉膏蛋白胨10g,七叶苷 0. 8g,0. 4mL 0. 05%结晶紫,酵母提取物5g,K2HPO4 4g,柠檬酸铁铵0. 5g,KH2PO4 I. 5g,溶解 后加入15g琼脂,并加水至1000mL,pH计调节溶液pH至8. 0,115°C湿热灭菌15min。
[0170] EMB培养基:用于肠杆菌分离,EMB琼脂粉末45g,加水至lOOOmL,煮沸溶解,115°C 湿热灭菌15min。
[0171] (2)小鼠粪便稀释缓冲液:
[0172] L-半胱氨酸 0· 5g,ImL 吐温 80,酵母粉 0· 5g,NaCl 9g,KH2PO4 0· 21g,Na2HPO40. 72g,补充蒸馏水至1000mL,并调节溶液pH至6. 2~6. 6,118°C高压蒸汽灭菌15min。
[0173] (3)三联抗生素溶液:
[0174] 于无菌条件下,取灭菌双蒸水配制125mg/mL的三联抗生素灌胃用溶液,抗生素溶 液均现配现用。
[0175] (4) IOmL DGGE 加样缓冲液:
[0176] 精确量取0.251^2%溴酚蓝,0.251^2%二甲苯青,71^100%甘油以及2.511^ MilliQ 水。
[0177] ⑶5〇 X TAE电泳缓冲液:
[0178] 精确称取242g Tris碱加入少量双蒸水(DDW)溶解,加入57. ImL的冰HAc,再加入 IOOmL ρΗ8· 0 的(λ 5mol/L EDTA,补加 DDW 定容至 1000mL,4°C冰箱储存。
[0179] (6) 40 %丙烯酰胺/双丙烯酰胺:
[0180] 精确称取丙稀酰胺38. 93g,甲叉双丙稀酰胺I. 07g,添加 DDW至100mL,常温下溶解 后0. 45 μ m微孔滤膜过滤,4°C避光保存。
[0181] (7) 10 % 过硫酸铵(AP):
[0182] 精确称取0. 3g过硫酸胺,加入双蒸水3. OmL,使粉末溶解后使用0. 45 μ m无菌微孔 滤膜过滤除菌,4 °C冰箱储存。
[0183] (8)DGGE lording buffer :
[0184] 量取2%溴酚蓝0.2511^,2%二甲苯蓝0.2511^,7.011^100%甘油,0服2.511^。
[0185] (9) 400mL银染溶液的配制:
[0186] 精确称取0. 8g硝酸银,50mL 8 X固定液以及350mL MilliQ水。其中8 X固定液 溶液为200mL乙醇,IOmL冰HAc以及40mL MilliQ水。
[0187] (10)0 %的变性储存液:
[0193] 2、主要仪器
[0194] 病理切片机一德国Leica RM2235 ;血球计数板一国产;DGGE变性梯度凝胶电泳 仪一美国Bio Rad。
[0195] 3、实验动物
[0196] 30只小鼠购自中山大学实验动物中心,合格证号:SCXK (粵2011-0029),SPF级小 鼠 BALB/c体重18~22g/只,鼠龄大约在8weeks左右,饲养在SPF级动物实验室,温度维 持在18~20°C,湿度维持在50~60%,实验所自动排风,每天光照大约12小时,每日上午 更换食、水和消毒垫料1次,并且分笼饲养观察7天能正常进食和饮水者纳入实验用鼠。
[0197] 二、实验方法
[0198] 1、建模
[0199] SPF级BALB/c小鼠被分成2个大组,即对照组和抗生素处理组。对照组一直灌胃 无菌生理盐水5d ;抗生素处理组小鼠灌胃剂量相当于成人正常10倍剂量的125mg/mL,三 联抗生素溶液0. 2mL/次,每天2次,灌胃时间间隔为6h,连续灌胃5d。观察小鼠的生理活 动(毛发、进食、粪便等情况)。
[0200] 2、腹泻观察及程度评定标准
[0201] 造模及治疗期间,观察受试动物排便状况及粪便外观每天1次。抗生素溶液灌胃 后立即观察用药反应2~3分钟,以后每12小时观察记录1次,记录内容:小鼠活动表现和 粪便变化情况。腹泻症状等级评定标准如下:
[0202] III级:水样便,不成形,几乎无粪质,每天排泄次数超过40次。
[0203] I