erg DM. Metabolic Pathwa ys:Energetics, tricarboxylic acid cycle, and carbohydrates. Academic Press ; 1967 ; Greenberg M.Metabolic pathways. Academic Press;1968 ;Greenberg DM.Metabolic pathways. Academic;1970 ;和 Greenberg DM, Vogel HJ. Metabolic pathways. Academic ； 1971等等，各自通过提述并入本文。
[0046] 感兴趣的通路包括，没有限制，涉及碳水化合物，氨基酸，核酸，类固醇，以及 脂肪酸代谢的通路，并可以包括抗生素的合成，例如放线菌素，博来霉素，利福霉素，氯 霉素，四环素，林可霉素，红霉素，链霉素，环己酰胺，嘌呤霉素，环丝氨酸，杆菌肽，青霉 素，头孢菌素，万古霉素，多粘菌素，和短杆菌肽；生物表面活性剂例如鼠李糖脂，槐糖脂 (sophorolipid)，糖脂，和脂肽；生物燃料例如生物乙醇，生物柴油，和生物丁醇；氨基酸， 例如L-谷氨酸，L-赖氨酸，L-苯丙氨酸，L-天冬氨酸，L-异亮氨酸，L-缬氨酸，L-色氨 酸，L-脯氨酸（羟脯氨酸），L-苏氨酸，L-蛋氨酸，和D-P-羟基苯甘氨酸；有机酸，例如柠 檬酸，乳酸，葡糖酸，乙酸，丙酸，琥珀酸，富马酸，和衣康酸；脂肪酸如花生四烯酸，多不饱和 脂肪酸（PUBA)，和γ-亚油酸；多元醇例如丙三醇，甘露醇，赤藓醇，和木糖醇；香精和香料 例如香草醛，苯甲醛，二羟基丙酮（dixydroxyacetone)，4_(R)_葵内酯，和2-酰基-1-吡略 啉；核苷酸例如5' -鸟苷酸和5' -肌苷酸；维生素例如维生素 C，维生素 F，维生素 B2,前维 生素 D 2,维生素 B12,叶酸，烟酰胺，生物素，2-酮-L-古洛糖酸（gulonic acid)，和前维 生素 Q10;色素，例如奸青素（astaxathin)，β-胡萝卜素，leucopene，红曲红素和红斑素 (rubropunctatin);糖和多糖，例如核糖，山梨糖，黄原胶，结冷胶（gellan)，和葡聚糖；生 物聚合物和塑料，例如聚羟基烷酸酯（PHA)，聚-γ -谷氨酸，和1，3-丙二醇；等等如本领域 中已知的。
[0047] 感兴趣的途径中的酶可以催化若干反应。可以由酶分类号确定的大类，提供 于括号中，包括（EC 1)氧化还原酶，例如，脱氢酶，氧化酶，还原酶，氧化还原酶，合酶， 加氧酶，单加氧酶，双加氧酶，脂肪加氧酶，氢化酶，转氢酶，过氧化物酶，过氧化氢酶，环 氧酶，羟化酶，脱甲基酶，去饱和酶，歧化酶，羟基转移酶，脱齒酶，脱碘酶；(EC2)转移酶， 例如转氨酶，激酶，二激酶，甲基转移酶，羟甲基转移酶，甲酰基转移酶，亚胺甲基转移酶 (formiminotransferase)，羧基转移酶，氨甲酰基转移酶，脒基转移酶，转醛醇酶，转酮醇 酶，乙酰转移酶，酰基转移酶，棕榈酰转移酶，琥珀酰转移酶，丙二酰转移酶，没食子酰转 移酶，sinapoyltransferases，巴豆酰转移酶，十四酰转移酶，羟基肉桂酰转移酶，阿魏酰 转移酶，mycolyltransferases，苯甲酰转移酶，piperoyltransferases，三甲基十三酰转 移酶，肉豆蔻酰转移酶，香豆酰转移酶，硫解酶，氨酰转移酶，磷酸化酶，己糖基转移酶，戊 糖基转移酶，唾液酸转移酶，吡啶基酶，二磷酸化酶，环转移酶（cyclotransferase)，硫酰 酶，腺苷转移酶（adenosyltransferase)，羧乙稀转移酶，异戊烯基转移酶，氨基羧基丙 基转移酶（aminocarboxypropyltransferase)，二甲基稀丙基转移酶，法呢酯转转移酶 (farnesyltranstransferase)，六异戊二烯基车专车专移酉每（hexaprenyltranstransferase)， 十异戊二烯基顺转移酶（decaprenylcistransferase)，五异戊二烯基转转移酶 (pentaprenyltranstransferase)，九异戊二烯基车专移酉每（nonaprenyltransferase)，牛龙 牛儿基牛龙牛儿基转移酶（geranylgeranyltransferase)，氨基羧基丙基转移酶，聘基转 移酶，噪呤转移酶，磷酸歧化酶（phosphodismutases)，磷酸转移酶，核苷酸基转移酶，聚合 酶，胆碱磷酸转移酶，磷酰基变位酶（phosphorylmutase)，硫基转移酶，磺基转移酶，CoA转 移酶；(EC3)水解酶，例如脂肪酶，酯酶，淀粉酶，肽酶，水解酶，内酯酶，脱酰基酶，脱乙酰基 酶，pheophorbidases，解聚酶，硫酯酶，磷酸酶，二磷酸酶，三磷酸酶，核苷酸酶，植酸酶，磷 酸二酯酶，磷脂酶，硫酸酯酶，环化酶，寡核苷酸酶，核糖核酸酶，外切核酸酶，内切核酸酶， 糖苷酶，核苷酶，糖基化酶，氨肽酶，二肽酶，羧肽酶，金属羧肽酶，ω -肽酶，丝氨酸内肽酶， 半胱氨酸内肽酶，天冬氨酸内肽酶，金属内肽酶，苏氨酸内肽酶，氨基酶，酰胺酶，脱琥珀酰 酶，脱甲酰基酶，酰基转移酶，脱亚酰基酶，脱氨酶，二水解酶，环水解酶，腈水解酶，ATP酶， GTP酶，卤化酶，脱卤酶，磺基水解酶；(EC4)裂解酶，例如脱羧酶，羧化酶，羧激酶，醛缩酶， epoxylyases，含氧酸-裂解酶，碳-碳裂解酶，脱水酶，水合酶，合酶，内切裂合酶，外切裂 合酶，氨裂解酶，脒裂解酶，胺-裂解酶，碳-硫裂解酶，碳-卤素裂解酶，磷-氧裂解酶，脱 氯化氢酶；(EC 5)异构酶，例如，异构酶，消旋酶，变位酶，互变异构酶，磷酸变位酶，磷酸葡 萄糖变位酶，氨基变位酶，环异构酶，环化酶，拓扑异构酶；和（EC 6)连接酶，例如，合成酶， tNRA-连接酶，酸-硫醇连接酶，酰胺合酶，肽合酶，环连接酶，羧化酶，DNA连接酶，RNA连接 酶，环化酶。
[0048] 更具体的类型包括，没有限制，氧化还原酶包括那些（EC I. 1)作用于供体的 CH-OH基团，和受体；(EC 1.2)作用于供体的醛或酮基，和受体；(EC 1.3)作用于供体的 CH-CH基团，和受体；(EC 1. 4)作用于供体的CH-NH2基团，和受体；(EC 1. 5)作用于供体的 CH-NH基团，和受体；(EC 1. 6)作用于NADH或NADPH，和受体；(EC 1. 7)作用于作为供体的 其它含氮化合物，和受体；(EC 1.8)作用于供体的硫基团，和受体；(EC 1.9)作用于供体的 血红素基团，和受体；(EC 1.1)作用于作为供体的联苯酚和相关物质，和受体；(EC 1.11) 作用于作为受体的过氧化物；(EC 1. 12)作用于作为供体的氢，和受体；(EC 1. 13)作用于 具有整合分子氧的单个供体，整合一个或来两个氧原子；(EC 1. 14)作用于配对供体，具有 整合或减少的氧分子，其中供体是2-氧化戊二酸，NADH，NADPH，还原亚黄素，黄素蛋白，蝶 啶，铁硫蛋白，抗坏血酸；(EC 1. 15)作用于作为受体的超氧自由基；(EC 1. 16)氧化金属离 子，和受体；(EC 1.17)作用于CH或CH2基团，和受体；(EC 1.18)作用于作为供体的铁硫蛋 白，和受体；(EC 1.19)作用于作为供体的还原的黄素氧还蛋白，和受体；(EC 1.2)作用于 供体中的磷或砷，和受体；(EC 1. 21)作用于X-H和Y-H以形成X-Y键，和受体；其中对于每 个供体种类的受体可以包括，没有限制：NAD，NADP，血红素蛋白，氧，二硫化物，苯醌，铁-硫 蛋白，黄素，含氮基，细胞色素，二氮，和H +。
[0049] 转移酶包括那些：(EC 2. 1)转移一碳基团；(EC 2. 2)转移醛或酮基；(EC 2. 3)酰 基转移酶；(EC 2. 4)糖基转移酶；(EC 2. 5)转移除甲基外的烷基或芳基；(EC 2. 6)转移含 氮基团；(EC 2. 7)转移含磷基团；(EC 2. 8)转移含硫基团；(EC 2. 9)转移含硒的基团。
[0050] 水解酶包括那些：(EC 3. 1)作用于酯键；(EC 3. 2)糖基化酶；(EC 3. 3)作用于醚 键；(EC 3. 4)作用于肽键（肽酶）；(EC 3. 5)作用于除肽键外的碳-氮键；(EC 3. 6)作用 于酸酐；(EC 3. 7)作用于碳-碳键；(EC 3. 8)作用于卤键；(EC 3. 9)作用于磷-氮键；(EC 3. 1)作用于硫-氮键；(EC 3. 11)作用于碳-磷键；(EC 3. 12)作用于硫-硫键；(EC 3. 13) 作用于碳-硫键。
[0051] 裂解酶包括那些：(EC 4. 1)碳-碳裂解酶；(EC 4. 2)碳-氧裂解酶；(EC 4. 3) 碳-氮裂解酶；(EC 4. 4)碳-硫裂解酶；(EC 4. 5)碳-卤裂解酶；(EC 4. 6)磷-氧裂解酶。
[0052] 异构酶包括那些：(EC 5. 1)消旋酶和差向异构酶；(EC 5. 2)顺反异构酶；(EC 5. 3)分子内异构酶；(EC 5. 4)分子内转移酶（变位酶）；(EC 5. 5)分子内裂解酶。
[0053] 连接酶包括那些：（EC 6. 1)形成碳-氧键；（E