，当值 等于0. 5时，判断为风险不确定。f (X)值越小于0. 5代表风险越低，越高于0. 5代表风险越 尚。
[0111] 实施例6
[0112] 本实施例提供了另一种筛选艾滋病人发生免疫重建炎性综合症的生物样品的系 统，包括：
[0113] 核酸提取装置，所述核酸提取装置用于提取所述生物样品中的核酸样本；
[0114] 实时定量PCR扩增模块，所述实时定量PCR扩增模块中设置有ACTB基因、⑶79A基 因、LCN2基因、FFAR2基因、SLEDl基因、CD22基因、ANKRD22基因、GP9基因、DEFA3基因和 RGCC基因的特异性引物，以便利用所述特异性引物，对所述核酸样本进行实时定量PCR扩 增，得到每个基因的Ct值；以及
[0115] 判断装置，所述判断装置与所述PCR扩增模块相连，基于⑶79A基因、LCN2基因、 FFAR2基因 、SLED 1基因、CD22基因、ANKRD22基因、GP9基因、DEFA3基因和RGCC基因中的 每个基因的实时定量PCR的Ct值与ACTB基因的实时定量PCR的Ct值之间的比值，用于判 断艾滋病人是否发生免疫重建炎性综合症；
[0116] 任选的，对所述核酸样本进行实时定量PCR扩增所使用的试剂和方法并不做特殊 限定，可以采用最常规的的实时定量PCR试剂和实时定量PCR方法。
[0117] 任选的，得到比值之后是用公式计算后得到风险值，然后用于判断艾滋病人是否 发生免疫重建炎性综合症，所述公式为：
[0118] f (X) = -25. 97422122-259. 8669408(CD79A)+13515. 90815(LCN2)+3335. 943735( FFAR2)+7311. 600215(SLEDl)-318. 4503906(CD22)+1692. 184761(ANKRD22)-247. 6957422( GP9)-2322. 113802(DEFA3)-1821. 5596(RGCC)。
[0119] 用风险值f(x)判断艾滋病人是否发生免疫重建炎性综合症的准则为：
[0120] 当f (X)值大于0. 5时，判断为高风险，当f (X)值小于0. 5时判断为低风险，当值 等于0. 5时，判断为风险不确定。f (X)值越小于0. 5代表风险越低，越高于0. 5代表风险越 尚。
【主权项】
1. 一种用来评估艾滋病人发生免疫重建炎性综合症的标志物，其特征在于，至少包括 九个基因：DEFA3基因、S100A8基因、FFAR2基因、LCN2基因、FCRLl基因、SLC25A37基因、 CXCR2P1基因、RGCC基因和GMPR基因。2. 由DEFA3 基因、S100A8 基因、FFAR2 基因、LCN2 基因、FCRLl基因、SLC25A37 基因、 CXCR2P1基因、RGCC基因和GMPR基因形成的基因组合物的用途，其特征在于，在制备用来评 估艾滋病人发生免疫重建炎性综合症的产品中的应用。3. -种筛选艾滋病人发生免疫重建炎性综合症的生物样品的系统，其特征在于，包 括： 核酸序列确定装置，用于对生物样品中提取的核酸样本进行分析，以便确定所述核酸 样本的核酸序列；以及 判断装置，所述判断装置与所述核酸序列确定装置相连，以便基于将测序产生的短序 列和人类基因表达数据库比对，分别得到DEFA3基因、S100A8基因、FFAR2基因、LCN2基因、 FCRLl基因、SLC25A37基因、CXCR2P1基因、RGCC基因和GMPR基因的相对表达量RPKM，用于 判断艾滋病人是否发生免疫重建炎性综合症； 任选的，还包括核酸提取装置，所述核酸提取装置与所述核酸序列确定装置相连，用于 提取所述生物样品中的核酸样本； 任选的，得到相对表达量RPKM之后是用公式计算后得到风险值f(X)，然后用于判断艾 滋病人是否发生免疫重建炎性综合症，所述公式为： f(x) = 40-0. 301926548369785 (DEFA3)+0. 00490277165036895 (S100A8) + 0.560530444576423 (FFAR2)+1.63850558112781 (LCN2)-〇. 142277506530434(FC RLD+0. 410319980880293 (SLC25A37)+0. 190096182111239 (CXCR2P1)-〇. 199495833744442 (RGCC)-O. 370577325294511 (GMPR)。4. 一种用来评估艾滋病人发生免疫重建炎性综合症的标志物，其特征在于，至少包括 九个基因：CD79A基因、LCN2基因、FFAR2基因、SLEDl基因、CD22基因、ANKRD22基因、GP9 基因、DEFA3基因和RGCC基因。5. 由CD79A基因、LCN2 基因、FFAR2 基因、SLEDl基因、CD22 基因、ANKRD22 基因、GP9 基因、DEFA3基因和RGCC基因形成的基因组合物的用途，其特征在于，在制备用来评估艾滋 病人发生免疫重建炎性综合症的产品中的应用。6. -种用来评估艾滋病人发生免疫重建炎性综合症的产品，其特征在于，包括用于 CD79A基因、LCN2 基因、FFAR2 基因、SLEDl基因、CD22 基因、ANKRD22 基因、GP9 基因、DEFA3 基因和RGCC基因的实时定量PCR的试剂。7. 包括用于CD79A基因、LCN2基因、FFAR2基因、SLEDl基因、CD22基因、ANKRD22基 因、GP9基因、DEFA3基因和RGCC基因的实时定量PCR的试剂的用途，其特征在于，用来制备 评估艾滋病人发生免疫重建炎性综合症的产品。8. -种引物组合物，其特征在于，包括扩增⑶79A基因的至少一对引物、扩增LCN2基因 基因的至少一对引物、扩增FFAR2基因的至少一对引物、扩增SLEDl基因的至少一对引物、 扩增⑶22基因的至少一对引物、扩增ANKRD22基因的至少一对引物、扩增GP9基因的至少 一对引物、扩增DEFA3基因的至少一对引物和扩增RGCC基因的至少一对引物。9. 根据权利要求8的引物组合物的用途，其特征在于，用于制备评估艾滋病人发生免 疫重建炎性综合症的试剂盒。10.-种筛选艾滋病人发生免疫重建炎性综合症的生物样品的系统，其特征在于，包 括： 实时定量PCR扩增模块，所述实时定量PCR扩增模块中设置有ACTB基因、CD79A基因、LCN2基因、FFAR2基因、SLEDl基因、CD22基因、ANKRD22基因、GP9基因、DEFA3基因和RGCC 基因的特异性引物，以便利用所述特异性引物，对生物样品中提取的核酸样本进行实时定 量PCR扩增，得到每个基因的Ct值；以及 判断装置，所述判断装置与所述PCR扩增模块相连，基于CD79A基因、LCN2基因、FFAR2 基因、SLED1基因、CD22基因、ANKRD22基因、GP9基因、DEFA3基因和RGCC基因中的每个基 因的实时定量PCR的Ct值与ACTB基因的实时定量PCR的Ct值之间的比值，用于判断艾滋 病人是否发生免疫重建炎性综合症； 任选的，还包括核酸提取装置，所述核酸提取装置与所述核酸序列确定装置相连，用于 提取所述生物样品中的核酸样本； 任选的，得到比值之后是用公式计算后得到风险值f(x)，然后用于判断艾滋病人是否 发生免疫重建炎性综合症，所述公式为： f (X)= -25.97422122-259. 8669408(CD79A)+13515. 90815(LCN2)+3335. 943735(FFAR2 )+7311.600215(SLEDl)-318.4503906(CD22)+1692.184761(ANKRD22)-247.6957422(GP9)-2322.113802 (DEFA3)-1821. 5596(RGCC) 〇
【专利摘要】本发明提供用来评估艾滋病人发生免疫重建炎性综合症的两套标志物，每套标志物中的九个基因组合物的用途，以及用来评估艾滋病人发生免疫重建炎性综合症的产品；本发明还提供了一种引物组合物及其用途，和两种筛选艾滋病人发生免疫重建炎性综合症的生物样品的系统。经实验证明，本发明所列的每套标志物中的特定基因在HIV合并TB感染的病人血液中的PBMC里的表达量的线性组合能显著区分发生和不发生免疫重建炎性综合症的人群，以及判断引起免疫重建炎性综合症的风险大小，因此这些基因的线性组合可作为评价艾滋病人是否发生免疫重建炎性综合症的预警因子，使临床治疗更加个性化。
【IPC分类】C12Q1/68, C12N15/11
【公开号】CN105177130
【申请号】
【发明人】刘映霞, 王珲, 麻锦敏
【申请人】深圳市第三人民医院
【公开日】2015年12月23日
【申请日】2015年8月28日