CD40LG基因rs3092923多态性在检测中国人男性肺结核中的应用
【技术领域】
[0001] 本发明涉及生物医学领域中⑶40LG基因rs3092923多态性在检测中国人男性肺 结核中的应用。
【背景技术】
[0002] 结核病是由结核分支杆菌感染引起的危害全球的传染性疾病，主要通过呼吸道传 播。结核病仍然是由单一病原菌导致死亡人数最多的疾病，并且近年来呈现死灰复燃之势。 据世界卫生组织统计，我国是全球22个结核病高负担国家之一，结核病患者数量居世界第 2位，仅次于印度。已有研宄显示，暴露于结核杆菌，三分之一的人群会被感染，在感染人群 中，不到10%的感染者发展为结核病，提示个体的遗传因素在该病的发生起重要作用。鉴定 肺结核的易感基因有助于预测肺结核发生的个体风险和群体风险，且有助于阐明与此疾病 相关的发病机制。
[0003] ⑶40LG即⑶154,是肿瘤坏死因子配体家族中的一员。D40LG作为体内特异性免 疫反应系统重要的共刺激分子，在机体的细胞免疫和体液免疫反应中起着关键性的作用。 ⑶40LG主要表达于活化的T细胞上，它与B细胞上⑶40相互作用，在B细胞的活化与增 殖分化、生发中心形成、抗体产生及同种类型转换中起关键作用，在T细胞活化以及效应性 细胞因子的分泌过程中也起重要调节作用。目前仅有一篇关于⑶40LG基因rs3092923多 态性位点与非洲冈比亚人群肺结核相关性研宄的报道，但该研宄显示在非洲冈比亚人群中 rs3092923多态性位点与肺结核发生风险不相关。
【发明内容】
[0004] 本发明所要解决的技术问题是如何筛查中国人男性肺结核患者。
[0005] 为解决上述技术问题，本发明首先提供了下述Al)-A6)中的任一种用途：
[0006] A1)检测人基因组中rs3092923的多态性或基因型的物质在制备筛查中国人男性 肺结核患者产品中的应用；
[0007] A2)检测人基因组中rs3092923的多态性或基因型的物质在制备检测中国人男性 肺结核易感性产品中的应用；
[0008] A3)检测人基因组中rs3092923的多态性或基因型的物质在制备检测与中国人男 性肺结核相关的单核苷酸多态性的产品中的应用；
[0009] A4)检测人基因组中rs3092923的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定 与中国人男性肺结核相关的单核苷酸多态性的产品中的应用；
[0010] A5)人基因组中rs3092923的多态性或基因型在制备筛查中国人男性肺结核患者 的产品中的应用；
[0011] A6)人基因组中rs3092923的多态性或基因型在制备检测中国人男性肺结核易感 性产品中的应用。
[0012] rs3092923是人X染色体上的一个二等位多态性的SNP位点，该变异是转换（C/ T，在其互补链上则为G/A)。在女性人群中，所述rs3092923基因型是CC、CT和TT，所述 CC是rs3092923位点为C的纯合型，所述TT是rs3092923位点为T的纯合型，所述CT是 rs3092923位点为C和T的杂合型。在男性人群中，rs3092923基因型是17(-)和CV(-)， IV(-)是男性X染色体rs3092923位点为T的基因型，CV(-)是男性X染色体rs3092923 位点为C的基因型。所述检测人基因组中rs3092923的多态性或基因型具体可通过检测 rs3092923的核苷酸种类确定。
[0013] 上述用途中，所述检测人基因组中rs3092923的多态性或基因型的物质可包括扩 增包括rs3092923在内的基因组DNA片段的PCR引物对和/或单碱基延伸引物。
[0014] 上述用途中，所述IV (_)基因型（或T等位）的个体在中国人男性肺结核患者群 体中的比例分别高于其在对照中的比例。
[0015] 为解决上述技术问题，本发明还提供了含有检测人基因组中rs3092923的多态性 或基因型的物质的产品。
[0016] 本发明所提供的含有检测人基因组中rs3092923的多态性或基因型的物质的产 品，为a)-d)中的任一种：
[0017]a)检测与中国人男性肺结核相关的单核苷酸多态性或基因型的产品；
[0018] b)鉴定或辅助鉴定与中国人男性肺结核相关的单核苷酸多态性或基因型的产 品；
[0019] c)筛查中国人男性肺结核患者产品；
[0020] d)检测中国人男性肺结核易感性产品。
[0021] 上述产品中，所述检测人基因组中rs3092923的多态性或基因型的物质可包括扩 增包括rs3092923在内的基因组DNA片段的PCR引物对和/或单碱基延伸引物。
[0022] 上述产品中，所述IV (_)基因型（或T等位）的个体在中国人男性肺结核患者群 体中的比例分别高于其在对照中的比例。
[0023] 本发明中，所述扩增包括rs3092923在内的基因组DNA片段的PCR引物对可由序 列表中SEQ ID No. 1所示的单链DNA和序列表中SEQ ID No. 2所示的单链DNA组成；所述 单碱基延伸引物的核苷酸序列可如序列表中SEQ ID No. 3所示。
[0024] 实验证明，在中国人男性群体中，rs3092923的T等位在病例组中的比例高于其在 对照组中的比例，具有统计学差异，说明rs3092923的T等位为中国人男性肺结核的风险等 位。在中国人男性群体中，rs3092923位点的两个基因型中，17(-)基因型的个体在病例组 中的比例高于其在对照组中的比例，CV(-)基因型的个体在病例组中的比例低于其在对照 组中的比例。在中国人男性群体中，与携带cy(-)基因型的个体相比，携带iy (-)基因型的 个体肺结核发病风险增加，比值比（Odds ratio,0R)为1. 95，P = 0. 0033,说明r rs3092923 多态性位点与中国人男性肺结核的发生显著关联。
[0025] 在实际应用中，可将检测rs3092923的多态性或基因型的物质与其它物质（如检 测其它的与中国人男性肺结核相关的单核苷酸多态性或基因型的物质）联合在一起制备 筛查中国人男性肺结核患者的产品。
[0026] 其中，检测人基因组中rs3092923的多态性或基因型的物质可为通过下述至少 一种方法确定rs3092923的多态性或基因型所需的试剂和/或仪器：DNA测序、限制性 酶切片段长度多态性、单链构象多态性、变性高效液相色谱、SNP芯片、TaqMan探针技术 和 Sequenom MassArray 技术。其中，利用 Sequenom MassArray 技术确定 rs3092923 的 多态性或基因型所需的试剂和/或仪器包括PCR引物对、基于单碱基延伸反应的延伸 引物、磷酸酶（如奸碱性磷酸酶（shrimp alkaline phosphatase，SAP))、树脂、芯片、 MALDI-TOF(matrix-assisted laser desorption/ionization - time of fligh，基质辅 助激光解吸附电离飞行时间质谱）以及Sequenom MassArray技术所需要的其他试剂和 仪器；利用TaqMan探针技术确定rs3092923的多态性或基因型所需的试剂和/或仪器 包括TaqMan探针、PCR引物对、定量PCR仪和进行基因分型的软件（如7500System SDS softw