专利名称::治疗、诊断或检测与liv-1过量表达相关的癌症的方法
技术领域:
:本发明总体上涉及肿瘤学领域。更具体地,本发明涉及治疗癌症的方法,治疗癌症的组合物以及用于诊断和/或检测癌症的方法和组合物。
背景技术:
:癌症是美国第二的主要死亡原因。虽然"癌症"常被用于描述许多不同类型的癌症,即乳腺癌、前列腺癌、肺癌、结肠癌、胰腺癌,每一种类型的肿瘤在表型水平和遗传水平都是不同的。当一个或多个基因的表达由于突变而变得失调且细胞生长不再受到控制时,就会发生癌症的失调生长特征。通常将基因分为两类癌基因和肺瘤抑制基因。癌基因是其正常功能是只在特定条件下促进细胞生长的基因。当癌基因获得了突变并然后丧失这一控制时,它会在所有条件下都促进生长。然而,已经发现,对于癌症要真正成功来说,癌症还必须需要在胂瘤抑制基因中的突变。肿瘤抑制基因的正常功能是阻止细胞生长。肺瘤抑制基因的例子包括p53、p16、p21和APC,所有这些在正常作用时均阻止细胞免于不受控制地分裂和生长。当肺瘤抑制基因突变或丧失时,细胞生长的刹车也丧失了,使得细胞现在可以不受限制的生长。锌是细胞生长所需要的,并且也是超过300种酶的辅因子。锌参与蛋白、核酸、碳水化合物和脂代谢。锌在基因转录、生长、发育和分化的控制中也起着重要作用(Vallee和Falchuk(1993)Physiol.Rev.73,79-118)。在哺乳动物中,锌缺乏是有害的,会引起发育障碍和严重的代谢疾病(Truong-Tran等,(2001)Biometals14,315-330)。过量的锌也会对细胞有毒(Koh等,(1996)Science272,1013-1016)。锌不能被动地扩散穿过细胞膜。因此,需要特定的锌转运蛋白来将锌转运入细胞。因为锌对细胞生长非常重要,因此锌转运蛋白在维持细胞凋亡和细胞生长之间的细胞平衡中起着重要的作用。细胞平衡的失常能够导致癌症(Taylor等,Biochem.J.(2003)375,51-59)。真核生物具有许多不同的锌转运蛋白。迄今为止,研究得最多的锌转运蛋白属于ZIP或CDF(阳离子扩散家族)转运蛋白家族。ZIP转运蛋白定位于质膜上并作为锌流入转运蛋白,或定位于细胞内膜上并允许它们从这些结构中动员储存。ZIP家族由至少86个成员组成并且可分为4个独立的亚家族ZIP亚家族I(有1个已知的人类成员)、ZIP亚家族II(有3个已知的人类成员)、gufa亚家族(有2个已知的人类成员)、以及LIV-1亚家族(有9个已知的人类成员)(Gaither和Eide(2001),Biometals14,251-270)。LIV-1也被称为Zip6,是锌转运蛋白,其作为这样的基因得到鉴定,即它的表达受到某些乳腺癌细胞的雌激素治疗的刺激(Manning等,(1988),Mol.Cell.Endocrinol.59,205-212)。已显示出LIV隱1属于ZIP(Zrt-、Irt-样蛋白)锌转运蛋白的4皮命名为LZT(ZIP锌转运蛋白LIV-1亚家族)的亚家族(Taylor和Nicholson(2003)Biochim.Biophys.ActaBiomembr.1611,16-30)。这些转运蛋白含有与在代谢中具有已知功能的存在于基质金属蛋白酶的基序类似的潜在金属蛋白酶基序(Itoh和Nagase,(2002),EssaysBiochem.38,21-36)。LIV-1mRNA的表达显示出与乳腺癌至局部淋巴结的扩散相关。LIV-1结构显示出它是富含组氨酸的并且至少具有结合和/或转运Zn2+离子的可能性(Taylor,(2000),ZUBMBLife49:249-253)。脊推动物的原肠胚形成是身体建立中的关键步骤。上皮-间充质细胞转变(EMT)发生在原肠胚形成过程中。EMT是胚胎发育、器官和组织再生以及肺瘤转移的中心事件之一。转录的信号转导物和激活子(STATs)介导了在各种生物过程中应答细胞因子和生长因子的包括细胞增殖、分化和存活的生物学作用。STATs在原肠胚形成、器官发生、伤口愈合和癌演进过程中的EMT中也是重要的。已显示STAT3在斑马鱼原肠胚形成过程中被激活并且其活性对于原肠胚形成活动非常重要。然而,在EMT中STAT作用的分子机制还没有被完全阐述明白。LIV1是STAT3在EMT中的下游靶标,并且其在锌指蛋白Snail(EMT的主调节剂)的核定位中也很重要。然而,迄今为止LIV-1在癌症中的作用还没有被完全阐述明白。需要鉴定调控LIV-1的组合物和方法。本发明涉及这些以及其它重要需求。发明概述在一些方面,本发明提供了包含LIV-1调节剂和一种或多种可药用载体的组合物。在一些实施方案中,LIV-1调节剂是分离的双链RNA(dsRNA)。在一些实施方案中,LIV-1调节剂是包含SEQIDNO:l序列的至少IO个连续核苷酸的分离的寡核苷酸。在一些实施方案中,LIV-1调节剂是结合LIV-1结构域中的表位的抗体,所述LIV-1结构域选自LIV-1的N-端细胞外结构域、在跨膜结构域(TM)2和3之间的LIV-1细胞外结构域、在TM4和5之间的LIV-1细胞外结构域、在TM6和7之间的LIV-1细胞外结构域、以及LIV-1的C-端细胞外结构域。在一些实施方案中,LIV-1调节剂是dsRNA、siRNA、shRNA或反义寡核苷酸。在一些方面,本发明提供了在有需要的患者中治疗癌症或癌症症状的方法,包括给患者施与治疗有效量的LIV-1调节剂。在一些方面,本发明提供了在患者中调节LIV-1相关生物学活性的方法,包括给患者施与调节LIV-1相关生物学活性有效量的LIV-1调节剂。在一些方面,本发明提供了鉴定对LIV-1治疗敏感的患者的方法,包括检测在患者样本中存在或不存在LIV-1的差异表达,如果患者是LIV-1治疗的候选者则给患者施与治疗有效量的LIV-1调节剂;如果患者不是LIV-1治疗的候选者则给患者施与常规的癌症治疗。在一些方面,本发明提供了抑制表达LIV-1的癌细胞生长的方法,包括将抑制细胞生长有效量的LIV-1调节剂与细胞接触。在一些方面,本发明提供了在表达LIV-1的细胞群中抑制癌细胞表型的方法,包括给细胞群施与抑制癌细胞表型有效量的LIV-1调节剂。在一些方面,本发明提供了在样本中检测一种或多种表达LIV-1的癌细胞的方法,包括将样本与包含和显像剂连接的LIV-1调节剂的组合物接触并检测显像剂在样本中的定位。在一些方面,本发明提供了抑制两个或多个细胞(其中至少一个细胞表达LIV-1)相互作用的方法,包括给包含细胞的样本施与有效量的LIV-1调节剂。在一些方面,本发明提供了在CHO或骨髓瘤细胞中表达抗LIV-1抗体的方法。在一些实施方案中,抗LIV-1抗体抑制一种或多种LIV-1相关生物学活性。在一些实施方案中,该方法包括在CHO或骨髓瘤细胞中表达编码抗LIV-1抗体的核酸。在一些方面,本发明提供了鉴定癌抑制剂的方法,包括将表达LIV-1的细胞与候选化合物和LIV-1配体接触,并检测LIV-1相关锌转运活性是否被抑制。在一些实施方案中,LIV-1相关锌转运活性的抑制是癌抑制剂的指标。在一些方面,本发明提供了鉴定癌抑制剂的方法,包括将表达LIV-1的细胞与候选化合物和LIV-1配体接触,并检测LIV-1下游标志物是否被抑制。在一些实施方案中,下游标志物的抑制是癌抑制剂的指标。在一些方面,本发明提供了确定患者对LIV-1调节剂敏感性的方法,包括在所述患者的癌样本中检测LIV-1差异表达的证据。在一些实施方案中,LIV-1差异表达的证据是患者对LIV-1调节剂敏感性的指标。在一些方面,本发明提供了从包含LIV-1蛋白的样本中纯化LIV-1蛋白的方法,包括提供包含结合至固体支持物的LIV-1抗体的亲和基质,将样本与亲和基质接触以形成亲和基质-LIV-l蛋白复合体;从样本剩^^物中分离亲和基质-LIV-l蛋白复合体;以及从亲和基质释放LIV-1蛋白。在一些方面,本发明提供了将细胞毒剂或诊断剂递送至一个或多个表达LIV-1的细胞的方法,该方法包括提供与LIV-1抗体或其片段缀合的细胞毒剂或诊断剂,并且将细胞暴露于抗体-剂或片段-剂缀合物。在一些方面,本发明提供了确定癌症患者预后的方法,包括确定患者样本中LIV-1-S对LIV-1的比值。在一些实施方案中,应用LIV-1-S对LIV-1的比值来确定癌症患者的预后。在一些方面,本发明提供了确定癌症患者预后的方法,包括在患者样本中检测结合至细胞质膜的LIV-1的存在或不存在。在一些实施方案中,患者样本中结合至细胞质膜的LIV-1的不存在是患者良好预后的指标。在一些方面,本发明提供了包含锌转运蛋白调节剂和一种或多种可药用载体的组合物。在一些实施方案中,锌转运蛋白是分离的双链RNA(dsRNA)。在一些实施方案中,锌转运蛋白是包含选自SEQIDNO:383-385的序列的至少IO个连续核苷酸的分离的寡核苷酸。在一些实施方案中,锌转运蛋白是结合锌转运蛋白结构域中的表位的抗体,所述锌转运蛋白结构域选自N-端细胞外结构域、在跨膜结构域(TM)2和3之间的细胞外结构域、在TM4和5之间的细胞外结构域、在TM6和7之间的细胞外结构域、以及C-端细胞外结构域。在一些实施方案中,锌转运蛋白是SLC39A10、SLC39A11或SLC39A13。在一些方面,本发明提供了在有需要的患者中治疗癌症或癌症症状的方法,包括给患者施与治疗有效量的锌转运蛋白调节剂。在一些方面,本发明提供了在患者中调节锌转运蛋白相关生物学活性的方法,包括给患者施与调节锌转运蛋白相关生物学活性有效量的锌转运蛋白调节剂。在一些方面,本发明提供了抑制表达锌转运蛋白的癌细胞生长的方法,包括将抑制细胞生长有效量的锌转运蛋白调节剂与细胞接触。在一些方面,本发明提供了在样本中检测一种或多种表达锌转运蛋白的癌细胞的方法,包括将样本与包含和显像剂连接的锌转运蛋白调节剂的组合物接触并检测显像剂在样本中的定位。在一些方面,本发明提供了抑制两个或多个细胞(其中至少一个细胞表达锌转运蛋白)相互作用的方法,包括给包含细胞的样本施与有效量的锌转运蛋白调节剂。在一些方面,本发明提供了鉴定癌抑制剂的方法,癌症的特征在于与对照相比锌转运蛋白的过量表达。在一些实施方案中,该方法包括将表达锌转运蛋白的细胞与候选化合物和锌转运蛋白配体接触,并检测锌转运活性是否被抑制。在一些实施方案中,锌转运活性的抑制是癌抑制剂的指标。在一些方面,本发明提供了鉴定癌抑制剂的方法,癌症的特征在于与对照相比锌转运蛋白的过量表达。在一些实施方案中,该方法包括将表达锌转运蛋白的细胞与候选化合物和锌转运蛋白配体接触,并检测锌转运蛋白的下游标志物是否被抑制。在一些实施方案中,下游标志物的抑制是癌抑制剂的指标。在一些方面,本发明提供了确定患者对锌转运蛋白调节剂敏感性的方法,包括在患者的癌样本中检测锌转运蛋白差异表达的证据。在一些实施方案中,锌转运蛋白差异表达的证据是患者对锌转运蛋白调节剂敏感性的指标。在一些方面,本发明提供了从包含一种或多种锌转运蛋白的样本中纯化锌转运蛋白的方法,包括提供包含结合至固体支持物的锌转运蛋白抗体的亲和基质,将样本与亲和基质接触以形成亲和基质-锌转运蛋白复合体;从样本剩余物中分离亲和基质-锌转运蛋白复合体;以及从亲和基质释放锌转运蛋白。在一些方面,本发明提供了将细胞毒剂或诊断剂递送至一个或多个表达锌转运蛋白的细胞的方法,该方法包括提供缀合至锌转运蛋白抗体或其片段的细胞毒剂或诊断剂,并且将细胞暴露于抗体-剂或片段-剂缀合物。本发明的这些和其它方面将在以下的发明详述中阐述。附图简述图1描述几个癌样本中LIV-1蛋白的表达。左图描述ER阳性、ER阴性和转移性乳腺癌。在右图中的癌组织中可看到质膜染色。右下图描述在非透化细胞上的共焦覆盖图。图2描述通过LIV-1特异的siRNAs敲低(knockdown)LIV-1蛋白。图3描述在癌细胞中通过LIV-1特异的siRNAs抑制癌细胞生长、增殖和存活。图4描述在癌细胞中通过LIV-1特异的siRNAs敲低LIV-1诱导的胱天蛋白酶活化。图5描述了在正常细胞中LIV-1特异的siRNAs对增殖、胱天蛋白酶活性和LIV-1mRNA水平的影响。图6描述了在癌细胞中通过LIV-1特异的siRNAs降低癌细胞中细胞周期蛋白Dl水平。图7描述了通过LIV-1特异的抗体降低细胞质锌水平。图8描述了正常和癌细胞中的LIV-1表达。图9描述了在MCF7细胞中LIV-1敲低的影响,包括对细胞增殖、软琼脂生长、蛋白质表达和存活的影响。图10描述了通过LIV-1特异的siRNAs降低细胞质锌水平。图ll描述了在用LIV-1特异性抗体处理后细胞周期蛋白Dl水平的降低。图12描述了应用LIV-1分析的癌性和正常组织的孩史阵列分析(affyU133plus2芯片)图示。沿水平轴上布置正常和癌性组织类型。癌性组织用"c"标记,例如,、_乳腺—管"表示乳腺癌组织样本,且正常组织类似地用"n"表示。如果知道的话,还对组织类型进一步标记有关组织的类型和亚型。例如,"c—乳腺—管"是来自位于乳腺管中的乳腺癌的癌性组织。如果在外科切除期间不清楚或不知道亚型,则标签记为"ns"表示"非确切的"。在垂直轴上的每一个点表示来自单个患者的组织样本,以及每一点在垂直轴上的高度(基于1og2)代表探针组(probeset)的相对表达水平。实心圆代表表达水平在线性检测范围内的样本。空心圆代表在其中基因在探针组的检测极限以下的样本中基因表达的上限。空的方块代表在其中探针组被饱和的样本中基因表达的下限。(简而言之,在进行分析之前,通过在大量、不同的样本组中分析组成探针组的探针的表现校正探针组。这一校正确定每一探针的相对敏感性、以及强度范围,在所述强度范围内探针组的反应在探针之间是线性的。在这一范围以下的强度#:称为"未检测到"而在所述范围以上的强度被称为"饱和"。由于样本之间杂交和标记效率的不同,每一芯片均在应用校正后被规一化。这使得按照基因表达水平的范围上限和下限在样本与样本之间有些不同。)图13描述了用SLC39A10分析的癌性和正常组织的微阵列分析(affyU133plus2芯片)图示。信息如以上图12所提供。图14描述了用SLC39A11分析的癌性和正常组织的孩吏阵列分析(affyU133plus2芯片)图示。信息如以上图12所提供。图15描述了用SLC39A13分析的癌性和正常组织的孩i阵列分析(affyU133plus2芯片)图示。信息如以上图12所提供。发明详述本发明提供了用于癌症治疗、诊断和成像,具体而言用于LIV-1相关癌症的治疗、i貪断和成《象的方法和组合物。本发明的发明人尤其发现LIV-1在数种癌症,包括乳腺癌中过量表达,并且在正常组织中具有受限的表达。抑制LIV-1则抑制了癌细胞的增殖,但不抑制LIV-l-阳性的"正常"细胞。此外,已发现LIV-1的抑制调节细胞质锌水平以及下游标志物的水平,所述下游标志物例如包括细胞周期蛋白D1和MT1-MMP。在本申请中提供了本发明的这些和其它方面。定义在这一文件中使用了许多定义。多数词语具有对本领域技术人员来说是这些词语本身的意思。在下面或在这一文件中其它地方特别定义的词语具有在本发明的上下文中作为整体所提供的以及如本领域技术人员通常理解的意思。除非特别标明,本发明的实施将应用本领域内常见的化学、生物化学、分子生物学、免疫学和药学方法。在文献中充分地解释了此类技术。例如,参见Remington'sPharmaceuticalSciences,第18版(Easton,Pennsylvania:MackPublishingCompany,1990);MethodsInEnzymology(S.Colowick和N.Kaplan,编辑,AcademicPress,Inc.);以及HandbookofExperimentalImmunology,I-IV巻(D.M.Weir和CC.Blackwell,编辑,1986,BlackwellScientificPublications)以及Sambrook等,MolecularCloning:ALaboratoryManual(第二版,1989)。本文所使用的单数形式"一个"、"一种"和"该"包括复数关系,除非文中另外清楚地标明。因此,例如论及"一种抗体,,时包括两种或以上此类抗体的混合物。本文所使用的术语"约"是指值的+/-20%、+/-10%、或+/-5%。本文所使用的术语"锌转运蛋白"或"锌运载蛋白"是指显示出锌转运蛋白结构特征的生物分子。在一些实施方案中,锌转运蛋白包括LIV-l、SLC39A13、SLC39A11和SLC39A10。本文所使用的术语"LIV-r也被称为Zip6,是指属于被称为LZT的ZIP锌转运蛋白的亚家族的锌转运蛋白。在GeneCard中,LIV-1也被称为SLC39A6(溶质载体蛋白家族39(锌转运蛋白),成员6)。LIV-1的核苷酸序列如SEQIDNO:l所示,且LIV-1的氨基酸序列如SEQIDNO:2。尽管为了简洁的目的,本发明主要根据LIV-1作为例证,但应该理解涉及LIV-1的定义和实施方案也可用于本文公开的其它锌转运蛋白。本文所使用的术语"LIV-1-8"是指与LIV-1相比至少缺乏氨基端部分的LIV-1变体。LIV-1-8的多肽序列如SEQIDNO:365所示。本文所使用的术语"多肽"和"蛋白"可以互换使用,是指任何长度的氨基酸聚合体形式,其可以包括编码的或非编码的氨基酸、化学或生物化学修饰或衍生的氨基酸、以及具有经修饰的肽骨架的多肽。该术语包括融合蛋白,包括但不限于与异源氨基#列融合的融合蛋白、与同源或异源的具有或没有N端曱硫氨酸残基的前导序列融合;免疫学标记的蛋白等。术语"个体"、"受试者"、"宿主"和"患者,,可互换使用,是指对于其来说诊断、治疗或疗法是所期望的任何受试者,尤其是人类。其它受试者可以包括牛、狗、猫、豚鼠、兔子、大鼠、小鼠、马等。在一些优选的实施方案中,受试者是人类。本文所使用的术语"癌症"是指原发或转移癌。术语"癌细胞,,是指被转化的细胞。这些细胞可以从患有癌症的患者中分离,或者是在体外经转化变为癌性的细胞。癌细胞可以从许多种类的样本中取得,所述样本包括任何组织或细胞培养系。在一些实施方案中,癌细胞是过度增生细胞、肿瘤细胞或赘生物。在一些实施方案中,癌细胞从乳腺癌、皮肤癌、食管癌、肝癌、胰腺癌、前列腺癌、子宫癌、子宫颈癌、肺癌、膀胱癌、卵巢癌、多发性骨髓瘤和黑素瘤中分离。在一些实施方案中,癌细胞从公众可获得的已建立的细胞系中取得。在一些实施方案中,癌细胞从业已存在的患者样本或从包含癌细胞的文库中分离。在一些实施方案中,分离癌细胞并然后将其移植至不同的宿主中,例如异种移植。在一些实施方案中,在SCED小鼠模型中移植并应用癌细胞。在一些实施方案中,癌是乳腺癌。本文所使用的术语"经转化的"是其后代能稳定遗传的在细胞特性上的任何转变。在一些实施方案中,"经转化的"是指正常细胞至癌性细胞的转变,例如,能够引起肿瘤的改变。在一些实施方案中,经转化的细胞是永生化的。转化可以通过许多因素引起,包括在缺乏受体磷酸化的情况下的受体过量表达、病毒感染、在癌基因和/或肿瘤抑制基因上的突变、和/或任何改变细胞生长和/或永生化特性的其它技术。"癌性表型"通常是指作为癌性细胞特性的任意的多种生物学现象,其中的现象在不同类型的癌症中可以不同。癌性表型通常通过在例如细胞生长或增殖(例如,不受控制的生长或增殖)、细胞周期调控、细胞迁移、细胞-细胞相互作用或转移等中的反常来鉴定。本文所使用的术语"转移"是指已传播至远离癌的起源,例如远离原发癌的位置处的癌症。转移的位置包括但不限于骨、淋巴结、肺、肝和脑。本文所使用的术语"血管发生"是指患者中血管的发生。本文所使用的术语"临床端点(clinicalendpoint)"是指癌症的可测量事件指标。临床端点包括但不限于第一次转移的时间、随后转移的时间、转移瘤的大小和/或数目、肿瘤的大小和/或数目、肿瘤的位置、肿瘤的侵袭、生活质量、疼痛等。本领域技术人员具有确定和测量临床端点的能力。测量临床端点的方法对于本领域技术人员来说是已知的。本文所使用的术语"样本"是指来自患者的生物学材料。通过本发明测定的样本不限于任何特殊的类型。作为非限制性实例,样本包括单个细胞、多个细胞、组织、肿瘤、生物学液体、生物分子、或任何前述的上清液或提取物。样本的例子包括为活组织检查取出的组织、在切除术期间取出的组织、血液、尿、淋巴组织、淋巴液、脑脊髓液、粘液和粪便样本。所使用的样本会依据分析方式、检测方法和待检测肿瘤、组织、细胞或提取物的性质而不同。制备样本的方法在本领域是熟知的,并且可以很容易的修改以获得适合于所应用的方法的样本。本文所使用的术语"生物分子"包括但不限于多肽、核酸和糖类。本文所用的术语"调节"是指在细胞内部、外部或表面的基因、蛋白或任何分子的质或量上的改变。改变可以是分子表达或水平上的升高或降低。术语"调节"也包括改变生物学功能/活性的质或量,所述生物学功能/活性包括但不限于细胞增殖、生长、粘附、细胞存活、凋亡、细胞内信号传导、细胞-细胞间信号传导等。本文所使用的术语"调节剂,,是指调节一种或多种与癌症相关的生理学或生物化学事件的组分。在一些实施方案中,调节剂抑制一种或多种与癌症相关的生物学活性。在一些实施方案中,调节剂是小分子、抗体、模拟物、诱斜(decoy)或寡核苷酸。在一些实施方案中,调节剂通过阻断配体结合或通过竟争配体结合位点起作用。在一些实施方案中,调节剂独立于配体结合之外起作用。在一些实施方案中,调节剂不竟争配体结合位点。在一些实施方案中,调节剂阻断参与癌症的基因产物的表达。在一些实施方案中,调节剂阻断两个或更多个参与癌症的生物分子的物理相互作用。在一些实施方案中,本发明的调节剂抑制一种或多种LIV-1生物学活性,所述LIV-1生物学活性选自癌细胞生长、肿瘤形成、癌细胞增殖、癌细胞存活、癌细胞转移、细胞迁移、血管生成、LIV-1信号传导、LIV-1介导的细胞-细胞粘附、细胞-细胞相互作用、LIV-1介导的细胞-细胞膜相互作用、LIV-1介导的细胞-细胞外基质相互作用、整联蛋白介导的活性、LIV-1表面表达、LIV-1介导的细胞-细胞外基质降解、EGFR磷酸化和Snail核定位。在一些实施方案中,LIV-1调节剂抑制LIV-1表达。"基因产物"是指由基因表达或产生的生物聚合物产物。基因产物例如可以是未剪接的RNA、mRNA、剪接变体mRNA、多肽、翻译后修饰的多肽、剪接变体多肽等。这一术语还包括应用RNA基因产物作为模板产生的生物聚合物产物(即,RNA的cDNA)。基因产物可以酶学地、重组地、化学地或在对于其来说该基因是天然存在的细胞中制得。在一些实施方案中,如果基因产物是蛋白质的,其表现出生物学活性。在一些实施方案中,如果基因产物是核酸,其可以翻译为表现出生物学活性的蛋白质基因产物。本文所使用的"LIV-1活性的调节"是指LIV-1活性的升高或降低,其例如可以是物质与LIV-1多核苷酸或多肽的相互作用、LIV-1转录和/或翻译的抑制(例如,通过反义或siRNA与LIV-1基因或LIV-1转录子相互作用、通过促进LIV-1表达的转录因子的调控)等的结果。例如,生物活性的调节是指生物学活性的升高或生物学活性的降低。本发明对导致LIV-1活性降低的LIV-1活性调节特别感兴趣。可以通过以下方法评估LIV-1活性,所述方法包括但不限于:测试锌转运活性、评估LIV-1多肽水平、或通过评估LIV-1转录水平。LIV-1活性的比较也可以通过测量LIV-1下游标志物的水平、测量对LIV-1信号传导的抑制、测量对LIV-1介导的细胞粘附的抑制、测量对LIV-1介导的癌细胞凋亡的活化、测量癌细胞生长抑制、测量肿瘤形成的抑制、测量细胞周期蛋白产生的抑制、测量对产生纤连蛋白的抑制和测量对锌转运的抑制来完成。本文所使用的术语"抑制"是指活性或量的减少、降低、失活或下调。例如,在本发明的上下文中,Liv-l调节剂可以抑制癌细胞生长、肿瘤形成、癌细胞增殖、癌细胞存活、癌细胞转移、细胞迁移、血管生成、LIV-1信号传导、LIV-l介导的细胞-细胞粘附、细胞-细胞相互作用、LIV-1介导的细胞-细胞膜相互作用、LIV-l介导的细胞-细胞外基质相互作用、整联蛋白介导的活性、LIV-1表面表达、LIV-l介导的细胞-细胞外基质降解、Snail核定位、以及LIV-1表达中的一种或多种。LIV-1调节剂也可以抑制细胞周期蛋白Dl、纤连蛋白、RhoB、MT1-MMP、FGF、CDK4、VEGF、EGFR、EGFR磷酸化、在SNAIL途径中的一个或多个基因。LIV-1调节剂也可以抑制锌转运并且在一些实施方案中能降低细胞质锌水平。与对照相比,抑制可以是至少25%、至少50%、至少是60%、至少70%、至少75%、至少是80%、至少卯%、至少95%、至少是97%、至少98%、至少是99%、或100%。本文所使用的术语"在癌细胞中差异表达,,和"在癌细胞中差异表达的多核普酸,,在本文中可以互相使用,是指代表或对应于基因的多核苷酸,当与非癌性的相同细胞类型的细胞相比较时,所述基因在癌性细胞中差异表达,例如,发现mRNA在至少约25%、至少约50%至约75%、至少约90%、至少约1.5倍、至少约2倍、至少约5倍、至少约10倍、至少约50倍或更多不同(例如,更高或更低)的水平上。例如如果使用原位杂交或其它在组织上的细胞类型之间允许一定程度的区别的分析方法,可以在组织中进行比较。比较也可以或备选地在从它们的组织来源中分离的细胞之间进行,或在一个原位细胞和第二个从它的组织来源中分离的细胞之间进行。在一些实施方案中,与正常细胞相比较,基因在癌细胞中上调。如果癌症的至少一个症状得到减轻、终止、变慢或防止,则"抑制"了LIV-1相关癌症。在本文中,如果癌症的复发或转移得到减轻、变慢、延緩或防止,则也"抑制"了LIV-1相关癌症。本文所使用的词组"抑制LIV-1介导的细胞粘附,,是指在LIV-1抑制剂存在的情况下,细胞-细胞之间粘附的抑制或消失,其中至少一个细胞差异表达LIV-1。在这一上下文中,相对于不存在LIV-1抑制剂时LIV-1介导的细胞粘附,通过LIV-1抑制剂能够使LIV-1介导的细胞粘附降低至少25%、至少50%、至少75%、至少85%、至少90%、至少95%、直至100%。LIV-1介导的细胞粘附的比较可以通过测量完成,例如,通过标记感兴趣的细胞、将它们与黏附至基质的未标记细胞群孵育、以及洗涤以从非勦附细胞群中分离黏附细胞。在这一方法中,通过测量保留在基质上的标记的量确定细胞粘附。分析系统的实例包括但不限于用荧光探针标记并在荧光板读数器上或通过流式细胞术测量焚光,所述荧光探针诸如钾荧光素AM,CFMDA(二乙酸5-氯甲基焚光素)、5(6)-CFDA-SE二乙酸5-(和-6)-羧基荧光素,琥珀酰亚胺酯l。在本文中所使用的词组"增加癌细胞凋亡,,是指在存在LIV-1抑制剂的情况下增加差异表达LIV-1的癌细胞的凋亡。在这一上下文中,相对于不存在LIV-1抑制剂时的癌细胞凋亡,通过LIV-1抑制剂可以使癌细胞凋亡增加至少25%、至少50%、至少75%、至少85%、至少卯%、至少95%、直至100%。癌细胞凋亡的比较例如可以通过测量DNA片段化、胱天蛋白酶活性、线粒体膜电位的丧失、活性氧类(ROS)增加的产生、细胞内酸化、染色质凝聚、细胞表面的磷脂酰丝氨酸水平以及增加的细胞膜通透性来完成。DNA片段化例如可以用TUNEL测试法(末端脱氧核苷酸转移酶dUTP缺口末端标记)来测量。该测试法的商业版本可广泛地获得,例如,APO-BrdUTMTUNEL测试试剂盒(Invitrogen)、APO-DIRECTTM试剂盒(BDBiosciencesPharmingen)和ApoAlertTMDNA片段化测试试剂盒(Clontech,TakaraBioCompany)。胱天蛋白酶活性可以通过对特定胱天蛋白酶特异的荧光、生色和发光底物来监测。至少对于胱天蛋白酶l、2、3、6、7、8和9可获得商业化测试试剂盒。(例fe口,参见Invitrogen、Chemicon、CalBiochem、BioSourceInternational、Biovision)。线粒体膜电位的丧失可以用在健康活性的线粒体中差异聚集的荧光染料来测量。一个非限制性实例是Invitrogen的MitoTrackerRed系统。活性氧类(ROS)的产生可以用荧光染料来测量,所述染料例如包括H2DCFDA(Invitrogen)。细胞内酸化可以用荧光或生色染料来测量。染色质凝聚可以用荧光染料来测量,所述荧光染料例如包括Hoechst33342。磷脂酰丝氨酸(PS)可以在细胞表面测量。例如,膜联蛋白V具有对PS的高亲和性。许多商业可获得的测试法适合于监测经标记的膜联蛋白v与细胞表面的结合。细胞膜通透性可以用染料来测量,所述染料诸如可以进入凋亡细胞但不能进入坏死细胞的荧光染料YO-PRO-l(Invitrogen)。本文所使用的词组"抑制癌细胞生长,,是指在存在LIV-1抑制剂的情况下癌细胞生长的抑制或消失,其中细胞差异表达LIV-1。在这一上下文中,相对于不存在LIV-1抑制剂时的癌细胞生长,通过LIV-1抑制剂可以使癌细胞生长降低至少25%、至少50%、至少75%、至少85%、至少卯%、至少95%、直至100%。癌细月包生长的比较例如可以应用MTT测试法(例如,Vybrant⑧MTT细胞增殖测试试剂盒(Invitrogen))、BrdU掺入(例如,Absolute-SSBIP测试法(Invitrogen))、测量细胞内ATP水平(例如应用ATPLiteTM-M,l,OOO测试试剂盒(PerkinElmer)或ATP细月包活力测试试剂盒(BioVision))、DiOc18测试法(膜可渗透染料(Invitrogen))、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶活性测试法(例如,Vibrant细胞毒测试法(Invitrogen))或测量细胞LDH活性来完成。本文所使用的词组"抑制肿瘤形成"是指在存在LIV-1抑制剂的情况下肿瘤形成的抑制或消失,其中肿瘤包含差异表达LIV-1的细胞。在这一上下文中,相对于不存在LIV-1抑制剂时的肿瘤形成,通过LIV-1抑制剂可以使肿瘤形成减少至少25%、至少50%、至少75%、至少85%、至少卯%、至少95%、直至100%。肿瘤形成的比较例如可以应用基于细胞的测试法(例如在软琼脂上的集落形成)、通常依赖于将感兴趣的细胞注射至动物(例如,无胸腺小鼠或大鼠、受辐射的小鼠或大鼠;接种至免疫特惠位点(immunologicallyprivilegedsites),诸如脑、颊嚢或目艮;同系动物接种)并在规定的时间段后监测肿块大小的体内肿瘤形成模型来完成。本文所使用的词组"抑制细胞周期蛋白Dl"是指LIV-1介导的细胞周期蛋白产生的抑制或消失。在这一上下文中,相对于不存在LIV-1抑制剂时的LIV-1介导的细胞周期蛋白产生,通过抑制剂可以使LIV-1介导的细胞周期蛋白产生降低至少25%、至少50%、至少75%、至少85%、至少卯%、至少95%、直至100%。细胞周期蛋白产生的比较可以通过以下方法来完成例如通过RT-PCR或RNA印迹法测量细胞周期蛋白mRNA水平;通过免疫印迹、免疫沉淀或ELISA测量细胞周期蛋白多肽水平;或应用功能测试法,包括例如应用耙向CDK、p21WAFl、p27KEP-l的抗体的免疫共沉淀测试法以测量与细胞周期蛋白调节剂(诸如细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK,s))复合的细胞周期蛋白水平;以及测量通过CDK,s的细胞周期蛋白的磷酸化,可以通过放射性标记和免疫沉淀分析或基于FRET的方法,例如CDK2/细胞周期蛋白A测试试剂盒(MolecularDevices)来测试。本文所使用的词组"抑制EGFR磷酸化"是指LIV-1介导的EGFR磷酸化的抑制或消失。在这一上下文中,相对于不存在LIV-1抑制剂时的LIV-l介导的EGFR磷酸化,通过抑制剂可以使LIV-1介导的EGFR磷酸化降低至少25%、至少50%、至少75%、至少85%、至少90%、至少95%、直至100%。EGFR磷酸化的比较可以通过本领域技术人员已知的磷酸化测试法来确定。本文所使用的词组"抑制肿瘤细胞存活"是指对表达LIV-1的癌细胞存活的抑制。在一些实施方案中,该术语是指实现表达LIV-1的癌细胞的凋亡。在这一上下文中,相对于不存在LIV-1抑制剂时的癌细胞存活和/或在正常细胞中,通过抑制剂可以使表达LIV-1的癌细胞存活降低至少25%、至少50%、至少75%、至少85%、至少90%、至少95%、直至100%。本文所使用的词組"抑制整联蛋白介导的活性"是指对与整联蛋白相关的活性的抑制或消失。整联蛋白介导的活性包括但不限于细胞粘附、趋化性、增殖、存活和小管形成。在这一上下文中,相对于不存在LIV-1抑制剂时LIV-1介导的整联蛋白活性,通过抑制剂可以使LIV-1介导的整联蛋白活性降低至少25%、至少50%、至少75%、至少85%、至少90%、至少95%、直至100%。本文所使用的词组"抑制纤连蛋白"是指对LIV-1介导的产生纤连蛋白的抑制或消失。在这一上下文中,相对于不存在LIV-1抑制剂时LIV-1介导的纤连蛋白产生,通过抑制剂可以使LIV-1介导的纤连蛋白产生降低至少25%、至少50%、至少75%、至少85%、至少90%、至少95%、直至100%。纤连蛋白产生的比较可以通过以下方法完成例如通过RT-PCR或RNA印迹法测量纤连蛋白mRNA水平;通过免疫印迹、免疫沉淀或ELISA(例如,纤连蛋白ELISA试剂盒(AMERICANDIAGNOSTICA));应用功能测试法以测量与纤连蛋白包被的底物的细胞粘附。例如,参见InnoCyteTMECM细胞粘附测试法,纤连蛋白(Calbiochem)和QCMTM-FN[定量细胞迁移测试法-纤连蛋白(CHEMICON)I。本文所使用的词组"抑制锌转运"是指对LIV-1介导的锌转运的抑制或消失。在这一上下文中,相对于不存在LIV-1抑制剂时LIV-1介导的锌转运,通过抑制剂可以使LIV-1介导的锌转运降低至少25%、至少50%、至少75%、至少85%、至少90%、至少95%、直至100%。在一些实施方案中,LIV-1抑制剂降低胞质锌水平。锌转运的比较和锌水平的确定可以应用本领域技术人员已知的方法来完成,例如包括测量到细胞或嚢泡内的65Zn摄入(参见,Kambe等,(2002)J.Biol.Chem.,277:19049-l卯55);或测量细胞通透的荧光锌指示剂Newport绿二乙酸盐(MolecularProbes)的摄入。体液和细胞条件介质中的锌库例如可以按照Zalewski等阐述的讨论来测量(BioTechniques,2006,第40巻,第4期第509-520页)。本文所使用的词组"抑制UV-1信号传导"是指降低LIV-1对包括LIV-1的细胞信号级联下游成员的影响。包括LIV-1的细胞信号级联尤其包括SNAIL途径。在一些实施方案中,对LIV-1信号传导的抑制上调SNAIL途径中的一个或多个上皮标记物。在一些实施方案中,对LIV-1信号传导的抑制下调SNAIL途径中的一个或多个间充质标记物。在一些实施方案中,上皮标记物和/或间充质标记物参与运动性和细胞存活。在一些实施方案中,对LIV-1信号传导的调节调节了Stat3相关信号级联。在一些实施方案中,Stat3相关信号级联的元件与SNAIL相关信号级联的元件不同。对LIV-1信号传导的抑制可以通过测量细另包信号传导途径下游成员的多肽或多核苷酸水平来确定。本领域技术人员具备测量LIV-1多肽和/或多核苷酸水平能力。本领域技术人员也能够测量LIV-1下游标志物的水平。本文所使用的词组"抑制细胞-细胞相互作用"是指减少或消除两个或多个表达LIV-1的细胞之间的相互作用。在一些实施方案中,细胞之间的相互作用导致细胞信号。细胞-细胞相互作用可以通过本领域技术人员已知的多种方法检测,所述方法包括但不限于观察共培养的、例如用不同焚光膜染料(包括PKH26和PKH67(Sigma))标记的预标记细胞之间的膜交换。本文所使用的"LIV-1下游标志物"是指与其在正常或健康组织中的表达水平相比较,在癌组织或癌细胞中表现出改变的表达水平的基因或活性,或是在存在LIV-1调节剂的情况下改变的特性(例如,胞质锌水平)。在一些实施方案中,当LIV-1受到本发明的LIV-1调节剂扰动时,下游标志物表现出改变的表达水平。LIV-1下游标志物包括但不限于细胞周期蛋白Dl、纤连蛋白、RhoB、MT1-MMP、FGF、CDK4、VEGF、EGFR、SNAIL途径中的一个或多个基因、E-钙粘着蛋白、VE-钙粘着蛋白、Muc-l、水闸蛋白(claudin)、封闭蛋白(occludin)、桥粒斑蛋白、胱天蛋白酶、p21、p53、BID(bcl-相互作用死亡激动剂)、DFF40(DNA片段化因子)以及细胞角蛋白。如上面所讨论的那样,在一些实施方案中,LIV-1下游标志物是Stat3途径的基因。本文所使用的术语"上调,,是指活性或量的增加、激活或刺激。例如,在本发明的上下文中,Liv-l调节剂可以增加E-钙粘着蛋白、VE-钙粘着蛋白、Muc-l、水闸蛋白、封闭蛋白、桥粒斑蛋白、胱天蛋白酶、p21、p53、BID(bd-相互作用死亡激动剂)、DFF40(DNA片段化因子)以及细胞角蛋白之中的一种或多种。与对照相比,上调可以是至少25%、至少50%、至少75%、至少100%、至少150%、至少200%、至少250%、至少400%、或至少500%。本文所使用的术语"N-端"是指蛋白质的最前的IO个氨基酸。本文所使用的术语"C-端"是指蛋白质的最后的IO个氨基酸。本文所使用的术语"结构域,,是指有对生物分子已知或猜想的功能有贡献的生物分子的结构部分。结构域可以与其区域或部分共延伸(co-extensive),以及除了特定区域的全部或部分外也可以还包含与特定区域不同的生物分子的部分。本文所使用的术语"细胞外结构域"是指分子在细胞外部或外边的部分。在本发明的上下文中,N-端细胞外结构域是指存在于紧接在第一个跨膜结构域之前的分子N-端的细胞外结构域。在两个跨膜(TM)结构域之间,例如在TM2和3之间的细胞外结构域的上下文中,细胞外结构域是指在LIV-1第二和第三跨膜结构域之间的在细胞膜外的LIV-1的部分。本文所使用的术语"配体结合结构域"是指至少保留了一种相应LIV-1天然序列定性结合活性的受体的任何部分或区域。术语"区域,,是指生物分子一级结构的物理连续部分。在蛋白质的情况下,区域是通过蛋白质氨基酸序列的连续部分来定义的,在一些实施方案中,"区域"与生物分子的功能相关。本文所使用的术语"片段"是指生物分子一级结构的物理连续部分。在蛋白质的情况下,部分是通过蛋白质氨基*列的连续部分来定义的,并且指至少3-5个氨基酸、至少8-10个氨基酸、至少11-15个氨基酸、至少17-24个氨基酸、至少25-30个氨基酸、至少30-45个氨基酸。在寡核苷酸的情况下,部分是通过寡核苷酸的核酸序列的连续部分来定义的,并且指至少9-15个核苷酸、至少18-30个核苷酸、至少33-45个核苷酸、至少48-72个核苷酸、至少75-90个核苷酸、至少90-130个核苷酸。在一些实施方案冲,生物分子的部分具有生物学活性。在本发明的上下文中,LIV-1多肽片段不包含如SEQIDNO:2所示的全长LIV-1多肽序列。本文所使用的词组"LIV-l相关细胞/肿瘤/样本"等是指其特征是相对于非癌性和/或非转移细胞、样本、肿瘤或其它病变而言,LIV-1差异表达的细胞、样本、肿瘤或其它病变。在一些实施方案中,UV-1相关细胞、样本、肿瘤或其它病变的特征是相对于非转移细胞、样本、肿瘤或其它病变而言LIV-1表达的升高证据。本文所使用的术语"抗体"是指对靶标蛋白或其片段特异的单克隆和多克隆抗体、单链抗体、嵌合抗体、双功能/双特异性抗体、人源化抗体、人类抗体、以及互补决定区移植抗体。术语"抗体"还包括体内治疗的抗体基因转移。本发明也提供了包括Fab、Fab,、F(ab,)2、scFv和Fv的抗体片段。本文所使用的术语"表位"是指多肽的抗原决定簇。在一些实施方案中,表位可以包含3个或更多氨基酸,所述氨基酸位于对表位唯一的空间构象中的。在一些实施方案中,表位是线性的或构象的表位。表位通常由至少4个、至少6个、至少8个、至少10个、以及至少12个此类氨基酸组成,或更通常由至少8-10个此类氨基酸组成。确定氨基酸空间构象的方法在本领域是已知的,例如包括X射线晶体学和2维核磁共振。本文所使用的术语"寡核苷酸"是指一系列连接的核苷酸残基。寡核苷酸包括但不限于反义和siRNA寡核苷酸。寡核苷酸包含DNA序列的部分,并且具有至少约IO个核苷酸以及多达约500个核苷酸。在一些实施方案中,寡核苷酸包含约10至约50个核苷酸、约15至约30个核苷酸、以及约20至约25个核苷酸。寡核苷酸可以化学合成并且能够被用作探针。在一些实施方案中,寡核苷酸是单链的。在一些实施方案中,寡核苷酸至少包含是双链的一部分。在一些实施方案中,寡核苷酸是反义寡核苷酸(ASO)。在一些实施方案中,寡核苷酸是RNAi寡核苷酸、siRNAs或shRNAs。本文所使用的术语"反义寡核苷酸,,具有与LIV-1多核苷酸序列互补的核苷酸序列的未经修饰或经修饰的核酸,所述LIV-1多核苷酸序列包括与LIV-1转录或翻译相关的多核苷酸序列(例如,LIV-1多核苷酸的启动子),其中反义多核苷酸能够杂交至LIV-1多核苷M列。特别感兴趣的是能够在体外或体内抑制编码LIV-1多肽的多核苷酸转录和/或翻译的反义多核苷酸。本文所使用的术语"siRNA寡核苷酸,,、"RNAi寡核苷酸,,、"短干扰RNA"、或"siRNA"可互换使用,是指通过转录后基因沉默、也被称为RNA干扰(RNAi)而起作用的寡核苷酸。该术语是指能够RNA干扰"RNAi,,的双链核酸分子(参见Kreutze等,WO00/44895;Zernicka-Goetz等WO01/36646;Fire,WO99/32619;Mello和Fire,WO01/29058)。SiRNA分子通常是RNA分子但进一步包含化学修饰的核苷酸和非核苷酸。SiRNA基因靶向实验通过将siRNA瞬时转染至细胞(通过如脂质体介导转染、电穿孔或微注射等此类经典方法实现)进行。SiRNA分子是21至23个核苷酸的RNA,具有特征性的类似于长双链RNA(dsRNAs)的RNaseIII加工产物的2至3个核苷酸3,突出端,其通常启始RNAi。有效利用siRNA途径来介导基因沉默部分地取决于siRNA细胞内递送的有效方法。siRNA分子在细胞内倾向于是短命的,不容易递送至难以转染的细胞类型,并且通过化学合成生产相对昂贵(Jacks等,(2005)Biotechniques39:215-224;Bernards等,(2006)NatureMethods3:701-706)。有效细胞内递送siRNA的一种方法是应用短发夹RNA,或"shRNAs"。shRNAs是单链RNA分子,其包括由非互补区域连接的两条互补序列。在体内,互补序列退火以产生在一个末端具有非配对环的双链螺旋。得到的棒棒糖状形状的结构称为茎环并且可以被RNAi机制识别并在细胞内加工为具有类似siRNA特性的短双螺旋RNA。shRNA可以通过从已插入到合适载体的DNA模板转录而在细胞内合成。有用的shRNA—般是50-70个核苷酸长、具有通过5-10个核苷酸环分隔的两条19-29个核苷酸的互补序列。shRNA构建体一般通过以下三种方法之一产生互补寡核苷酸退火;基于启动子的聚合酶链式反应(PCR);或引物延伸。许多载体系统应用RNAPolIII启动子,PolIII介导的转录是有利的,因为其在定义明确的起始位点开始、产生不含poly(A)的转录本,并且PolIII启动子在所有细胞类型中都是有效的(Brummelkamp等,(2002)Science296:550-553;Mclntyre,G.和Fanning,G.(2006)BMCBiotechnology6:1-8)。编码shRNA的载体系统提供了基因沉默试剂的可再生细胞内来源,这可以在将载体稳定整合至宿主基因组后介导持续的基因沉默。此外,能很容易地将shRNA盒插入逆转录病毒、慢病毒或腺病毒载体以方便将shRNA递送至宽范围的细胞类型中,所述细胞类型包括非分裂的原代培养物。可调节的shRNA载体形式对遗传篩选是特别有用的。本文所使用的术语"诱斜"(decoy)是指至少包含能够结合锌或锌载体的一部分LIV-1多肽的多肽。在一些实施方案中,诱斜能够结合与锌复合的锌载体。在一些实施方案中,诱何结合未与锌复合的锌载体。本文所使用的术语"治疗有效量"是指产生药用效果的药物量,所述药用效果是指当将治疗有效量的药物施与个体后,观察到的个体中一种或多种临床端点、癌细胞生长和/或存活、或癌细胞转移的减少或逆转。治疗有效量一般通过与当用不包含活性成分的组合物施与类似处境个体时观察到的效果相比较的效果来确定。对于受试者精确的治疗有效量将取决于受试者的大小和健康、疾病的性质和程度、以及选择施与的治疗或治疗组合。然而,对于给定情况的有效量可通过常规实验确定并且在临床医生的判断范围内。本文所使用的术语"联合"或"联用"是指本发明的LIV-1调节剂和其它治疗方案一起施与。本文所使用的术语"敏感的"是指对于其来说LIV-1治疗是可接受的治疗方法的患者,即很可能有阳性反应的患者。对LIV-1治疗敏感的癌症患者相对于对LIV-1治疗不敏感的那些患者表达高水平的LIV-1。对LIV-1治疗来说不是好候选者的癌症患者包括具有这样肿瘤样本的癌症患者,所述肿瘤样本在它们的肿瘤细胞中或肺瘤细胞上缺乏或具有较低水平的LIV-1。本文所使用的术语"检测"是指确立、发现或确认活性(例如,基因表达)或生物分子(例如,多肽)的证据。本文所使用的词组"同源核苷酸序列"或"同源氨基酸序列"或其变体是指特征在于在核苷酸水平或氨基酸水平至少特定百分数同源的序列,并且与"序列同一性"可互相使用。同源核苷^列包括编码蛋白同种型的那些序列。此类同种型可以例如作为RNA选择性剪接的结果在相同机体的不同组织中表达。或者,同种型可以由不同的基因编码。同源核苷酸序列包括编码除人类之外其它物种的蛋白的核酸序列,所述物种包括但不限于哺乳动物。同源核苷酸序列还包括但不限于本文中阐明的核苷酸序列的天然存在的等位变体和突变体。同源氨基酸序列包括含有保守氨基酸替换以及其多肽具有相同结合和/或活性的那些氨基酸序列。同源或同一性百分比例如可以通过Gap程序(Wisconsin序列分析软件包,用于UNIX的第8版,GeneticsComputerGroup,UniversityResearchPark,MadispnWI)、应用缺省设置来确定,所述程序应用了Smith和Waterman的算法(Adv.Appl.Math"1981,2,482-489)。在一些实施方案中,揮:针和靶标之间的同源性在约50%至约60%之间。在一些实施方案中,核酸具有与SEQIDNO:l或其部分约60%、约70%、约80%、约85%、约卯%、约92%、约94%、约95%、约97%、约98%、约99%以及约100%同源的核普酸。本发明还提供了SEQIDNO:l的完全互补序列的部分,或它的同源物。同源性也可以是在多肽水平上的。在一些实施方案中,多肽与SEQIDNO:2或其部分约60%、约70%、约80%、约85%、约90%、约92%、约94%、约95%、约97%、约98%、约99%以及约100%的同源。本文所使用的术语"探针"是指可变长度的核酸序列。在一些实施方案中,探针包含至少约10个以及多至约6,000个核苷酸。在一些实施方案中,探针包含至少12、至少14、至少16、至少18、至少20、至少25、至少50或至少75个连续的核苷酸。探针用于检测同一的、类似的或互补的核酸序列。较长的探针通常从天然或重组来源得到、对靶序列高度特异、以及比寡聚物慢得多地与靶标杂交。探针可以是单链或双链,并经过设计从而在PCR、基于膜的杂交、原位杂交(ISH)、荧光原位杂交(FISH)或类似ELISA的技术中具有特异性。本文所^使用的术语"混合"是指将一种或多种化合物、细胞、分子等在同一区域中结合在一起的过程。这例如可以在试管、培养皿或其它允许一种或多种化合物、细胞或分子混合的容器中进行。本文所使用的术语"分离的"是指处于与多核苷酸、多肽或抗体天然存在的环境不同的环境当中的多核苷酸、多肽、抗体或宿主细胞。分离细胞的方法对本领域技术人员是已知的。分离的多核苷酸、多肽、抗体通常是基本上纯的。本文所使用的术语"基本上纯的"是指从其天然环境中分离并至少60%、至少75%、至少卯%没有其它与之天然联系的成分搀杂的化合物(例如,多核苷酸或多肽或抗体)。本文所使用的术语"结合"意思是两个或多个生物分子或化合物之间的物理或化学相互作用。结合包括离子键、非离子键、氩键、范德华力(VanderWaals)、疏水相互作用等。结合可以是直接的或间接的,间接是通过或由于另一个生物分子或化合物的作用。直接结合是指不通过或由于另一用。本文所使用的术语"接触"是指直接或间接地将一个分子带到一起与笫二个分子物理上接近。分子可以在任意数量的緩冲液、盐、溶液等之中。"接触,,例如包括将多核苷酸置于含有核酸分子的烧杯、微量滴定板、细胞培养瓶或孩吏阵列等中。接触例如还包括将抗体置于含有多肽的烧杯、微量滴定板、细胞培养瓶或微阵列等中。接触可以发生在体内(invivo)、间接体内(exvivo)或体夕卜(invitro)。本文所使用的词组"严格的杂交条件"或"严格条件"是指这样的条件,在所述条件下,探针、引物或寡核苷酸能够与它的靶标序列杂交,但是与最小数量的其它序列杂交。严格条件是序列依赖性的,并且在不同的环境下会不同。更长的序列会在更高的温度与它们适当的互补链特异杂交。通常,在规定的离子强度和pH下对于特定序列的严格条件选择比热熔解点(Tm)低约5°C。Tm是这样的温度(在定义的离子强度、pH和核酸浓度下),在该温度中在平衡状态下50%与靶标序列互补的探针与靶标序列杂交。由于靶标序列通常过量存在,在Tm,在平衡状态下50%的探针与它们的互补序列杂交。一般地,严格条件是这些条件其中盐浓度小于约l.OM钠离子、一般地约0.01至1.0M钠离子(或其它盐);pH7.0至8J;以及对于短探针、引物或寡核苷酸(例如10至50个核苷酸)而言温度至少约30°C、及对于更长的探针、引物或寡核普酸而言温度至少约60。C。严格条件也可以通过添加去稳定剂,诸如甲酰胺而实现。本文所使用的术语"中等严格条件"是指这样的条件,在这种条件下探针、引物或寡核苷酸能够与它的靶标序列杂交,但是与有限数量的其它序列杂交。中等条件是序列依赖性的,并且在不同的环境下会不同。中等条件是本领域技术人员已知的并尤其描述于Manitatis等(MolecularCloning:ALaboratoryManual,ColdSpringHarborLaboratory;第二版(1989年12月))。本文所描述的核酸组合物例如可被用于产生多肽、作为用于检测生物样本(例如人类细胞提取物)中mRNA或从此类样本中产生的cDNA的探针、产生寡核苷酸的另外的拷贝、产生核酶或寡核苷酸(单链或双链)、以及作为单链DNA探针或作为形成三链的寡核苷酸。本文描述的探针例如可以用于确定样本中本文所提供的寡核苷酸的存在或不存在。多肽可以用于产生对与癌症相关的多肽特异的抗体,其抗体又可用于如本文中更详细讨论的诊断方法、预后方法等。多肽也可以用于作为治疗干预的靶标,如本文更详细讨论的那样。本发明的抗体例如也可以用于纯化、检测和靶向本发明的多肽,包括体外和体内诊断和治疗方法。例如,抗体在用于定性和定量测量生物样本中本发明多肽水平的免疫分析中是有用的。例如参见Harlow等,Antibodies:ALaboratoryManual,(ColdSpringHarborLaboratoryPress,第二版1988)。这些和其它用途将在以下更详细地描述。本文所使用的术语"显像剂"是指能用本领域技术人员已知的方法检测的连接至本发明的抗体、小分子或探针上的组合物。本文所使用的术语"基因表达的证据"是指基因表达了的任何可检测的指标。术语"可药用载体,,是指用于施用治疗剂,诸如抗体或多肽、基因和其它治疗剂的载体。该术语是指其本身不会诱导产生对接受组合物的个体有害的抗体且可以施与而没有过度毒性的任何药学载体。合适的载体可以是大的、代谢緩慢的大分子,诸如蛋白、多糖、聚乳酸、聚乙醇酸、聚合氨基酸、氨基酸共聚物、脂聚集体、失活的病毒颗粒。此类栽体是本领域普通技术人员公知的。治疗组合物中可药用栽体包括液体,诸如水、盐水、甘油或乙醇。辅助物质,诸如润湿剂或乳化剂、pH緩冲物质等也可以存在于此类载体中。可以通过本发明的方法和组合物治疗的癌症的特定例子包括但不限于LIV-1相关癌症。本文所使用的术语"LIV-1相关癌症"是指特征是其细胞相对于非癌性细胞差异表达LIV-1的癌症。本发明也可以应用于其中LIV-1在癌细胞生长、肿瘤形成、癌细胞增殖、癌细胞转移、细胞迁移、血管生成、LIV-1信号传导、LIV-l介导的细胞-细胞粘附、细胞-细胞相互作用、LIV-1介导的细胞-细胞膜相互作用、LIV-l介导的细胞-细胞外基质相互作用、整联蛋白介导的活性、LIV-1表面表达、LIV-l介导的细胞-细胞外基质降解、Snail核定位以及LIV-1表达中起着作用的任何的肿瘤细胞类型。在一些实施方案中,癌症是乳腺癌、皮肤癌、食管癌、肝癌、胰腺癌、前列腺癌、子宫癌、子宫颈癌、肺癌、膀胱癌、卵巢癌、多发性骨髓瘤和黑素瘤。在一些实施方案中,癌症是ER阳性乳腺癌。在一些实施方案中,癌症是ER阴性乳腺癌。在一些实施方案中,此类癌症展现出与对照相比至少约25%、至少约50%、至少约75%、至少约100%、至少约150%、至少约200%或至少约300%的LTV-I差异表达。本发明提供了用于治疗、抑制和管理与LIV-1过量表W目关的疾病和病症以及治疗、抑制和管理此类疾病和病症的症状的方法和组合物。本发明的一些实施方案涉及包含治疗、抑制和管理癌症的组合物的方法和组合物,所述癌症包括但不限于癌转移、癌细胞增殖、癌细胞生长和癌细胞侵袭。本发明还提供了包括与本发明LIV-1调节剂联合的其它活性组分的方法。在一些实施方案中,该方法还包括给患者施与一种或多种常规癌治疗。在一些实施方案中,本发明的方法还包括用化学治疗、放射治疗或外科手术中的一种或多种治疗患者。本法还提供了用于治疗、抑制和管理癌症或其它超增殖的细胞病症或疾病的方法和组合物,所述癌症或其它超增殖的细胞病症或疾病已变得部分或完全地耐受当前的或标准癌症治疗,诸如外科手术、化学治疗、方文射治疗、激素治疗和生物学治疗。本发明也提供了应用本发明的LIV-1调节剂、特别是LIV-1抗体以诊断癌症和/或预测癌症进程的诊断和/或成像方法。在一些实施方案中,本发明的方法提供成像和定位肿瘤和/或转移灶的方法以及诊断和预后的方法。在一些实施方案中,本发明的方法提供了评价LIV-1相关治疗适当性的方法。LIV-1调节剂本发明提供了LIV-1调节剂,尤其用于癌症治疗、诊断、检测或成像。LIV-1调节剂也可用于制备治疗癌症的药物。在一些实施方案中,LIV-1调节剂是寡核苷酸、小分子、模拟物、诱辨或抗体。在一些实施方案中,与对照相比,LIV-1调节剂使LIV-1生物活性净皮抑制了25%、50%、60%、70%、75%、80%、90%、95%、97%、98%、99%或100%。在一些实施方案中,与对照相比,LIV-1调节剂4吏LIV-1表达被抑制了至少25%、50%、60%、70%、75%、80%、90%、95%、97%、98%、99%或100%。抗体在一些实施方案中,LIV-1调节剂是单克隆抗体、多克隆抗体、嵌合抗体、人类抗体、人源化抗体、单链抗体、或Fab片段。抗体例如可以用酶、同位素或荧光团标记。在一些实施方案中,抗体具有对除LIV-1之外的多肽小于约lxl05Ka的结合亲和力。在一些实施方案中,LIV-1调节剂是以至少1x108Ka的亲和力结合至LIV-1的单克隆抗体。本发明也提供了抗体,所述抗体竟争性地抑制抗体与本发明的表位的结合,如通过例如应用免疫分析的用于确定竟争性抑制的任何本领域已知方法确定的那样。在一些实施方案中,抗体对至表位的结合而言,竟争性抑制至少95%、至少卯%、至少85%、至少80%、至少75%、至少70%、至少60%或至少50%。在一些实施方案中,抗体是人源化抗体。人源化抗体可以通过各种方法得到,所述方法例如包括(l)将非人类互补决定区(CDRs)移植至人类构架和恒定区(本领域称为"人源化"的方法),或者备选地(2)移植整个非人类可变区,但是通过表面残基替换用人类样表面"遮掩,,它们(本领域称为"镶饰(veneering)"的方法)。在本发明中,人源化抗体将包括"人源化"和"镶饰,,抗体。类似地,人类抗体可以通过将人类免疫球蛋白基因座引入其中内源免疫球蛋白基因已部分或全部失活的转基因动物例如小鼠中而得以制备。攻击后,观察到了人类抗体的产生,其在包括基因重排、组装和抗体库等的所有方面都非常类似于在人类中所观察到的。这一方法例如描述于美国专利号5,545,807、5,545,806、5,569,825、5,625,126、5,633,425、5,661,016,以及以下科学出版物中Marks等,Bio/Technology10,779-783(1992);Lonberg等,Nature368856-859(1994);Morrison,Nature,368,812-13(1994);Fishwild等,NatureBiotechnology14,845-51(1996);Neuberger,NatureBiotechnology14,826(1996);Lonberg和Huszar,Intern.Rev.Immunol.1365-93(1995);Jones等,Nature321:522-525(1986);Morrison等,Proc.Natl.Acad.Sci,U.S.A.,81:6851-6855(1984);Morrison和Oi,Adv.Immunol"44:65-92(1988);Verhoeyer等,Science,239:1534-1536(1988);Padlan,Molec.Immun.28:489-498(1991);Padlan,Molec.Immunol.31(3):169-217(1994);以及Kettleborough,CA.等,ProteinEng.4(7):773-83(1991),其中的每一个都在此引入作为参考。本发明的抗体可以通过不同的机制工作。在一些实施方案中,抗体触发抗体依赖性细胞毒性(ADCC),细胞溶解作用攻击抗体靶向的细胞。在一些实施方案中,抗体具有多重治疗功能,例如包括抗原结合、诱导凋亡以及补体依赖的细胞毒性(CDC)。在一些实施方案中,本发明的抗体可以作为本发明多肽的激动剂或拮抗剂。例如,在一些实施方案中,本发明提供了抗体,所述抗体部分或完全地破坏受体/配体与本发明多肽的相互作用。在一些实施方案中,本发明的抗体结合本文公开的表位,或其部分。在一些实施方案中,提供了抗体,与不存在抗体的情况下相比,所述抗体调节配体活性或受体活性至少95%、至少90%、至少85%、至少80%、至少75%、至少70%、至少60%或至少50%。在一些实施方案中,LIV-1抗体抑制Snail途径和/或抑制细胞周期蛋白Dl、纤连蛋白、RhoB、MT1-MMP、FGF、CDK4、VEGF、EGFR和EGFR磷酸化中的一个或多个。在一些实施方案中,LIV-1抗体抑制整联蛋白介导的活性。在一些实施方案中,LIV-1抗体抑制Snail核定位。在一些实施方案中,LIV-1抗体上调E-钙粘着蛋白、VE-钙粘着蛋白、Muc-l、水闸蛋白、封闭蛋白、桥粒斑蛋白、胱天蛋白酶、p21、p53、BID(bcl-相互作用死亡激动剂)、DFF40(DNA片段化因子)以及细胞角蛋白中的一个或多个。在一些实施方案中,LIV-1抗体下调Snail途径中的一个或多个间充质标记物。在一些实施方案中,本发明提供了中和抗体。在一些实施方案中,中和抗体作为受体拮抗剂,即抑制配体介导的受体活化的生物活性的全部或其子集。在一些实施方案中,可以将抗体描述为生物学活性的激动剂、拮抗剂或反向激动剂,所述生物学活性包含本文所公开发明多肽的特定生物学活性。本发明的抗体可以单独使用或与其它组合物联合使用。抗体可以进一步在N-或C-端重组融合至异源多肽或化学缀合(包括共价或非共价缀合)至多肽或其它组合物上。例如,本发明的抗体可以重组融合或缀合至在检测分析中用于作为标签的分子或诸如异源多肽、药物、方丈射性核素或毒素的效应分子上。例如,参见PCT公开WO92/08495、WO91/14438、WO89/12624;美国专利号5,314,995;以及EP396,387。除了嵌合抗体和人源化抗体之外,完全的人类抗体也可以从具有人类免疫球蛋白基因的转基因小鼠(例如,参见美国专利号6,075,181、6,091,001和6,114,598,其全部在此引入作为参考)、或从人类免疫球蛋白基因的噬菌体展示文库中(例如,参见McCafferty等,Nature,348:552-554(19卯).Clackson等,Nature,352:624-628(1991),以及Marks等,J.Mol.Biol"222:581-597(1991))得到。可以应用Kohler等(1975,Nature256:495-496)的方法或其修改方法制备单克隆抗体。一般地,用含有抗原的溶液免疫小鼠。免疫可以通过在盐水、优选在佐剂诸如弗氏完全佐剂中混合或乳化含有抗原的溶液,以及肠胃外注射混合物或乳剂而完成。可用本领域已知的任何免疫方法获得本发明的单克隆抗体。在动物免疫之后,分离脾脏(以及任选地,数个大淋巴结)并将其解离为单个细胞。可以通过将细胞悬浮液应用至包被有感兴趣抗原的板或孔中来筛选脾脏细胞。表达对抗原特异的膜结合免疫球蛋白的B细胞结合至板上并不会被漂洗走。然后诱导所得到的B细胞或所有离解的脾脏细胞与骨髓瘤细胞融合以形成杂交瘤,并在选择培养基中培养。通过系列或有限稀释平板接种所得到的细胞,并且分析特异性结合感兴趣抗原(并且不结合非相关抗原)的抗体的产生。然后在体外(例如在组织培养瓶或中空纤维反应器中)或体内(如小鼠中的腹水)培养所选择的分泌单克隆抗体(mAb)的杂交瘤。作为对应用杂交瘤用于表达的备选,可以在细胞系,诸如CHO或骨髓瘤细胞系中产生抗体,如在美国专利号5,545,403、5,545,405和5,998,144公开的那样,其中上述每一个专利均在此引入作为参考。简而言之,分别用能够表达轻链和重链的载体转染细胞系。通过转染在分开的载体上的两个蛋白,可以产生嵌合抗体。Immunol.147:8;Banchereau等(1991)Clin.Immunol.Spectrum3:8;以及Banchereau等(1991)Science251:70,其全部在此引入作为参考。也可以通过应用本领域已知的技术,包括噬菌体展示文库[Hoogenboom和Winter,J.Mol.Biol"227:381(1991);Marks等,J.Mol.Biol.,222:581(1991)来制备人类抗体。也可以利用Cole等和Boerner等的方法制备人类单克隆抗体[Cole等,MonoclonalAntibodiesandCancerTherapy,AlanR.Liss,第77页(1985)以及Boerner等,J.Immunol"147(1):8695(1991)。人源化抗体可以通过各种方法得到,所述方法例如包括(l)将非人类互补决定区(CDRs)移植至人类构架和恒定区(本领域称为"人源化,,的方法),或者备选地(2)移植整个非人类可变结构域,但是通过表面残基替换用人类样表面"遮掩"它们(本领域称为"镶饰"的方法)。在本发明中,人源化抗体将包括"人源化,,和"镶饰,,抗体。类似地,人类抗体可以通过将人类免疫球蛋白基因座引入其中内源免疫球蛋白基因已部分或全部失活的转基因动物如小鼠中而制备。攻击后,观察到了人类抗体的产生,其在包括基因重排、组装和抗体谱的所有方面都非常类似于在人类中所观察到的。这一方法例如描述于美国专利号5,545,807、5,545,806、5,569,825、5,625,126、5,633,425、5,661,016,以及以下科学出版物中Marks等,Bio/Technology10,779-783(1992);Lonberg等,Nature,368856-859(1994);Morrison,Nature,368,812-13(1994);Fishwild等,NatureBiotechnology14,845-51(1996);Neuberger,NatureBiotechnology14,826(1996);Lonberg和Huszar,Intern.Rev.Immunol.1365-93(1995);Jones等,Nature321:522-525(1986);Morrison等,Pro"Natl.Acad.Sci,U.S.A.,81:6851-6855(1984);Morrison和Oi,Adv.Immunol.,44:65-92(1988);Verhoeyer等,Science,239:1534-1536(1988);Padlan,Molec.Immun.28:489-498(1991);Padlan,Molec.Immunol.31(3):169画217(1994);以及Kettleborough,CA.等,ProteinEng.4(7):773-83(1991),其中的每一个都在此引入作为参考。词组"互补决定区"是指一起定义天然免疫球蛋白结合位点的天然Fv区域的结合亲和力和特异性的氨基酸序列。例如参见,Chothia等,J.Mol.Biol.196:卯1-917(1987);Kabat等,U.S.Dept.ofHealthandHumanServicesNEHPublicationNo.91-3242(1991)。词组"恒定区,,是指赋予效应子功能的抗体分子的部分。在本发明中,用人类恒定区替换了小鼠恒定区。对象人源化抗体的恒定区衍生自人类免疫球蛋白。重链恒定区可以选自任意的以下5种同种型a、s、£、y、fi。人源化抗体的一种方法包括将非人类重链和轻链序列与人类重链和轻链序列进行比对,基于该比对选择并用人类构架替换非人类构架,分子建模以预测人源化序列的构象并与亲本抗体的构象相比较。这一方法之后,反复回复突变妨碍CDRs结构的CDR区残基,直到人源化序列模型的预测构象密切接近亲本非人类抗体的非人类CDRs的构象。可以进一步衍生此类人源化抗体以促进摄入和例如通过Ashwell受体的清除。例如参见美国专利号5,530,101和5,585,089,其在此引入作为参考。基因动物来生产。例如,WO98/24893公开了具有人类Ig基因座的转基因动物,其中该动物由于内源重链和轻链基因座的失活而不产生有功能的内源免疫球蛋白。WO91/10741也公开了能够对免疫原产生免疫反应的转基因非灵长类哺乳动物宿主,其中抗体具有灵长类的恒定和/或可变区,且其中编码内源免疫球蛋白的基因座被替换或失活了。WO96/30498公开了用Cre/Lox系统修饰哺乳动物中免疫球蛋白基因座的应用,诸如替换恒定或可变区的全部或部分以形成经修饰的抗体分子。WO94/02602公开了具有失活的内源Ig基因座和有功能的人类Ig基因座的非人类哺乳动物宿主。美国专利号5,939,598公开了制备转基因小鼠的方法,其中小鼠缺乏内源重链并且表达包含一个或多个异种恒定区的异源免疫球蛋白基因座。本发明的抗体也可以应用如在美国专利5,766,886中所讨论的人类基因工程技术得以制备,其在此引入作为参考。应用以上描述的转基因动物,可以产生对所选择的抗原分子的免疫反应,以及可以从动物中分离产生抗体的细胞并且用于产生分泌人类单克隆抗体的杂交瘤。免疫方案、佐剂等是本领域已知的,并且例如用于如WO96/33735描述的转基因小鼠的免疫。可对单克隆抗体进行抑制或中和相应蛋白生物学活性或生理学作用的能力测试。本发明的抗体可以通过如Fang等((2005),Nat.Biotechnol.23,584-590)所讨论的体内治疗性抗体基因转移而施与给受试者。例如可以产生重组载体以递送多顺反子表达盒,所述表达盒包含介导位于MAb重链和轻链编码序列之间多肽的不依赖酶的共翻译自切割的肽。表达产生化学计量量的两个MAb链。介导不依赖酶的共翻译自切割的肽的优选示例是衍生自口蹄疫的2A肽。抗体片段适合用于本发明的方法,只要它们保留了全长抗体的期望亲和力。因此,抗LIV-1抗体片段将保留结合至LIV-1的能力。此类片段的特征在于与相应的全长抗LIV-1抗体类似的特性,即片段特异性地结合在人类细胞表面上表达的人类LIV-1抗原。在一些实施方案中,抗体结合LIV-1细胞外结构域上的一个或多个表位。在一些实施方案中,抗体调节一个或多个LIV-1相关的生物学活性。在一些实施方案中,抗体抑制癌细胞生长、胂瘤形成和癌细胞增殖中的一个或多个。在一些实施方案中,抗体是结合至选自以下的结构域中的一个或多个LIV-1表位的单克隆抗体LIV-1的N端细胞外结构域、跨膜结构域(TM)2和3之间的LIV-1细胞外结构域、TM4和5之间的LIV-1细胞外结构域、TM6和7之间的LIV-1细胞外结构域以及LIV-1的C端细胞外结构域。在一些实施方案中,单克隆抗体结合至TM2和3之间的LIV-1细胞外结构域中的LIV-1表位。在一些实施方案中,单克隆抗体结合至SEQIDNO:388的一个或多个表位。在一些实施方案中,抗体单克隆抗体结合至LIV-1N端细胞外结构域中的LIV-1表位。在一些实施方案中,单克隆抗体结合至SEQIDNO:387的一个或多个表位。根据本发明的合适的抗体能够识别线性或构象型的表位,或其组合。在一些实施方案中,本发明的抗体结合至选自SEQIDNO:3-6的LIV-1抗原区域的表位。在一些实施方案中,抗体对具有选自SEQIDNO:3-360的序列的表位是特异的。在一些实施方案中,抗体对具有选自SEQIDNO:361-364或387-391的序列的表位是特异的。应当理解,这些肽可以不需要精确的绘制表位,而是也可以含有非免疫原性的LIV-1序列。预测其它本发明抗体可以与其结合的潜在表位的方法对于本领域技术人员来说是公知的,包括但不限于Kyte-Doolittle分析(Kyte,J.和Dolittle,R.F"J.Mol.Biol.(1982)157:105-132)、Hopp和Woods分析(Hopp,T.P.和Woods,K,R"Proc.Natl.Acad.Sci.USA(1981)78:3824-3828;Hopp,TJ.和Woods,K.R.,Mol.Immunol.(1983)20:483-489;Hopp,TJ,,丄Immunol.Methods(1986)88:1-18.)、Jameson-Wolf分析(Jameson,B.A.和Wolf,H.,Comput.Appl.Biosci.(1988)4:181-186.)和Emini分析(Emini,E.A.,Schlief,W.A.,Colonno,RJ.和Wimmer,E.,Virology(1985)140:13-20.)。如果抗体满足以下条件则被定义为"特异性结合,,l)它们表现出阁水平的结合活性,和/或2)它们不与已知相关多肽分子显著地交叉反应。抗体的结合亲和力可以通过本领域普通技术人员很容易地确定,例如,通过Scatchard分析(Scatchard,Ann.NYAcad.Sci.51:660-672,1949)。在一些实施方案中,本发明的抗体结合至它们的靶标表位或模拟诱斜,对靶标癌相关多肽比对其它ZIP(Zrt-、Irt-样蛋白)锌转运蛋白的已知成员高至少1.5倍、2倍、5倍、10倍、100倍、103倍、104倍、105倍、106倍或更高。在一些实施方案中,抗体以10^M或更少、10々M或更少、10力M或更少的高亲和力,或以亚纳摩级亲和力(0.9、0.8、0.7、0,6、0.5、0.4、0.3、0.2、0.1nM或甚至更低)结合。在一些实施方案中,抗体对LIV-1的结合亲和力至少是lx106Ka。在一些实施方案中,抗体对LIV-1的结合亲和力是至少5xl()6Ka、至少lxl(TKa、至少2xl()7Ka、至少lxl()8Ka,或更高。本发明的抗体也可以根据它们对本发明多肽的结合亲和力来描述或说明。在一些实施方案中,结合亲和力包括Kd小于5xl(^M、1(T2M、5xl03M、103M、5xl04M、1(T4M、5xlOsM、10sM、5xl06M、106M、5x107M、107M、5x108M、108M、5xl(T9M、109M、5x1010M、1010M、5xlO11M、1011M、5x1012M、1012M、5x1013M、1013M、5xl(T"M、1(T14M、5xl(T15M、或l(T15M或更低的那些。在一些实施方案中,例如,如果应用标准蛋白质印迹分析(AusubeI等)本发明的抗体结合LIV-1多肽而不是已知相关多肽,则本发明的抗体不结合至已知的相关多肽分子。已知相关多肽的例子包括但不限于ZIP(Zrt-,Irt-样蛋白)锌转运蛋白家族的其它成员等,包括但不限于SEQIDNO:365、SEQIDNO:366和SEQIDNO:386。在一些实施方案中,本发明的抗体结合至LIV-1或锌转运蛋白多肽的直向同源物(orthologs)、同源物、旁系同源物(paralogs)或变体、或其组合和亚组合。在一些实施方案中,本发明的抗体结合至LIV-1或锌转运蛋白多肽的直向同源物。在一些实施方案中,本发明的抗体结合至LIV-1或锌转运蛋白多肽的同源物。在一些实施方案中,本发明的抗体结合至LIV-1或锌转运蛋白多肽的旁系同源物。在一些实施方案中,本发明的抗体结合至LIV-1或锌转运蛋白多肽的变体。在一些实施方案中,本发明的抗体不结合至LIV-1或锌转运蛋白多肽的直向同源物、同源物、旁系同源物或变体、或其症且合和亚组合。在一些实施方案中,可以针对已知相关多肽筛选抗体以分离特异结合至LIV-1多肽的抗体群。例如,在合适的緩冲条件下使对人类LIV-1多肽特异的抗体流过包含附着在不可溶基质的ZIP(Zrt-,Irt-样蛋白)锌转运蛋白(除LIV-1之外)的柱。此类筛选允许分离不与密切相关多肽交叉反应的多克隆和单克隆抗体(Antibodies:ALaboratoryManual,Harlow和Lane(编辑),ColdSpringHarborLaboratoryPress,1988、CurrentProtocolsinImmunology,Cooligan等(编辑),NationalInstitutesofHealth,JohnWiley和Sons,Inc.,1995)。特定抗体的篩选和分离在本领域是^^知的(参见,FundamentalImmunology,Paul(编辑),RavenPress,1993、Getzoff等,Adv.inImmunol.43:1-98,1988、MonoclonalAntibodies:PrinciplesandPractice,Goding,J.W.(编辑),AcademicPressLtd"1996、Benjamin等,Ann.Rev.Immunol.2:67-101,1984)。此类分析的代表性例子包括并行免疫电泳、放射免疫分析(RIA)、放射免疫沉淀、酶联免疫吸附分析(ELISA)、点印迹或蛋白质印迹分析、抑制或竟争分析以及三明治分析法。在一些实施方案中,本发明的抗体不特异性的结合至SEQIDNO:365、SEQIDNO:366或SEQIDNO:386。在一些实施方案中,本发明的抗体不特异性地结合至由SEQIDNO:386的125-138位残基、SEQIDNO:386的252-265位残基或SEQIDNO:386的418-431位残基组成的表位。在一些实施方案中,抗体不与ZnTl或Zipl交叉反应。本发明也提供是SMIPs或对靶标蛋白特异的结合结构域免疫球蛋白融合蛋白的抗体。这些构建物是包含融合至免疫球蛋白实施抗体效应子功能所必需结构域的抗原结合结构域的单链多肽。例如参见W003/041600、美国专利公开20030133939和美国专利公开20030118592。在一些实施方案中,本发明的抗体是中和抗体。在一些实施方案中,抗体是靶向抗体,在一些实施方案中,抗体在结合粑标后被内在化。在一些实施方案中,抗体在结合靶标后不被内在化而是保留在表面。可以针对结合至所讨论的肿瘤细胞抗原后迅速内在化的能力或针对在结合后留在细胞表面的能力筛选本发明的抗体。在一些实施方案中,例如在一些类型的免疫缀合物构建物中,如果需要内在化以释放毒素部分的话,抗体被内在化的能力是所期望的。或者,如果将抗体用于提高ADCC或CDC,更期望抗体保留在细胞表面。可以应用筛选方法区分这些类型的表现。例如,可以利用拥有肿瘤细胞抗原的细胞,其中将细胞与人类IgGl(对照抗体)或本发明抗体之一以大约1jig/mL的浓度在冰上(具有0.1%叠氮化钠以阻止内在化)或在37。C(没有叠氮化钠)孵育3小时。然后用冷的染色緩冲液(PBS+1。/。BSA+0.1。/。叠氮化钠)洗涤细胞,并用山羊抗人IgG-FITC在水上染色30分钟。通过FACSCalibur记录几何平均荧光强度(MFI)。如果在与本发明抗体水上于存在叠氮化钠的情况下孵育的细胞和在"。C不存在叠氮化钠的情况下观察的细胞之间没有观察到MFI的差别,则认为该抗体是保持结合在细胞表面而不被内在化的抗体。然而如果发现当细胞在37。C不存在叠氮化钠的情况下孵育时,在表面的可染色的抗体减少了,则认为该抗体是能够内在化的抗体。抗体缀合物在一些实施方案中,本发明的抗体是缀合的。在一些实施方案中,缀合的抗体可以用于癌症治疗、癌症诊断或癌性细胞成像。对用于诊断应用,一般用可检测部分标记抗体。可利用很多标签,这些标签通常可以分为以下类型(a)放射性核素,诸如以下所讨论的那些。例如,可以用放射性同位素应用例如描述于CurrentProtocolsinImmunology,巻1和2,Coligen等编辑.Wiley-Interscience,NewYork,N.Y.,Pubs.(1991)的技术标记抗体,并可以用闪铄计数法测量方文射性。(b)荧光标签,诸如可以利用稀土元素螯合物(铕螯合物),或荧光素及其衍生物、罗丹明及其衍生物、丹酰、丽丝胺、藻红素、德克萨斯红。可以应用例如以上CurrentProtocolsinImmunology中公开的技术将荧光标签缀合至抗体。可以用荧光计定量焚光。(c)可以利用各种酶-底物标签,以及美国专利号4,275,149提供了这些中一些的综述。酶通常催化可应用各种技术测量的显色底物的化学改变。例如,酶可以催化可用分光光度计测量的底物的颜色变化。或者,酶可以改变底物的荧光或化学发光。上面讨论了定量荧光改变的技术。化学发光底物通过化学反应变得电子活跃的,并可能然后发射可测量(例如应用化学发光仪)的光或给与能量给荧光受体。酶标签的示例包括萤光素酶(例如,萤火虫萤光素酶和细菌萤光素酶,美国专利号4,737,456)、萤光素、2,3-二氢二氮杂萘二酮(2,3-dihydrophthalazinediones)、苹果酸脱氢酶、脲酶、过氧化物酶诸如辣根过氧物酶(HRPO)、碱性磷酸酶、p-半乳糖苷酶、葡糖淀粉酶、溶菌酶、糖氧化酶(例如,葡萄糖氧化酶、半乳糖氧化酶、以及葡萄糖-6-磷酸脱氢酶)、杂环氧化酶(诸如尿酸酶和黄嘌呤氧化酶)、乳过氧化物酶、微过氧化物酶等。将酶缀合至抗体的技术描述于O,Sullivan等,MethodsforthePreparationofEnzyme-AntibodyConjugatesforuseinEnzymeImmunoassay,MethodsinEnzym.(编辑J.Langone&H.VanVunakis),Academicpress,NewYork,73:147-166(1981)。抗体也可以用于体内诊断分析。在一些实施方案中,用放射性核素标记抗体,从而可以应用免疫闪烁成像定位肿瘤。为了方便,本发明的抗体可以在试剂盒中提供,即预定量试剂和进行诊断分析说明书的经包装的组合。当抗体用酶标记时,试剂盒可以包括酶所需的底物和辅助因子(例如,提供可检测发色团或荧光团的底物前体)。此外,还可以包括其它添加剂,诸如稳定剂、緩沖液(例如,封闭緩冲液或裂解緩冲液)等。各种试剂的相对量可能变化很大,以提供基本上最优化分析敏感性的试剂在溶液中的浓度。具体地,试剂可以作为通常是冻干的干粉提供,所述试剂包括赋形剂,其在溶解后将提供具有合适浓度的试剂溶液。在一些实施方案中,将抗体缀合至一个或多个美登素分子(例如每一个抗体分子约1至约10个美登素分子)。例如,可将美登素转换为May-SS-Me,后者可还原为May-SH3并与经修饰的抗体反应(Chari等CancerResearch52:127-131(1992))以产生美登木素生物碱-抗体免疫缀合物。在一些实施方案中,缀合物可以是高效的美登素衍生物DMl(N2,-脱乙酰-N2,-(3-巯基-l-氧代丙基)-美登素)(例如,参见2002年12月12日公开的WO02/098883),其具有约10-11M的IC50(综述,参见Payne(2003)CancerCell3:207-212),或DM4(N2,-脱乙酰-N2,(4-甲基-4-巯基-l-氧代戊基)-美登素)(例如参见2004年12月2日公开的WO2004/103272)。在一些实施方案中,抗体缀合物包含缀合至一个或多个加利车霉素分子的抗肿瘤细胞抗原抗体。抗生素的加利车霉素家族能够在亚皮摩尔的浓度下产生双链DNA断裂。可以使用的加利车霉素结构类似物包括但不限于yll、ot21、a31、N-乙酰-ylI、PSAG和6Il(Hinman等CancerResearch53:3336-3342(1993)和Lode等CancerResearch58:2925-2928(1998))。也参见美国专利号5,714,586、5,712,374、5,264,586和5,773,001,其每一个都明确地在此引入作为参考。在一些实施方案中,抗体缀合至前体药物,所述前体药物能够通过在许多癌中过度生产的酶释^t它的活性形式。例如,可以与阿霉素的前体药物形式制得抗体缀合物,其中通过纤维蛋白溶酶从缀合物中释放活性成分。已知在许多癌性组织中都过度产生纤维蛋白溶酶(参见Decy等,(2004)FASEBJournal18(3):565-567)。在一些实施方案中,将抗体缀合至酶活性毒素或其片段,在一些实施方案中,毒素包括但不限于白喉A链、白喉毒素的非结合活性片段、外毒素A链(来自铜绿假单胞菌(/^"flto附ow肪""MgZ"仍fl))、假单胞菌内毒素、蓖麻毒素A链、相思豆毒素A链、蒴莲根毒素A链、a-帚曲霉素、油桐蛋白、石竹素蛋白、美洲商陆(Phytolacaamericana)蛋白(PAPI、PAPII和PAP-S)、核糖核酸酶(Rnase)、脱氧核糖核酸酶(Dnase)、美洲商陆抗病毒蛋白、苦瓜抑制剂、麻风树毒蛋白、巴豆毒蛋白、肥皂草(sapaonariaofficinalis)抑制剂、白树毒素、促细胞分裂剂、局限曲菌素、酚霉素、新霉素和单端孢霉烯族化合物(tricothecenes)。例如参见1993年10月28日公开的WO93/21232。在一些实施方案中,毒素具有很低的内在免疫原性以及减少癌性细胞变得耐受毒素的可能性的作用机理(例如,细胞毒性机理对细胞抑制才几理)。在一些实施方案中,在本发明的抗体和免疫调节剂之间制得缀合物。例如,在一些实施方案中,可以应用免疫刺激性寡核苷酸。这些分子是可以引起抗原特异性抗体反应的有效免疫原(参见Datta等,(2003)AnnN.Y.Acad.Sci1002:105-111)。其它的免疫调节化合物可以包括干细胞生长因子,诸如"S1因子";淋巴毒素,诸如肿瘤坏死因子(TNF);造血因子,诸如白介素;集落刺激因子(CSF),诸如粒细胞集落刺激因子(G-CSF)或粒细胞巨噬细胞刺激因子(GM-CSF);干扰素(IFN),诸如干扰素a、卩、y;促红细胞生成素以及促血小板生成素。在一些实施方案中,提供了放射缀合的抗体。在一些实施方案中,此类抗体可以应用32P、33P、47Sc、59Fe、64Cu、67Cu、75Se、77As、89Sr、90Y、"Mo、105Rh、109Pd、125I、131I、142Pr、143Pr、149Pm、153Sm、161Th、166Ho、169Er、177Lu、186Re、188Re、189Re、194Ir、198Au、199Au、211Pb、212Pb、213Bi、58Co、67Ga、80mBr、99mTc、103mRh、109Pt、161Ho、189mOs、192Ir、152Dy、211At、212Bi、223Ra、219Rn、215Po、211Bi、225Ac、221Fr、217At、213Bi、255Fm或其組合或亚组合而制得。在一些实施方案中,将硼、钆或铀原子缀合至抗体。在一些实施方案中,硼原子是1GB、钆原子是157Gd以及铀原子是235U。在一些实施方案中,放射性核素缀合物具有能量在20至10,000keV之间的放射性核素。放射性核素可以是具有小于1000keV能量的Auger发射体、具有20至5000keV之间能量的P发射体、或具有2000至10,000keV之间能量的a或"a"发射体。在一些实施方案中,提供了诊断的放射性缀合物,其包含是发射,、P-或发射正电子的同位素的方文射性核素。在一些实施方案中,放射性核素具案中,放射性核素选自18F、51Mn、52mMn、S2Fe、55Co、62Cn、64Cn、68Ga、72As、75Br、76Br、82mRb、83Sr、89Zr、94mTc、51Cr、57Co、58Co、59Fe、67Ga、7SSe、97Ru、99mTc、114mIn、123I、125I、131^和197!^。在一些实施方案中,本发明的抗体缀合至是光活化剂或造影剂的诊断剂。光活化化合物可以包含诸如发色团或染料的化合物。造影剂例如可以是顺磁离子,其中离子包含选自以下的金属铬(III)、锰(II)、铁(III)、铁(n)、钴(n)、镍(n)、铜(n)、钕(in)、钐(in)、镱(ni)、钇(ni)、钒(n)、铽(ni)、镝(ni)、钬(ni)和铒(ni)。造影剂也可以是用于x射线技术或计算机断层扫描中的射线不透性化合物,诸如碘、铱、钡、镓和铊化合物。射线不透性化合物可以选自钡、3,5-双[乙酰氨基-2,4,6-三碘苯甲酸盐、乙碘油(ethiodizedoil)、柠檬酸镓、碘卡酸、碘酸胺酸、碘达酸、胆影酸、碘沙酸、iogulamide、碘海醇、磺帕醇、碘番酸、-典普西酸、碟西法酸、碘丝酸、碘磺拉胺甲基葡胺、iosemetic酸、碘酞硫、硪替酸、碘拉酸、碘托西酸、碘克沙酸、羟泛影酸、碘泊酸盐、甲基葡胺、甲泛葡胺、曱泛影钠、丙磺酮以及氯化亚铊。在一些实施方案中,诊断性免疫缀合物可以含有缀合至本发明抗体的超声增强剂,诸如充满气体的脂质体。诊断性免疫缀合物可以用于各种方法中,包括但不限于肿瘤或癌症诊断和检测的手术中、内窺镜检查或血管内方法。在一些实施方案中,应用各种双功能蛋白偶联剂制备缀合物,所述偶联剂诸如N-琥珀酰亚胺-3-(2-吡咬基二硫酚)丙酸盐(SPDP)、琥珀酰亚胺-4-(N-马来酰亚胺基甲基)环己烷-l-羧酸盐、亚氨基硫烷(IT)、亚氨酸酯的双功能衍生物(诸如己二酰亚氨二甲酯HCL)、活性酯(诸如二琥珀酰亚胺基辛二酸酯)、醛(诸如戊二醛)、二-叠氮基化合物(诸如二(对叠氮基苯曱酰)己二胺)、二-重氮衍生物(诸如二-(对重氮基苯甲酰)乙二胺)、二异氰酸盐(诸如甲苯2,6-二异氰酸盐)以及双活性氟化合物(诸如1,5-二氟-2,4-二硝基苯)。例如,可以如Vitetta等Science238:1098(1987)描述的方法制备蓖麻毒素免疫毒素。碳-14-标记的l-异硫氰酸苯曱基-3-甲基二亚乙基三胺五乙酸(MX-DTPA)是用于将放射性核苷酸缀合至抗体的示范性螫合剂。参见WO94/11026。接头可以是能促进细胞毒素药物在细胞中释放的"可切割接头"。例如,可以应用酸不稳定的接头、肽酶敏感的接头、二甲基接头或含有二硫化物的接头(Chari等CancerResearch52:127-131(1992))。此外试剂也可以通过碳水化合物部分连接至本发明的抗体。在一些实施方案中,包含本发明的抗体和细胞毒剂的融合蛋白例如可以通过重组技术或肽合成制备。在一些实施方案中,将此类包含与细胞毒剂缀合的抗肿瘤抗原抗体的免疫缀合物施与患者。在一些实施方案中,免疫缀合物和/或其结合的肿瘤细胞抗原蛋白被细胞内在化,导致增加了免疫缀合物在杀伤其结合的癌细胞中的治疗效力。在一些实施方案中,细胞毒剂耙向或干扰癌细胞中的核酸。此类细胞毒剂的例子包括美登木素生物碱、加利车霉素、核糖核酸酶和DNA核酸内切酶。在一些实施方案中,抗体缀合至"受体"(例如链亲和素)用于在肿瘤预耙向中的应用,其中将抗体-受体缀合物施与患者,随后用清洁剂从循环中移除未结合的缀合物并然后施与缀合至细胞毒剂(例如放射性核苷酸)的"配体"(例如抗生物素蛋白)。在一些实施方案中,抗体缀合至在靶细胞溶酶体内释放的细胞毒素分子。例如,可以通过缬氨酸-瓜氨酸连接来缀合药物一曱基奥瑞他汀(auristatin)E(MMAE),在抗体缀合物内在化后,所述缬氨酸-瓜氨酸连接会净皮水解蛋白的溶酶体酶—组织蛋白酶B切割(例如参见2003年4月3日公开的WO03/026577)。在一些实施方案中,可应用酸不稳定的接头将MMAE连接至抗体,所述酸不稳定的接头含有作为可切割部分的腙官能度(例如参见2002年11月11日公开的WO02/088172)。抗体依赖的酶介导的前体药物治疗(ADEPT)在一些实施方案中,通过缀合抗体至前体药物活化酶可以将本发明的抗体用于ADEPT,所述前体药物活化酶将前体药物(例如,肽基化学治疗剂,参见WO81/01145)转换为活性抗癌药物。例如参见\¥088/07378和美国专利号No.4,975,278。在一些实施方案中,用于ADEPT的免疫缀合物的酶组分包括任何能够以将前体药物转换为它的更有效的细胞毒性形式的方式作用于前体药物在ADEPT中有用的酶包括但不限于用于将含有磷酸酯的前体药物转换为游离药物的碱性磷酸酶;用于将含有硫酸酯的前体药物转换为游离药物的芳香基硫酸酯酶;用于将非毒性5-氟胞嘧啶转换为抗癌药物5-氟尿嘧啶的胞嘧啶脱氨酶;用于将含有肽的前体药物转换为游离药物的蛋白酶,诸如灵杆菌(serratia)蛋白酶、嗜热菌蛋白酶、枯草杆菌蛋白酶、羧肽酶和组织蛋白酶(诸如组织蛋白酶B和L);用于转换含有D-氨基酸替代物的前体药物的D-丙氨酰羧基肽酶;用于将糖基化前体药物转换为游离药物的糖切割酶,诸如p-半乳糖苷酶和神经氨酸酶;用于将与p-内酰胺衍生的药物转换为游离药物的p-内酰胺酶;用于将在它们的胺氮上分别用苯氧基乙酰或苯乙酰基团衍生的药物转换为游离药物的青霉素酰胺酶,诸如青霉素V酰胺酶或青霉素G酰胺酶。在一些实施方案中,可以用具有酶活性的抗体(在本领域也称为"抗体酶(abzymes)")将本发明的前体药物转换为游离的活性药物(例如参见,Massey,Nature328:457-458(1987))。可以如本文描述的那样制备抗体-抗体酶缀合物用于将抗体酶递送至肿瘤细胞群。在一些实施方案中,可以通过本领域公知的技术将ADEPT酶共价结合至抗体,诸如应用上面讨论的异双功能交联剂。在一些实施方案中,可以应用本领域公知的重组DNA技术构建包含连接至本发明的酶的至少功能活性部分的本发明抗体的至少抗原结合区域的融合蛋白(例如参见Neuberger等,Nature,312:604-608(1984))。在一些实施方案中,对以细胞抑制方式而不是以细胞毒性方式作用的抗体的鉴定可以通过测量与未经处理的对照培养物相比,经处理的靶细胞培养物的生存力来完成。可以用本领域已知的方法检测生存力,诸如CellTiter-Blue细胞生存力测试法或CellTiter-Glo发光细胞生存力测试法(Promega,目录编号分别是G8080和G5750)。在一些实施方案中,如果处理引起与对照培养相比在细胞数目上的降低,而没有任何如通过以上描述的方法测量的细胞死亡的证据,则认为该抗体是潜在的细胞抑制剂。在一些实施方案中,可以应用本领域已知的测试法进行体外筛选测试以鉴定促进ADCC的抗体。一个示范性测试法是体外ADCC测试法。为制备铬51标记的靶细胞,使肿瘤细胞系在组织培养板中生长并用灭菌的在PBS中的10mMEDTA收集。用细胞培养基洗涤分离的细胞两次。用200nCi铬51(NewEnglandNuclear/DuPont)在37。C标记细胞(5xl06)—个小时,偶尔进行混合。用细胞培养基洗涤经标记的细胞三次,然后将细胞悬浮至1x1()5个细胞/mL的浓度。在通过与抗体在PBMC测试法中以100ng/mL和1.25ng/mL或在NK测试法中以20ng/mL和1ng/mL孵育的测试之前,细胞没有经调理作用或经调理作用。通过从正常健康供体收集肝素支持的血液并用等容积的磷酸緩冲盐水(PBS)稀释制备外周血单核细胞。然后将血液铺在LYMPHOCYTESEPARATIONMEDIUM(LSM:OrganonTeknika)上并按照生产商的教导离心。从LSM-血浆分界面收集单核细胞并用PBS洗涤3次。将效应细胞悬浮在细胞培养基中至终浓度1xl(f个细胞/mL。在通过LSM纯化后,应用NK细胞分离试剂盒和磁柱(MiltenyiBiotech),按照生产商的教导,通过负选择从PBMCs分离自然杀伤(NK)细胞。收集分离的NK细胞,洗涤并悬浮于细胞培养基中达到2x1(^个细胞/mL的浓度。通过流式细胞分析确定NK细胞的身份。通过用细胞培养基沿微滴定板的行两倍系列稀释效应(PBMC或NK)细胞(100nL终体积)而制备不同的效应子靼标比。效应细胞的浓度范围对于PBMC是1.0x107/mL至2.0x104/mL,且对于NK是2.0x106/mL至3.9x103/mL。在效应细胞的滴定之后,将100nL1x1()5个细胞/mL的铬51标记的耙细胞(受调理或未受调理)加至板的每一个孔。这样得到对于PBMC的100:1的初始效应子靼标比以及对于NK细胞的20:1的初始效应子靶标比。所有的分析均以双份进行,并且每一块板都含有对于自发裂解(没有效应细胞)和总裂解(靶细胞加上100jiL1%十二烷基硫酸钠、IN氢氧化钠)的对照。将板在37。C孵育18小时,之后应用上清收集系统(SkatronInstrument,Inc.)收集细胞培养上清液并在Minaxi自动-y5000系列y计数器(Packard)中计数1分钟。然后应用公式%细胞毒性-(样本cpm-自发裂解)/(总裂解-自发裂解)x100以细胞毒性百分数表达结果。为鉴定促进CDC的抗体,熟练的技术人员可以进行本领域已知的测试。一个示范性的测试法是体外CDC测试法。在体外,CDC活性可以通过将表达肿瘤抗原的细胞与人类(或其它来源)含有补体的血清在不存在或存在不同浓度测试抗体的情况下孵育而得以测量。然后通过应用ALAMARBLUE(Gazzano-Santoro等,J.Immunol.Methods202163-171(1997))定量活细胞来测量细胞毒性。以不含抗体和含有抗体,但使用热灭活血清和/或应用不表达所讨论的肿瘤细胞抗原的细胞来进行对照测试。或者,可以用肿瘤抗原或衍生自肿瘤抗原的肽包被红细胞,以及然后可以通过观察红细胞裂解来测试CDC(例如参见Karjalainen和Mantyjarvi,ActaPatholMicrobiolScandC.1981年10月;89(5):315-9)。为选择诱导细胞死亡的抗体,可以相对于对照评估如通过PI、台盼蓝或7AAD摄入指示的膜完整性的丧失。一个示范性测试法是应用表达肿瘤抗原的细胞的PI摄入测试法。按照这一测试法,在补充有10%热失活FBS(Hyclone)和2mML-谷氨酰胺的Dulbecco改良Eagle培养基(D-MEM):Ham'sF-12(50:50)中培养表达肺瘤细胞抗原的细胞。(因此,该测试法在不存在补体和免疫效应细胞的情况下进行)。以每培一3xl06的密度在100x20mm培养皿中接种肿瘤细胞并允许贴附过夜。然后移除培养基,并替换以单独的新鲜培养基或含有iopg/mL合适单克隆抗体的培养基。将细胞孵育3天时间。在每个处理之后,用PBS洗涤单细胞层并通过胰蛋白酶消化分离。然后将细胞在4"C以1200转/分钟离心5分钟,将沉淀重悬浮于3ml冰冷的Ca2+结合緩沖液(10mMHepes,pH7.4,140mMNaCl,2.5mMCaCh)中,并分装至用于移除细胞团块的盖有35mm滤过器的12x75管(每管lml,每一处理组3管)中。管然后接受PI(10pg/mL)。可以应用FACSCANtm流式细胞计和FACSCONVERTtm.CellQuest软件(BectonDickinson)分析样本。那些诱导统计学显著水平的细胞死亡(如通过PI摄入所确定的那样)的抗体可以选择作为诱导细胞死亡的抗体。也可以应用"F-膜联蛋白作为PET成像剂在体内针对细胞凋亡活性筛选抗体。在这一方法中,用"F放射性标记膜联蛋白V并且在测试动物服用所研究的抗体后将其给予测试动物。在细胞凋亡过程中发生的最早事件之一是磷脂酰丝氨酸从细胞膜的内侧外翻至可被膜联蛋白接近的细胞外表面。然后将动物进行PET成像(参见Yagle等,JNuclMed.2005年4月;46(4):658-66)。也可以将动物处死并分离单个的器官或肿瘤并按照标准方案针对细胞凋亡标记进行分析。尽管在一些技术方案中,癌症的特征是基因表达产物的过量表达,本申请还提供了用于治疗这样的癌症的方法,所述癌症不认为是过量表达肿瘤抗原的癌症。为确定癌中肿瘤抗原的表达,可以利用各种诊断/预后测试法。在一些实施方案中,可以通过IHC分析基因表达产物的过量表达。可以将石蜡包埋的来自肿瘤活组织检查的組织切片进行IHC测试,并如下给予胂瘤抗原蛋白染色强度标准得分0:没有观察到染色或在少于10%的肿瘤细胞中观察到膜染色;得分1+:在超过10%的肿瘤细胞中检测到微弱的/几乎不能察觉的膜染色。这些细胞仅仅在它们膜的一部分被染色。得分2+:在超过10%的肿瘤细胞中观察到弱至中等的完全的膜染色。得分3+:在超过10。/。的肿瘤细胞中观察到中等至强的完全的膜染色。可将具有0或1+的肿瘤抗原过量表达评估得分的那些肿瘤描述为不过量表达肿瘤抗原,而将具有2+或3+得分的那些肿瘤描述为过量表达肿瘤抗原。备选地,或另外地,可在福尔马林固定、石蜡包埋的的肿瘤组织上进行诸如informtm(由Ventana,Ariz销售)或PATHVISIONtm(Vysis,Ill.)的FISH测试法,以确定肿瘤中肿瘤抗原过量表达的程度(如果有的话)。此外,可通过共价缀合至聚合物来化学修饰抗体以例如增加它们的循环半寿期。每一个抗体分子可连接至一个或多个(即1、2、3、4、5或更多)聚合物分子。优选地将聚合物分子通过连接分子连接至抗体。一般而言,聚合物可以是合成的或天然存在的聚合物,例如任选取代的直链或支链聚烯烃、聚亚烯烃或聚氧基亚烷基聚合物或支链或无支链的多糖,例如同-或异多糖。在一些实施方案中,聚合物是聚氧乙烯多元醇或聚乙二醇(PEG)。PEG在室温下可溶于水并且具有通式R(0-CH2-CH2)nO-R,其中R可以是氢或保护基团,诸如烷基或烷醇基团。在一些实施方案中,保护基团具有1至8个碳。在一些实施方案中,保护基团是甲基。符号ii是1至1,000之间或2至500之间的正整数。在一些实施方案中,PEG具有1000至40,000之间、2000至20,000之间、或3,000至12,000之间的平均分子量。在一些实施方案中,PEG具有至少一个羟基基团。在一些实施方案中,羟基是末端羟基基团。在一些实施方案中,正是这一羟基基团被活化以与抑制剂上的游离氨基基团反应。然而,应当理解,反应基团的种类和量可以是不同的以得到本发明共价缀合的PEG/抗体。聚合物以及将它们连接至多肽的方法显示于美国专利号4,766,106、4,179,337、4,495,285和4,609,546,其每一个均在此全文引入作为参考。寡核苷酸在一些实施方案中,LIV-1调节剂是寡核苷酸。在一些实施方案中,LIV-1调节剂是包含选自SEQIDNO:367-382的序列的寡核苷酸。在一些实施方案中,寡核苷酸H义或RNAi寡核苷酸,包括siRNAs和shRNAs。在一些实施方案中,寡核苷酸与LIV-1基因或基因产物的区域、结构域、部分或片段互补。在一些实施方案中,寡核苷酸包含约5至约100个核苷酸、约10至约50个核苷酸、约12至约35、以及约18至25个核苷酸。在一些实施方案中,寡核苷酸与LIV-1基因或基因产物的区域、部分、结构域或片段至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%同源。在一些实施方案中,寡核苷酸与LIV-1基因或基因产物的至少15、20、25、30、35、40、50或100个连续核苷酸存在相当高的序列同源性。在一些实施方案中,寡核苷酸与全长的LIV-1基因或基因产物存在相当高的序列同源性。在一些实施方案中,寡核苷酸在中等或严格杂交条件下结合至具有SEQIDNO:1核苷酸序列的核酸分子。在一些实施方案中,LIV-l调节剂是双链RNA(dsRNA)分子并通过RNAi(RNA干扰)工作。在一些实施方案中,dsRNA的一条链与LIV-l基因的区域、部分、结构域或片段至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至少卯%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%同源。在一些实施方案中,与LIV-l基因的至少15、20、25、30、35、40、50、100、200、300、400、500或1000个连续核苷酸存在相当高的序列同源性。在一些实施方案中,与全长的LIV-l基因存在相当高的序列同源性。在一些实施方案中,本发明的寡核苷酸用于聚合酶链式反应(PCR)。这一序列可基于基因组序列或cDNA序列(或由此设计)并用于扩增、确定或检测在特定细胞或组织中同一的、类似的或互补的DNA或RNA的存在。小分子在一些实施方案中,LIV-l调节剂是小分子。本文所使用的术语"小分子"是指具有小于约IO千道尔顿分子量的有机或无机非聚合物化合物。小分子的示例包括肽、寡核苷酸、有机化合物、无机化合物等。在一些实施方案中,小分子具有小于约9、约8、约7、约6、约5、约4、约3、约2或约1千道尔顿的分子量。模拟物在一些实施方案中,LIV-l调节剂是模拟物。本文所使用的术语"模拟物,,是指模拟肽活性的化合物。模拟物是非肽但可以包含通过非肽键连接的氨基酸。1997年6月10日发布的美国专利号5,637,677及其母申请(其全部在此引物作为参考)包含产生模拟物的详细教导。简而言之,用不是肽的分子复制与LIV-1三维结构特异性相互作用的肽的三维结构。在一些实施方案中,LIV-1模拟物是LIV-1的模拟物或LIV-l配体的模拟物。诱斜在一些实施方案中,LIV-1调节剂是包含至少一部分LIV-1多肽的诱斜。在一些实施方案中,诱辨与天然LIV-1多肽竟争锌或锌载体-锌复合体。在一些实施方案中,标记诱斜以利于定量、定性和/或可视化。在其它的实施方案中,诱斜还包含利于诱斜或诱斜-锌或诱饰-锌栽体复合体分离或分开的部分。在一些实施方案中,诱斜通过捕获锌和/或锌载体(与锌复合或未复合)并阻止其与传导信号的LIV-1多肽相互作用发挥功能。在一些实施方案中,诱饰至少包含融合至抗体或抗体片段的LIV-1多肽的部分。治疗/预防癌症的方法
技术领域:
:本发明提供了在受试者中治疗和/或预防癌症或癌症症状的方法,其包括给受试者施与治疗有效量的一种或多种本发明的LIV-1调节剂。在一些实施方案中,癌症是与LIV-1过量表W目关的癌症。在一些实施方案中,癌症是乳腺癌、皮肤癌、食管癌、肝癌、胰腺癌、前列腺癌、子宫癌、子宫颈癌、肺癌、膀胱癌、卵巢癌、多发性骨髓瘤或黑素瘤。在一些实施方案中,癌位于非激素调节的组织。在一些实施方案中,乳腺癌是ER-阳性乳腺癌、ER-阴性乳腺癌、或转移性乳腺癌。在一些实施方案中,乳腺癌是管腺癌、小叶腺癌或转移性腺癌。在一些实施方案中,受试者已被诊断为患有癌症或是对癌症易感的。癌症的症状是本领域技术人员公知的并且包括但不限于胸部肿块、乳头变化、胸部嚢肿、胸部疼痛、死亡、重量减轻、虚弱、极度疲劳、进食困难、食欲不振、久咳、恶化的气喘、咳出血、尿血、4更血、恶心、呕吐、肝转移、肺转移、骨转移、腹痛下堕、气胀、腹膜腔中有液体、阴道流血、便秘、腹胀、结肠穿孔、急性腹膜炎(感染、发烧、疼痛)、疼痛、吐血、重汗、发烧、高血压、贫血、腹泻、黄疸、眩晕、寒战、肌肉痉挛、结肠转移、肺转移、膀胱转移、肝转移、骨转移、肾转移、以及胰腺转移、吞咽困难等。所述调节化合物的治疗有效量可以按照药剂师公知的程序凭经验确定,并且将尤其取决于患者的年龄、疾病的严重度以及取决于所期望的最终药物制剂。本发明调节剂的施与例如可以以下列方式进^f亍通过吸入或松剂或施与至粘膜组织(诸如通过灌洗至阴道、直肠、尿道、口腔或舌下组织)、经口地、局部地、鼻内地、腹膜内地、非肠胃地、静脉内地、淋巴管内地、瘤内地、肌内地、间质地、动脉内地、皮下地、经眼地(intraoccularly)、滑膜内地、经上皮的和经皮地施用。在一些实施方案中,抑制剂通过灌洗、口头或动脉内施与。其它合适的引入方法也可以包括可再填装(rechargeable)或可生物降解的装置以及緩慢或持续释放的聚合物装置。如上面所讨论的那样,本发明的治疗组合物可以作为与其它已知抗癌剂或其它已知抗骨病治疗方案的联合治疗的一部分施与。本发明还提供了在患者中调节LIV-1相关生物学活性的方法。该方法包括给患者施与调节一种或多种LIV-1生物活性有效量的LIV-1调节剂。在上文或下文中给出了用于测量LIV-1生物活性的合适的测试法。本发明也提供了在有需要的患者中抑制癌细胞生长的方法,包括给患者施与治疗有效量的一种或多种LIV-1调节剂。用于测量LIV-1相关细胞生长的合适的测试法是本领域普通技术人员已知的并且在上文和下文中给出。本发明还提供了在有需要的患者中抑制癌症的方法。方法包括确定患者是否是本文所述的LIV-1治疗的候选者,以及如果患者是LIV-1治疗的候选者则施与治疗有效量的一种或多种LIV-1调节剂给患者。如果患者不是LIV-1治疗的候选者,则用常规癌症疗法来治疗患者。本发明还提供了在诊断或怀疑患有癌症的患者中抑制癌症的方法。方法包括施与治疗有效量的一种或多种LIV-1调节剂给患者。本发明也提供了在患者中抑制两个或多个细胞相互作用的方法,包括施与治疗有效量的LIV-1调节剂给所述患者。用于测量LIV-1相关细胞相本发明也提供了在患者中调节一种或多种癌症症状的方法,包括给所述患者施与治疗有效量的本文所描述的LIV-1组合物。本发明还提供了在有需要的患者中抑制细胞生长的方法,包括给患者施与治疗有效量的LIV-1调节剂。在上文和下文中给出了适合用于测量LIV-1相关的贴壁不依赖细胞生长的测试法。本发明也提供了在有需要的患者中抑制癌细胞迁移的方法,包括给患者施与治疗有效量的LIV-1调节剂。用于测量LIV-1相关的细胞迁移的合适的测试法是本领域技术人员已知的。本发明还提供了在有需要的患者中抑制癌细胞粘附的方法,包括给患者施与治疗有效量的LIV-1调节剂。用于测量LIV-1相关的细胞粘附的测试法是本领域技术人员已知的。本发明也提供了用于预防性治疗患者的方法,所述患者是对形成癌、癌转移易感的患者或已患有转移病变并因此对再发或复发易感的患者。该方法在例如具有癌症家族史或转移肿瘤家族史,或显示出癌转移的遗传倾向性的高危个体中是特别有用的。在一些实施方案中,肿瘤是LIV-1相关肺瘤。此外,该方法能用于预防患者LIV-1相关肿瘤的复发,所述患者患有已通过外科切除术移除或用常规的癌症治疗方法治疗的LIV-1相关肺瘤。本发明也提供了抑制癌进程和/或引起癌消退的方法,所述方法包括给患者施与治疗有效量的LIV-1调节剂。在一些实施方案中,用本发明的LIV-1调节剂与化学疗法和/或^L射疗法联合治疗需要抗癌治疗的患者。例如,在施与LIV-1调节剂后,也可以用治疗有效量的抗癌放射治疗患者。在一些实施方案中,提供了与LIV-1调节剂联合的化学疗法治疗。在一些实施方案中,LIV-1调节剂与化学疗法和放射疗法联合施与。治疗方法包括施与单剂量或多剂量的一种或多种LIV-1调节剂给患者。在一些实施方案中,以无菌、无热原且包含与可药用载体或稀释剂联合的LIV-1调节剂的可注射药物组合物施与LIV-1调节剂。在一些实施方案中,本发明的治疗方案与常规的癌症治疗方案一起使用,所述常规的癌症治疗方案包括但不限于外科手术、放射治疗、激素消融和/或化学治疗。本发明LIV-1调节剂的施与可发生在常规的癌症治疗之前、同时或之后。在一些实施方案中,给患者施与两种或多种不同的LIV-1调节剂。在一些实施方案中,施与患者的LIV-1调节剂的量能有效地抑制癌细胞生长、肿瘤形成、癌细胞增殖、癌细胞转移、细胞迁移、血管生成、LIV-1信号传导、抑制LIV-1介导的细胞-细胞粘附、LIV-1介导的细胞-细胞膜相互作用、LIV-1介导的细胞-细胞外基质相互作用、整联蛋白介导的活性、LIV-1介导的细胞-细胞外基质降解以及LIV-l表达中的一种或多种。在一些实施方案中,施与患者的LIV-1调节剂的量能有效地通过细胞凋亡增加癌细力包死亡。联合治疗在一些实施方案中,发明提供了包含两种或多种LIV-1调节剂的组合物以提供更改良的抗癌效力。在一些实施方案中,LIV-1调节剂是单克隆抗体。可将包含两种或多种LIV-1抗体的组合物施与患有或倾向于患有癌症的人或哺乳动物。也可将一种或多种抗体与另外一种治疗剂,诸如细胞毒剂或癌化疗剂施与。两种或多种治疗剂的同时施与不需要在相同的时间或通过相同的途径施与所述药剂,只要在药剂发挥它们治疗作用期间的时间段有重叠即可。考虑在不同天或周施与的同时或顺次施与。在一些实施方案中,本发明提供的方法考虑了施与不同抗体的联合或"混合物(cocktails)"。此类抗体混合物具有某些优点,因为它们含有利用不同效应物机理的抗体或使细胞毒性抗体与依赖免疫效应物功能的抗体直接联合。此类联合的抗体可能表现出协同的治疗效果。细胞毒剂是指抑制或阻止细胞功能和/或引起细胞毁灭的物质。该术语意图包括放射性同位素(例如,1311、1251、卯Y和讓Re)、化学治疗剂和毒素,所述毒素诸如细菌、真菌、植物或动物来源的酶活性毒素、或合成毒素、或其片段。非细胞毒剂是指不会抑制或阻止细胞功能和/或不《1起细胞毁灭的物质。非细胞毒剂可以包括能被活化为细胞毒剂的试剂。非细胞毒剂可以包括珠子、脂质体、基质或颗粒(例如参见,美国专利公开2003/0028071和2003/0032995,其在此引入作为参考)。此类试剂可以与本发明的抗体缀合、偶联、连接或联合。在一些实施方案中,将常规癌症药物与本发明的组合物一起施与。常规癌症药物包括a)癌症化疗剂;b)其它的药剂;c)前体药物。癌症化疗剂包括但不限于烷化剂,诸如卡波铂和顺氯氨柏;氮芥烷化剂;亚硝基脲烷化剂,诸如亚硝脲氮芥(BCNU);代谢拮抗剂,诸如氨甲蝶呤;亚叶酸;嘌呤类似物代谢拮抗剂,巯基嘌呤;嘧啶类似物代谢拮抗剂,诸如氟尿嘧啶(5-FU)和吉西他滨(Gemzar);激素抗肿瘤药,诸如戈舍瑞林、利普安和他莫昔芬;天然抗肿瘤药,诸如阿地白介素、白介素-2、紫杉辟、依托泊苷(VP-16)、干扰素(x、紫杉醇(Taxo隨)和维甲酸(ATRA);抗生素天然抗肿瘤药,诸如博莱霉素、放线菌素、柔红霉素、阿霉素、道诺霉素和包括丝裂霉素C的丝裂霉素;以及长春花生物碱天然抗肿瘤药,诸如长春花碱、长春新碱、去乙酰长春酰胺;羟基脲;醋葡内酯、阿霉素、异环磷酰胺、依诺他滨、环硫雄醇、阿柔比星、环胞苷、嘧啶亚硝脲、盐酸甲基下肼、卡巴醌、卡波铂、卡莫氟、色霉素A3、抗癌多糖、抗癌血小板因子、环磷酰胺(Cytoxin⑧)、裂裥菌素、阿糖胞苷(胞嘧啶阿拉伯糖苷)、氮烯唑胺、硫肌苷、硫替派、替加氟、多拉司他汀、多拉司他汀类似物诸如奥瑞他汀(auristatin)、CPT-ll(依立替康)、米托蒽醌、长春瑞滨、替尼泊苷、胺-蝶呤、洋红霉素、esperamicins(例如参见,美国专利号4,675,187)、新制癌菌素、OK-432、博莱霉素、氟牵失龙、溴苷、白消安、二磷酸已烯雌酚四钠、培洛霉素、贝他定(Ubenimex⑧)、干扰素-P、美雄烷、二溴甘露醇、米尔法兰、层粘连蛋白肽、蘑菇多糖、云芝提取物、替加氟/尿嘧啶、雌氮芥(雌激素/氮芥)。可以用作癌症患者治疗的其它的药剂包括EPO、G-CSF、更昔洛伟;抗体、利普安;哌嘧啶;齐多夫定(AZT);白介素1至18,包括突变体和类似物;干扰素或细胞因子,诸如干扰素a、P和y;激素,诸如黄体生成素释放激素(LHRH)和类似物,以及促性腺激素释放激素(GnRH);生长因子,诸如转化生长因子-p(TGF-p)、成纤维细胞生长因子(FGF)、神经生长因子(NGF)、生长激素释^:因子(GHRF)、表皮生长因子(EGF)、成纤维细胞生长因子类似因子(FGFHF)、肝细胞生长因子(HGF)和胰岛素生长因子(IGF);肿瘤坏死因子-a和卩(TNF-a和卩);侵袭抑制因子-2(IIF-2);骨形态发生蛋白1-7(BMP1-7);促生长素抑制素;胸腺素-a-l;y-球蛋白;超氧化物歧化酶(SOD);补体因子;抗血管生成因子;抗原物质;以及前体药物。前体药物是指药学活性物质的前体或衍生物形式,与母体药物相比,其对肿瘤细胞的细胞毒性更小或没有细胞毒性,并且其能被酶激活或转换为活性或更具活性的母体形式。例如,参见Wiknan,"ProdrugsinCancerChemotherapy"BiochemicalSocietyTransactions,14,第375-382页,615thMeetingBelfast(1986)和Stella等,"Prodrugs:AChemicalApproachtoTargetedDrugDelivery,"DirectedDrugDelivery,Borchardt等,(编辑),第247-267页,HumanaPress(1985)。前体药物包括但不限于含磷酸酯的前体药物、含硫代磷酸酯的前体药物、含^<酸酯的前体药物、含肽的前体药物、D-氨基酸修饰的前体药物、糖基化前体药物、含b-内酰胺的前体药物、含任选取代的苯氧基乙酰胺的前体药物或含任选取代的苯乙酰胺的前体药物、5-氟胞嘧啶和其它能够转换为更有效的细胞毒游离药物的5-氟尿普前体药物。可衍生为本文应用的前体药物形式的细胞毒药物的示例包括但不限于上面描述的那些化学治疗剂。临床方面在一些实施方案中,本发明的方法和组合物尤其对乳腺癌、皮肤癌、食管癌、肝癌、胰腺癌、前列腺癌、子宫癌、子宫颈癌、肺癌、膀胱癌、卵巢癌、多发性骨髓瘤和黑素瘤有用。在一些实施方案中,癌症是管腺癌、小叶腺癌或转移性腺癌。药物组合物本发明也提供了包含一种或多种本文描述的LIV-1调节剂和可药用载体的药物组合物。在一些实施方案中,将药物组合物制备为可注射的液体溶液或悬浮液;也可以制备适合于在注射之前溶解或悬浮于液体载体中的固体形式。脂质体也包括在可药用栽体的定义之内。药物组合物中也可存在药学可接受的盐,例如无机酸盐,诸如盐酸盐、氢溴酸盐、磷酸盐、硫酸盐等;以及有机酸的盐,诸如乙酸盐、丙酸盐、丙二酸盐、苯曱酸盐等。对药学可接受赋形剂的完全的讨论可在Remington:TheScienceandPracticeofPharmacy(1995)AlfonsoGennaro,Lippincott,Williams和Wilkins中得到。检测LIV-1的方法
技术领域:
:本发明也提供了检测LIV-1的方法。在一些实施方案中,LIV-1存在于患者或患者样本中。在一些实施方案中,方法包括将包含一种或多种LIV-1调节剂的组合物施与患者并检测显像剂在患者中的定位。在一些实施方案中,患者样本包含癌细胞。在一些实施方案中,将LIV-1调节剂连接至显像剂或进行可检测地标记。在一些实施方案中,LIV-1调节剂是缀合至显像剂的LIV-1抗体,并将其施与患者以检测一种或多种肿瘤或确定患者对LIV-1治疗的敏感性。经标记的抗体结合至细胞上高密度的受体并且因此聚集在肿瘤细胞上。应用标准成像技术可以检测肿瘤的位置。本发明也提供了成像/检测表达或过量表达LIV-1的细胞或肿瘤的方法,包括将包含LIV-1调节剂的组合物与样本接触,并检测样本中LIV-I调节剂的存在。在一些实施方案中,样本是患者样本。在一些实施方案中,患者样本包含癌细胞。在一些实施方案中,将LIV-1调节剂连接至显像剂或进行可检测地标记。本发明也提供了定量化患者、细胞或样本中存在的LIV-1量的方法。该方法包括将一种或多种抗体、探针、或小分子施与患者或样本,并检测样本中存在的LIV-1量。在一些实施方案中,将抗体、探针、或小分子连接至显像剂或进行可检测地标记。此类信息表明,例如,肿瘤是否与LIV-1相关以及因此是否需要应用或避免特定治疗。在一些实施方案中,应用本领域公知的标准技术,获得被认为包含肿瘤细胞的样本并与经标记的抗体、探针、寡核苷酸和小分子接触。在移除任何未结合的经标记的抗体、探针、寡核苷酸和小分子后,确定结合至细胞的经标记的抗体、肽、寡核苷酸或模拟物的量、或确定因为未结合而被移除的抗体、肽、寡核苷酸或模拟物的量。该信息直接涉及LIV-1的存在量。成像可以应用本领域技术人员公知的方法完成。成卩象例如可以通过放射性闪烁显^象、核磁共振成像(MRI)或计算机断层扫描(CT扫描)等完成。最常用的用于显像剂的放射性标记包括放射性碘和铟。通过CT扫描成像可以利用重金属诸如铁螯合物。MRI扫描可以利用钆或锰的螯合物。此夕卜,正电子放射层扫描术(PET)可能应用氧、氮、铁、碳或镓的正电子发射器。成像也可以应用锌敏感染料以监测体内Liv-l活性来完成。此类方法是本领域技术人员已知的。A.Takeda等,CancerResearch61,5065-5069,,2001年7月1日;和C.Frederickson,SciSTKE.2003年5月13日;2003(182)讨论了此类方法的实例,其每一个均在此全文引入作为参考。在一些实施方案中,LIV-1调节剂是LIV-1抗体。在一些实施方案中,将调节剂连接至显像剂或进行可检测地标记。在一些实施方案中,显像剂是"F、43K、S2Fe、57Co、67Cu、67Ga、77Br、87MSr、86Y、90Y、99MTc、mIn、气气mCs、129Cs、131l、叼、、、203pb或206说。检测的方法是本领域普通技术人员公知的。例如,检测多核苷酸的方法包括但不限于PCR、RNA印迹法、DNA印迹法、RNA保护和DNA杂交(包括原位杂交)。检测多肽的方法包括但不限于蛋白质印迹、ELISA、酶活性测试法、狭线印迹法、肽质量指紋法、电泳、免疫化学和免疫组织化学。检测方法的其它示例包括但不限于放射免疫测试法(RIA)、化学发光免疫测试法、荧光免疫测试法、时间分辨荧光免疫测试法(TR-FIA)、双色荧光显微镜法、或免疫色谱法(ICA),全部都是本领域技术人员公知的。在一些本发明优选的实施方案中,应用PCR方法检测多核苷酸的表达以及应用ELISA^支术检测多肽产物。将细胞毒剂或诊断剂递送至细胞的方法
技术领域:
:本发明也提供了将细胞毒剂或诊断剂递送至一个或多个表达LIV-1的细胞中的方法。在一些实施方案中,方法包括将缀合至细胞毒剂或诊断剂的本发明的LIV-1调节剂与细胞接触。确定癌症患者预后的方法本发明也提供了确定患有LIV-1相关癌症的患者预后的方法。该方法包括确定患者样本中LIV-1-S对LIV-1的比值。尽管不希望被理论所束繂,发明人已发现相对于LIV-1的更高水平的LIV-1-S与侵袭性更小的癌症和/或更容易治疗的癌症相关。因此,在一些实施方案中,相对于LIV-1的高水平LIV-1-S是具有延长生存和/或用本发明的LIV-1调节剂和/或常规癌症药物成功治疗的良好预后的患者的指标。在一些实施方案中,良好的预后通过至少2:1、至少3:1、至少4:1或至少5:1的LIV-1-8:LIV-1比值来指示。在一些实施方案中,通过测量mRNA或蛋白水平确定LIV-l-S:LIV-1的比值。在一些实施方案中,确定患有LIV-1相关癌症患者的预后的方法包括检测患者样本中结合至细胞质膜的LIV-1。在一些实施方案中,在患者样本中结合至细胞质膜的LIV-1的检出不是延长生存和/用本发明的LIV-1调节剂和/或常规癌症药物成功治疗的良好预后的指标。在一些实施方案中,LIV-1由具有SEQIDNO:l序列的核酸编码。在一些实施方案中,LIV-1具有SEQIDNO:2的序列。在一些实施方案中,LIV-1-3具有SEQIDNO:365的序列。确定对LIV-1治疗敏感性的方法
技术领域:
:本发明也提供了确定患者对LIV-1治疗敏感性的方法。该方法包括检测患者或患者样本中LIV-1差异表达证据的存在或不存在。在患者或样本中LIV-1差异表达证据的存在是对LIV-1治疗敏感的患者的指标。在一些实施方案中,在患者或患者样本中LIV-1差异表达证据的不存在表明患者不是LIV-1治疗的候选者。在一些实施方案中,治疗方法包括首先鉴定对LIV-1治疗敏感的患者,包括给有需要的患者施与包含连接至显影剂的LIV-1调节剂的组合物,并检测患者中基因或基因产物证据的存在或不存在。在一些实施方案中,治疗方法还包括如果患者是LIV-1治疗的候选者则施与一种或多种LIV-1调节剂给患者,以及如果患者不是LIV-1治疗的候选者则用常规癌症疗法治疗患者。在一些治疗方法中,当患者被确认为患有癌症或对癌症易感,则给患者单独施与或与其它抗癌药物联合施与一种或多种LIV-1调节剂。评估癌症i^艮的方法
技术领域:
:本发明还提供了在患者中评估癌症进展的方法,包括将第一时间点的生物样本中LIV-1表达产物的水平与第二时间点的相同表达产物水平相比较。第二时间点相对于第一时间点的表达产物水平的改变是癌症进展的指标。筛选方法
技术领域:
:本发明也提供了筛选抗癌剂的方法。该方法包括将表达LIV-1的细胞与候选化合物接触,并确定LIV-1相关生物活性是否受到调节。在一些实施方案中,癌细胞生长、整联蛋白介导的活性、肿瘤形成、癌细胞增殖、癌细胞转移、细胞迁移、血管生成、LIV-1信号传导、LIV-l介导的细胞-细胞粘附、LIV-l介导的细胞-细胞膜相互作用、LIV-l介导的细胞-细胞外基质相互作用、LIV-1介导的细胞-细胞外基质降解以及LIV-l表达中一种或多种的抑制是抗癌剂的指标。本发明还提供了鉴定癌抑制剂的方法。该方法包括将表达LIV-1的细胞与候选化合物和LIV-1配体接触,并确定LIV-1相关生物活性是否受到调节。在一些实施方案中,癌细胞生长、整联蛋白介导的活性、肿瘤形成、癌细胞增殖、癌细胞转移、细胞迁移、血管生成、LIV-1信号传导、LIV-1介导的细胞-细胞粘附、LIV-l介导的细胞-细胞膜相互作用、LIV-1介导的细胞-细胞外基质相互作用、LIV-1介导的细胞-细胞外基质降解以及LIV-1表达中一种或多种的抑制是癌抑制剂的指标。在一些实施方案中,施与患者的LIV-1调节剂的量对增加癌细胞凋亡有效。在一些实施方案中,本发明提供了筛选抗癌剂、尤其是抗转移癌药剂的方法,例如通过针对调节下游标志物的活性或水平的能力筛选假定的调节剂。在一些实施方案中,将降低细胞周期蛋白Dl水平、减少MT1-MMP水平或减少细胞质锌水平的候选试剂确定为抗癌剂。纯化LIV-1的方法在一些实施方案中,本发明提供了从包含LIV-1的样本中纯化LIV-1蛋白的方法。该方法包括提供包含结合至固体支持物上的本发明LIV-1抗体的亲和基质,将样本与亲和基质接触以形成亲和基质-LIV-l蛋白复合体,从样本的剩余物中分离亲和基质-LIV-l蛋白复合体,并从亲和基质上释放LIV-1蛋白。试剂盒在一些实施方案中,本发明提供了用于成像和/或检测与LIV-1过量表达相关的基因或基因产物的试剂盒。本发明的试剂盒包含可检测的抗体、小分子、寡核苷酸、诱何、模拟物或探针以及完成本发明方法的说明书。任选地,试剂盒也可以含有以下的一个或多个以下组分对照(阳性和/或阴性)、对照的容器、阳性和/或阴性结果代表实例的照片或描绘。本文描述的每一个专利、专利申请、登录号和出版物均在此全文引入作为参考。除了本文描述之外的本发明的各种修改鉴于前面的描述对于本领域技术人员是显而易见的。意图使此类修改也落入附录实施方案的范围内。本发明将在以下实施例中进一步说明,所述实施例的目的是举例说明而不是试图限制本发明的范围。实施例实施例1:免疫沉淀法制备含有50mMTris-HClpH7.5、150mMNaCl、l%TritonX-100和每10ml总体积1个蛋白酶抑制剂片剂(RocheDiagnosticCorp.,Indianapolis,IN)的免疫沉淀(IP)緩冲液。合并用IP緩冲液以l:100稀释的才几构内部(in-house)产生的抗LIV-1兔多克隆抗体(Ab),并添加至有螺旋盖的管中的细胞裂解产物中,允许其在摇动平台上在4°C混合1-2小时。为进行免疫沉淀,将40jil抗兔IgG缀合珠或120jil链亲和素珠添加至每一管并继续在摇动平台上在4。C孵育过夜。随后,将管以7000xg在4。C离心2分钟,并移除上清液。用冷的洗涤緩冲液洗涤珠子沉淀4次,然后往每一管加入30fil含有还原剂的2XSDSTris/甘氨酸样本緩沖液。然后将样本緩沖液中的珠子在95°C煮两次,每次5分钟,以从珠子中释放免疫沉淀物。然后将煮过的珠子溶液在室温下以14,000xg离心5分钟,将上清液移出并转移至新管中。立即通过在SDS-PAGE凝胶上电泳分析免疫沉淀物或将其储存在-20。C。应用标准方法进行蛋白质印迹分析。将经电泳的免疫沉淀物从聚丙烯酰胺凝胶中转移至膜上,并然后于室温在温和摇动中应用第二LIV-1抗体(l:IOOO)探测膜1小时。用含有0.05%吐温20的PBS(PBST)洗涤数次后,加入缀合至辣根过氧物酶(HRP)的合适的物种特异性二抗,并于室温在摇动平台上孵育30分钟。数次洗涤后,然后用ECL检测系统(AmershamBiosciencesUK)显现膜上的反应条带。实施例2:FACS分析将非透化的细胞用于分析。制备含有(冷)PBS、1。/。牛血清白蛋白(BSA)、2。/。胎牛血清(FBS)和0.1。/。叠氮化钠的FACS緩沖液。通过用离解緩冲液(InvitrogenCorp.,Carlsbad,CA)使贴壁细胞不贴壁而收集细胞。为中和离解緩沖液,加入等体积的生长培养基。然后将细胞分装至5ml聚苯乙烯圆底管中。对每一个染色,将一百万个细胞在4。C以1000转/分钟离心5分钟,并然后往细胞沉淀中加入第一抗体(100jiLFACS緩沖液中达6jig),通过涡旋混合并在水上孵育30分钟至1小时。然后通过在4。C以1000转/分钟离心5分钟沉淀后,用3mlFACS緩沖液洗涤细胞两次。在笫二次洗涤和离心后,往细胞沉淀中加入第二抗体(50jiLFACS緩冲液中ljig),通过涡旋混合并在水上在黑暗中孵育30分钟。通过在4。C以1000转/分钟离心5分钟沉淀细胞后,用3mlFACS緩沖液洗涤细胞两次。在第二次洗涤和离心后,将细胞以500ng悬浮于50jiL含有碘化丙锭(PI)的FACS緩沖液中。(将PI制备为1jig/nL的储存液并以1:100使用)。在一小时内实施FACS/流式细胞术分析。实施例3:LIV-1寡核苷酸抑制软琼脂生长用对LIV-1的寡核苷酸(SEQIDNO:369和370)处理MDA231、MCF-7、ZR75-1和T47D1细胞。将细胞平板接种于0.35%软琼脂中并在培养7天后用AlamarBlue定量生长。通过在软琼脂中的集落形成测量LIV-1基因表达对T47D1细胞的贴壁不依赖性细胞生长的影响。通过首先用聚HEMA包被非组织培养处理的平板以阻止细胞贴附至平板来进行软琼脂分析。用胰蛋白酶收集非转染的细胞并用培养基洗涤两次。用血细胞计数器计数细胞并在培养基中重悬细胞至每ml1(^个细胞。将50jil等分试样置于聚HEMA包被的96孔板中,并转染。对于每一个转染混合物,将载体分子(优选脂-拟肽缀合物(lipitoid)或拟胆固醇(cholesteroid))制备为在水中的0.5nM工作浓度,超声处理以产生均匀的溶液并通过0.45nmPVDF膜过滤。然后将反义或对照寡核苷酸在无菌Millipore水中制备成100jiM的工作浓度。将寡核苷酸在微离心管中的OptiMEMTM(Gibco/BRL)中进一步稀释至2jiM,或每mlOptiMEMTM约20ng寡核苷酸。在另一个樣t离心管中,将脂-拟肽缀合物或拟胆固醇稀释至与稀释寡核苷酸所用的相同体积的OptiMEMTM中,一般地以每照反义寡核苷酸约1.5-2nmol月旨-拟肽缀合物的量进行。将经稀释的反义寡核苷酸立即添加至经稀释的脂-拟肽缀合物,并通过上下移液混合。将寡核苷酸添加至细胞至约300nM的终浓度。在37。C转染约30分钟后,通过上下移液将3。/。GTG琼脂糖加至细胞中,达到0.35%琼脂糖的终浓度。在细胞层琼脂凝固后,将100jil培养基滴在每一个孔的上面。在约7天中形成集落。为了读出生长,往每一孔中加入20ftlAlamarBlue并将平板振动约15分钟。在孵育6-24小时后,进行荧光读数(S30nm激发/590nm发射)。应用LIV-1调节剂对癌细胞系集落形成的抑制表明LIV-1在转移表型的产生和/或维持中是重要的。实施例4:基因表达的调节应用寡核苷酸分析了由癌性细胞中多核苷酸所示的差异表达基因的表达,以确定LIV-1在肿瘤发生,例如在促进转移表型中的作用和功能。产生LIV-1寡核苷酸并测试它们抑制LIV-1表达的能力。一旦合成并定量后,则在一组细胞系中针对转录敲低的效率筛选寡核苷酸。通过应用GeneAmp定量分析mRNA水平来确定敲除效率。通过转染至T47D1、T47D-T1、MCF7、ZR-75-l、MDA231、184B5或HMEC细胞中测试每一个寡核苷酸抑制基因表达的能力。对于每一个转染混合物,将载体分子(诸如脂类,脂类衍生物、脂类样分子、胆固醇、胆固醇衍生物或胆固醇样分子)在水中制备为0.5mM的工作浓度,超声处理以产生均匀溶液并通过0.45nmPVDF膜过滤。然后将反义和siRNA寡核苷酸在无菌Millipore水中制备成约100fiM的工作浓度。将寡核苷酸在微离心管中在OptiMEMTM(Gibco/BRL)中进一步稀释至2jiM,或每mlOptiMEMTM约20jig寡核普酸。在另一个微离心管中,将栽体分子稀释至与稀释寡核苷酸所用的相同体积的OptiMEMTM中,一般以每jig反义寡核苷酸约1.5-2nmol载体进行。将经稀释的反义寡核苷酸立即添加至经稀释的载体中,并通过上下移液混合。将siRNAs添加至细胞至约67nM的终浓度。应用ABIGeneAmp7000TM实时PCR仪在细胞系中定量经转染细胞中与感兴趣的靶标基因相对应的靶标mRNA的水平。将靶标mRNA值对内对照进行标准化。对于每一20nl反应,将提取的RNA(通常总共0.2-1jig)置于灭菌的0.5或1.5ml微离心管中,添加水达到12.5jil的总体积。往每一管添加7.5jil緩冲液/酶混合物,所述緩冲液/酶混合物通过(以所列顺序)混合2.5plH20、2.0fill0x反应緩冲液、10nl寡聚dT(20pmo1)、1.0jildNTP混合物(每一种10mM)、0.5filRNAsin(20u)(Ambion,Inc.,Hialeah,FL)和0.5filMMLV逆转录酶(50u)(Ambion,Inc.)而制备。通过上下移液混合内容物,将反应混合物在42。C孵育1小时。在扩增之前离心每一管的内容物。应用ABIsybrmastermix加上0.175pmol每一种寡核苷酸制备扩增混合物。SYBRGreen(MolecularProbes,Eugene,OR)是当其结合至双链DNA时发荧光的染料。由于在扩增过程中会产生双链PCR产物,来自SYBRGreen的荧光增加。往每20fil扩增混合物的等分试样中加入2jil模板RT,并按照标准方案进行扩增。以相应基因的表达相对于没有转染的细胞、只转染了载体的细胞(假转染)或用反向对照寡核苷酸转染的细胞降低的百分比来表达结果。尽管LIV-1寡核苷酸在所有测试细胞系中均抑制Liv-l表达,LIV-1寡核苷酸只在致瘤系中具有功能后果。在非致癌系中没有观察到LIV-1寡核苷酸的功能后果,表明癌细胞和"正常,,细胞对Livl活性具有不同的依赖性。实施例5:表达对增殖的影响在数个细胞系中应用siRNA方法评估了基因表达对细胞增殖抑制的影响,所述细胞系包括T47D1、T47D-T1、MCF7、ZR-75-l、184B5、MDA231和HMEC细月包。将细胞以数天后会达到约80-95%融合的密度接种在96-孔皿上。将寡核苷酸(反义或siRNA)在OptiMEMTM中稀释至2pM。然后将寡核苦酸-OptiMElVFM加入到递送载体,对所述载体进行选择使得对于在测试中待使用的特定细胞类型是最优化的。然后将寡核苷^/递送载体混合物进一步稀释至在细胞上的有血清的培养液中。反义寡核苷酸的终浓度是约300nM以及siRNA寡核苷酸的终浓度是67-100nM。如上面描述的那样制备寡核苷酸。将细胞在37°C转染约4小时至过夜,然后用新鲜培养基更换转染混合物。如上面描述的那样进行转染。LIV-1寡核苷酸抑制癌细胞增殖但不抑制HMEC(原代乳腺上皮细胞)或184B5(非致瘤性乳腺上皮细胞系)细胞的增殖,表明LIV-1在癌细胞癌性表型的产生和/或维持中起着重要作用。实施例6:生存测试为评估革巴信息的缺失对细胞死亡的影响,转染T47D-T1、MCF7、Zr-75-l和MDA-MB231细胞用于细胞毒性测试。通过测量由于膜损伤释放至培养基中的LDH酶量来监测细胞毒性。应用来自RocheMolecularBiochemicals的细胞毒性检测试剂盒来检测LDH活性。数据以释放至培养基中的LDH对在相同时间点和处理中在孔中存在的总LDH的比值(rLDH/tLDH)提供。测试包括了应用针对BCL2(已知的抗凋亡基因)的反义和反向对照寡核苦酸的阳性对照;与用对照寡核苷酸的处理相比(由于转染的背景细胞毒性),BCL2信号的丧失导致了细胞死亡的增加。实施例7:胱天蛋白酶/M30方法对来自用siRNA处理的细胞的裂解产物应用蛋白质印迹分析评估胱天蛋白酶原(procaspase)和M30。在处理后的不同时间点,裂解细胞(贴壁或分离的细胞,将后者离心下来)并应用针对胱天蛋白酶原和M30的抗体进行蛋白质印迹分析。胱天蛋白酶原的消失与胱天蛋白酶活化相对应。M30表位的出现是细胞角蛋白18的胱天蛋白酶切割的反映。所使用的抗体是Axxora/AlexisM30(CytoDeath:CAT#ALX-804-5卯)和胱天蛋白酶原Ab(R&DSystems,货号MAB707)。实施例8:细胞周期蛋白Dl方法用siRNA转染细胞以敲低Livl或用Uv-l特异的抗体处理细胞。对于转染的细胞,在转染48小时后收集细胞裂解产物。对于Ab处理,在处理6小时后收集细胞裂解产物。应用抗细胞周期蛋白DlAb:周期蛋白DlAbeamCat#-ab24249对裂解产物进行蛋白质印迹分析。所使用的siRNAs是SEQIDNO:369和370。测试的LIV-1抗体是针对N端和TM2-3ECD的机构内部产生的抗体。针对TM2-3ECD的抗体似乎显示出最大的效力。实施例9:锌水平在实施例G之前24、48或72小时用siRNA处理细胞或在实施例10之前30分钟用抗体处理细胞。所使用的siRNAs是SEQIDNO:369和370。测试的LIV-1抗体是针对N端和TM2-3ECD的机构内部产生的抗体。针对TM2-3ECD的抗体似乎显示出最大的效力。实施例10:锌转运测试法应用通透细胞的锌选择性荧光指示剂NewportGreen测试锌转运。在通过细胞内酯酶切割后,NewportGreen结合至游离的锌离子并作为细胞内游离锌含量的荧光指示剂。如下制备在Krebs画Ringer-HEPESBuffer(KRH)緩沖液(120mMNaCl、25mMHEPES、pH7.5、4.8mMKC1、1.2mMKH2P04、1.2mMMgS04、1.3mMCaCh)中的10jiMNewportGreenPDX染料(渗透酯形式,Cat#N24191,Invitrogen-MolecularProbesTM)和0.02%PluronicF-127(在DMSO中20%PluronicF-127;Cat#P3000,Invitrogen-MolecularProbesTM)的工作溶液。将NewportGreen以50fig等分试样于干燥下储存于-20。C、避光并在使用之前融化。通过将50ngNewportGreen在16.8jil无水二甲亚砜(DMSO)(Cat#276855-100mL,Sigma-Aldrich)中重构制得NewportGreen染料的2.5mM储存溶液。通过将等体积(16.8^L)的分散剂PluronicF-127添加至2.5mM储存溶液并然后将全部体积的染料稀释至8.366mLKRH緩沖液中制备NewportGreen染料的10工作溶液。将贴壁细胞用没有Ca"和Mg"的磷酸盐緩沖盐水(PBS)洗涤一次,并用没有酶的、基于Hanks的离解緩沖液(Invitrogen,Cat#13150-016)收集。将PBS和解离緩冲液在使用前平衡至37。C。然后通过添加等体积的生长培养基中和细胞悬浮液的pH。通过在1000转/分钟离心5分钟收集细胞,将得到的细胞沉淀以1xi(^个细胞/mL的浓度重悬于PBS。为了进行分析,将1.5x106个细胞分装至5ml聚苯乙烯圆底FACS管(BectonDickinson,Cat#352054)中。通过离心再次沉淀细胞并移除PBS。将细胞通过涡旋重悬浮于0.5mL10jiMNewportGreen染料溶液中;盖上FACS管并在30°C水浴中孵育45分钟。将lmL没有染料的KRH緩冲液加入到细胞悬浮液中,并通过在1000转/分钟离心5分钟沉淀细胞。吸出上清液,在lmL没有染料的KRH緩冲液中再次洗涤细胞,将细胞沉淀重悬浮于0.5mL没有染料的KRH緩沖液中并在30。C水浴中孵育30分钟。将lmL没有染料的KRH緩沖液加入到细胞悬浮液中,并通过在1000转/分钟离心5分钟沉淀细胞。吸出上清液,在lmL没有染料的KRH緩沖液中再次洗涤细胞,将细胞沉淀通过涡旋重悬浮于2.0mL没有染料的KRH緩沖液中。通过FACS(FACSCalibur)(BDBiosciences)监测细胞内荧光。实时收集细胞,并根据时间绘制NewportGreen染料焚光(FITC设置)图(收集设置在10分钟收集200万个细胞)。在建立了1.5至2分钟收集范围内的荧光基线后,将100mM氯化锌(Cat#Z0152-100G,Sigma-Aldrich,溶解于29mMHC1)添加至细胞达到1-100fiM的终浓度。立即将细胞管送回FACS机器,通过荧光的瞬时增加显示锌摄入。将FACS数据输出至Flowjo软件(TreeStarInc,Ashland,Oregon)并应用动力学平台(KineticsPlatform)分析。用移动平均平滑选择来展示数据的中位数,以及在布图编辑器(LayoutEditor)中产生图示覆盖图。实施例11:LIV-l表位可以通过本领域已知的多种方法中的任何一种鉴定用于抗体识别和制备的LIV-l线性表位。一些示例方法包括探测衍生自抗原氨基酸序列的肽的抗体结合能力。可以通过应用BIACORE或ELISA方法评估结合。其它技术包括将在平面固体支持物("芯片,,)上的肽文库暴露给抗体,并通过在固相筛选中所应用的多种方法中的任何一种检测结合。此外,可以应用噬菌体展示来篩选肽文库,经过数轮生物篩选后选择表位。以下表1提供了已鉴定为适合于被抗LIV1抗体识别的线性表位的LIV画l(SEQIDNO:2)区域。<table>tableseeoriginaldocumentpage79</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage80</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage81</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage82</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage83</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage84</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage85</column></row><table>IgG取血前对照(Chiron,Emeryville,CA)。将Ventana普遍第二试剂(VentanaMedicalSystems,Inc.,Tucson,Az)和随后的VentanaDABMap试剂盒(VentanaMedicalSystemsInc.)用于检测。使用Ventana苏木精和上蓝试剂(VentanaMedicalSystems,Inc)用于复染,并在分级醇中使切片脱水,在二曱苯中清洁并应用合成的固封介质盖上盖玻片。实施例13:癌对正常組织;Spotfire分析也将微阵列数据用于确定多种癌性肿瘤类型和多种来自正常样本的组织中LIV画1、SLC39A10、SLC39A11和SLC39A13的表达。应用DecisionSite软件(Spotfire,Somerville,MA)和才/L构内部开发的PipelinePilot(SciTegic,SanDiego,CA,机构内部的开发人JosefRinggenberg)方案产生显示于图12-15的图解描述。结果显示每一种目的肿瘤细胞抗原在许多癌类型中表达升高,而在很多正常组织类型中有较低水平的表达。实施例14:序列LIV-1核苦齡列;SEQIDNO:1:OGAACCAAACCTGCGCGCGTGGCCGGGCCGTGGGACAACGAGGCCGCG(3AGAC(3AAGGCGCAATGGCGAGGAAGTCCCAGACCACTGAGAAAATTAGTCCGAATTGGGAATCTOGCATTAATGTTGACTTGGCAATTTCCACACGGCAATCTCACCATAATCATGCTGCTTCTOGTAAAAATAAGCGAAAAGCTCTTTGCCCAGACCATGACTCAGATAGTTCAGTAGAGACTCCAAGACCTGGAAAACTCTTCCCCAAAGATGTAAGCAGCTCCACTCCACCCAGTGTCACATCAAAGAGCCGGGTGAGCCGGCTGGCTGGTAGGAAAACAAATGAiiTCTGTGAC3TGAGCCCCGAAAAGGCTTTATGTATTCCAGAAACACAAATGAAAATCCTCAGGAGTGTTTCAATGCATCAAAGCTACTOACATCTCATGGCATGGGCATCCAGGTAGCGATTTCCATCATCAGTTTCCTGTCTCTGCTGGGGGTTATCTTAGTGCCTCTCATGAATCGGGTGTTTTTCAAATTTCTCCTGAGTTTCCTTGTGGCACTGGCCGTTGGGACTTTGAGTGGTGATGCTTTTTTACACCTTCTTCCACATTCTCATGCAAGTCACCACCATAGTCATAGCCATGAAGAACCAC3CAATGGAAATC3AAAAGAGGACCACTTTTCAGCCTGTATTTCATGiTTCTTGTTGAACATOTCCTCACATTGATCAAACAATTTAAAGATAAGiV^GAAAAAGAATCAGAAGAAACCTGAAAMGATGATGATGTOGAGATTAAGAAGCACTTGTCCAAGTATGAATCTCAACTTTCAACAAATGAGGAGAAAC3TAC3ATACAC3AT(3ATCGAACTGAA(3GCTATTTAC:GAGCAGACTCACAAGAGCCCTCCCACTTTG'cTcTcccGc工加加cA一cG一Ml86attatgctoaaaatgtttctatgtggatatttgcacttactgctggcttattcatcstatgttgctct'ggttgatatggtacctgaaa士gctgcac^atgatgctagtgaccatggatgtagccgct6ggggtatttctttttacAgAatgCTGGGAT(3CTTTTGGGTTTTdGAATTATGTTACTTATTTCCATATTTGAACATAAAATCGi(3TTTCGTATAAATTTCTAGTTAAGGTTTJ^AATGCTAGAGTAGCTTAAAAAOTTOTCATAOTTTCAGTAC3GT'CATivGGGAGATGAGTTi:GTCAGTTAAAGGTACGTTTTAATATTTAAGTTATTCTATCTTGGAGATAAAATCTC3TATOTGCAATTCACCGGTATttttcaagaactaacacagttattcctatactggattttaggtctctgaagaactgctggtoLIV-1氨基,列;SEQIDNO:2:rkliiqnig工e)kikr工h:iiffldhd朋sdhehhsdherhsdhehhsdhehhsdhd朋shhnhaasgiknkrkmjcpdhdsdssgkdprnsqgkgahrpehasgrrnvkdsvsasevtstvyntvsegthfijetietprpgkxifpkdvssstppsvtsksrvsriiagrktnesvseprkgfmysrntnenpqecfnaskliitshgmg;iovpiinat迈.pnyiicpal工nqldahliliphshashhhshsheepa^iemkrgpiifshlssqnieesayfbstwkgltalgglyfmflvehvltiiikqfkdkkkknqkkpendddveikkqi^kyesqlstnee^vdtddrtegylradsqepshfdsqqpavleeeeVmiahahpqBVYNEyVPRGCKNKCHSHFHDTIjC3QSDr)Ij工HHliHDYHH工IiHHHHHQNHHraSHSORYS肪EIiKDAGVATIiAWMV;i:FR工OT在本发明的一些实施方案中,LIV-1调节剂包含或涉及LIV-1多肽的抗原性区域。LIV-1的抗原性区域包括"f旦不限于以下的SEQIDNO:3、SEQIDNO:4和SEQIDNO:5:hhdhd朋sd耶HHSDHERHSDHEHHSDHEHHSDHNHAASC3KNKRKAIiCPDHDSDS(SEQIDNO:3)kgah^pehasgrrnvkdsvsase(SEQIDNO:4)HliLPH^HASHHHSHSHEEPA(SEQli)NO:5)在本发明的一些实施方案中,LIV-1调节剂包含和/或特异性地结合至SEQIDNO:2的一个或多个序列。在一些实施方案中,LIV-1调节剂特异性地结合至一个或多个具有选自以下SEQIDNO:361-SEQIDNOJ64或SEQIDNO:387画SEQIDNO:391序列的LIV-1表位hshsheepamemkrgplfsh;SEQIDNO:361cfnaskllshgm;SEQ|IDNO:362gmgiqvplnatefnyl;SEQIDNO:363svsasevtstvyntvsegt;SEQIDNO:364LHEIjKAAAFPQTTEJEaSPNWESGINVDLAISTRQYHIjQQLFYRYGENNSIiSVBGFRKIiLQKriGIDKIKRIHIHHDiDDHHSDHEHHSDHBRHSDHEHHSDHBHHSDHNHAASGKNKRKAIiCPDHDSDSSGKDPRNSQGKGAHRPEHASGRR'NVKDSVSASEVTSTVYNTVSEIOTHFIjETIETPRPGKLFPKDViSSSTPPSVTSKSRVSRIiAGRKTNESVSEPRKGFggfi;SEQIDNO:387;N端HLLPHSHASHHHSHSHEEPAMEMKRGPLFSHLS'SQNIEESAYFDST;SEQIDNO:388;TM2/3teglss;SEQEDNO:389;TM4/5hyaewVsm;SEQIDNO:390;TM6/7vfrinf;SEQIDNO:391;C端在一些实施方案中,本发明的LIV-l调节剂具有下面的序列CHIR296-4SI;AAAGGCTGGCMteACCGTTAA(SEQIDNO:367)CHIR296-3SI;gacagtgttagtgctagtgaa(SEQID加:368)CHIR296-2SIctagttaaggtttaaatgcta(SEQEDNO:369)CHIR296-1SI;aaggcttatcaagtggtttaa(SBQIDNQ:370)CHIR296-7RC;gcaaccctgaaactcaccactacga(SEQIDNO:371')'CHIR296-5RC;taccgacccgtagotccaa加cg(SEQIDNO:372)CH1R296-2RC;tgtggtactggtgctggtaotga:gt(SEQIDNO:373)CHIR296醫9CHIR29.6-8CHIR296-6CHIR296-5CHIR296-4CHIR296;3CHIR296-2CHIR296-1TGGTGAATGAGATCGTCTGACTGGC(SEQIDNO:374)AGGGCTCTTGTGAGTCTGCTCGTAA(SEQIDNO:375)AGCATCACCACTCAAAGTCCCAACG(SEQIDNO:376)GCCAGTGCCACAAGGAAACTCAGG(SEQIDNO':377')G。.GGAACCTGGATGCCCATGCCAT(SEQEDNO:378)ACTGGCATGTTCTGGTCGGTC3AGC(SEQIDNO:379)ATGCTCATGGTCTGAGTGACGCTCA(SEQEDNO:380)TGAGTGATGGTCGTGGTCATG'GTGT(SEQIDNO:381)GAGAGGGCAAAGOTCAGGATCAAGA(SEQIDNO:382).SLC39A10;SEQIDNO.383;NP—065075.1MKVHMHTKFCIjICliljTFiraHCNHCHEEHDHGPEALHRQHRGMTEIjEPSKFSKQAAENEKKyYIEKLFERYGEMGRIiSFFGLEKLLTNLGLGBRKVVEINHEDLGHDHVSHIjDILAVQEGKHFHSHNHQHSHNHLNSENQTVTSVSTKRNHKCDPEKETVEVSVKSDDKHMHDHNHRLRHHHRLHHHLDHNNTHHFHNDSI^PSERGEPSNEPSTETlSrKTQEQSDVKLPKGKRKKKGRKSNENSEVITPGFPPNHDQGEQYEHNRVHKPDRVHN-GHSHVHLPER^GB[DPGRGHQD:LEiPDNEGEL!RHTRKREAPHVKNNAIISIiRKDLNEDDHHHEcijNVTQIjIiKYYGHGANSPISTDIiFTYIiCPALlLYQ'IDSilljCIEHFDKLLVEDINKDKNIiVPEDE^NI(3asawiCGI工SITV工SIiLSLLGVILVPIIN。GCFkFLliTFLVALAVGTMSGDALmLLPHSQGGHD.HSHQHAHGHGHSHGHESNKFLEEYDAVLKGLVALGG'工yllfiiehc工rmfkhykqqrgkqkwf'mkqnteestigrklSdhklnwtpdsdw:lq:lkp.lagtDDSWSEDRLNETgLiTDljEGQQESPPKNYLCIEE'EKIIDHSHSDGIjHTIHEHDLHAAAHNHHGENKTVLRKHNHQWHHjKHSHHSHGPCHSGSDIjKETdlANIAWMVIMGDGIHNFSDGLAIGAAFSAGLiTGGISTSIAVFCHEiLPHElLGDFAVLIjKAGMTVKQAIVYNIjIiSAMMAYIGMLIGTAVGQYANNITLW工FAVTAGMFLYVALVDMLPEMJLHGDGDNEEHGFCF^GQF工LQNLGLIiFGFAIMLVIALYEDKIVFDIQFSLC39A11;SEQIDNO:384;NP—631916MijQGHSSVFQALIjGTFFTWGMtAAGAAIjVFVFSSGQRRIIirJGSIjGFAAGVMIjAASYWSIjLAPAVEMATSSGGTOAFAFFPVAVGFTLGAAFVYLADIiLMPHLGAAJEXJPQTALALiNPGSTIiMKKKSDPEGPALIiFPESEIiSIRIDKSENGEAYQRKKAAATGLPEC3PAVPVPSRGNIAQPGC3SSWRR工AIiL工LAIT3:HNVPEGriAVC3VGFGA工EKTASATFESARNtiA工G工GIQNFPEGLAVSIiP:LRGAG^ST^RAFWYGQIiSGMVEPriAGVFGAFAVVLAEPIIiPYAJAFAAC3AMVYVVMSLC39A13;SEQIDNO:385;NP—689477.2MPGCPCPGCGMAGPRLIjFIiTAIALEIjIjGRAGGSQPALRSRGTATACRIjDNKESESWGALIjSGERLDTWICSIiIjGSLMVGLSGVFPIiLVIPliEMGTMIjRSEAGAWRrjKQIiljSFAIiGGIjIjGNVFIjHLLPEAWAYTCSASPGGEGQSIuQQQQQLGILWVIAGiriTFLAIjEKMFLiPSKEEGTSQAPNKDPTAAAAALNGGHCLAQPA^EPGLdAVVRSIKVSGYLNLLkNTIDNFTHGLAVAASFLVSKKIGLIiTTMAIIiLHEIPHEVGDFAILljRAGFDRWSAAKliQLSTALGGiLIjGAGFAICTQSPKGVEETAAWVLPFTSGGFLYIALVNVLPDIjIjEEEDPWIlSiLQQKLIjIjCAGIVVMVLFSIjFVDSEQIDNO:386GFIA工S工ISFLSIiliGVLVPLMNRVFFKFLLSliVALAVGTIiSGDAFljIjLPHSpASHHHSHSHEPAMEMKRGPIiFSHLSQNIEESAYFDJ^TWKLTALGGljYFMFLVEHI/rijICKQFKDKKKKNQKPENDDDVE工KKQ:LSY'ESQIjSTNEE.KVDT]i)RTEGYIjRADSQEPSHDSQQPAVIjEEEEVMIHAHPQEVYNEYVPRGKNKCHSriFHDTLGQSDIilHHHHDYHHITUHHHHQNHHPHSHSQRYSEEIjKDAGVATIjAWMVMGDGIiHNFSDGLAIGAFTEGLSSGLSTSVAFCIIEIIiPHELiGDFAVIiKAGMTVKQAVliYNALAMLAYLGMATGIF工GYAENVSMW工FALTAGFMYVALVDMVPEMLHDASDHGCSRWGYFFLNAGMLLGFGIMLiL工PLNIKSCSYKFLVKVLIV画l-S;SEQIDNO:365MGIQVPLNAT^FNYLCPAIINQ工DARSCL工HTSEKKAE工PPKTYSLQ工AWVGGFIAIS11SFLSliLGVILiVPLMNKVFFKFIjIjSFljVALAVGTLiSGDAFLiHLiIjPHSHASHHHSHSHEEPAMEMKRGPIiFSHLSSQNIEESAYFDSTWKGIiTALGGIiYFMFLVEHVLTIjIKQFKDKKKKNQKKPENliDDVEIKKQLSKYESQLSTNEEKVDTDDIlTEGYLiRADSQEPSHFDSQQPAVLEEEEVMIAHAHPQEVYNEYVPRGCKNKCHSHFHDTIiGQSDDLIHHHHPYHHILHHHHHQNHHPHSHSQRYSREELiKDAGVATLAWMVIMGDGLiHNFSDGLAIGAAPTEGLiSSGrjSiSVAVFCHEIjPHEIiGDFAVLrjKAGMTVKQAVLYNALSAMIAYLGIviATGIF工GHYAENVSMWIFALTAGIiFMYVALVDMVSFSEQIDNO:366MARKLSVILIl/TFALSVTNPLHEIiKAAAFPQTTEKISPNWESGINVDLAISTRQYHLQQLFYR;YGENNSLSVEGFRKLLQNIG工DKIKRIHIHHDHDHHSDHEHHS.DHERkSDHEHHSDHEHHSDHDHHSHHNHAASC3KNKRKALCPIHDSDSSGKDPRNSQGKGAHRPEHASGRRNVKDSV—SEVTSTVYNTVSEGTHFliETIETPRPGKLFPKDVSSST^PSVTSKSRVSRLAGRKTNE.SVSEPRKGFMYSRNTNENPQECFNASKLLTSHGMGIQVPiiNATEFNYLC'PAIINQIDARSCIjIHTSEKKAEIP'PKTYSLiQIAWGGFIAISIISFLSliL'GVTIiVPIMNRVFFKFLLSFliVALAVGTLSGDAFIiHLLPHSHASHHHSHSHEEPAMEMKRGPLFSHLS.SQNIEESAYP.DSTWKGLTALGGLYFMFLiVEHV:LTL工KQFKDKKKKNQKKPENDDDVEIkKQ!LSKYESQ赵'STNEEKVi)TDDRTECJ!fLRADSQEPSHFDSQQAV^LEEEEVMi:fiH^HFQ'EVYNEYVPRGCKNKCHSHEHDTLGQSDDIi工HHHHDYHHi:L油HHHQNHHPHSHSQRYSREEliKDAGVATIiAWMVIMGDGIiHN-FSDGLiAIGAAFTEGIjSSGIjSTSVAVFCHELiPHELGDFAVLLKADMTVKQAVLYWAIiSAMLAYLGMATGIFIGHYAENVSMWIFALTAGLPMYVALVDMVPEMLHNDASDHGCSRWGYFFLQNAGMLLGFGIMKLISI'FEHKIVPlil]S^尽管已参照其特定的实施方案对本发明进行了描述,但本领域技术人员应当理解可以进行各种改变以及可以以等同方式进行替代,而不背离本发明真实精神和范围的情况。此外,可以进行许多修改以使特定情况、材料、物质组合物、处理、处理步骤适应本发明的目的、精神和范围。所有的此类修改都在本发明的范围内。权利要求1、包含LIV-1调节剂和一种或多种可药用载体的组合物,其中LIV-1调节剂选自分离的双链RNA(dsRNA);包含SEQIDNO1序列的至少10个连续核苷酸的分离的寡核苷酸;和结合LIV-1结构域中的表位的抗体,所述LIV-1结构域选自LIV-1的N-端细胞外结构域、在跨膜结构域(TM)2和3之间的LIV-1细胞外结构域、在TM4和5之间的LIV-1细胞外结构域、在TM6和7之间的LIV-1细胞外结构域、和LIV-1的C-端细胞外结构域。2、权利要求l的组合物,其中寡核苷酸是dsRNA、siRNA、shRNA或反义寡核苷酸。3、权利要求l的组合物,其具有选自以下的一种或多种活性增加癌细胞凋亡、抑制癌细胞生长、抑制肿瘤形成、抑制癌细胞存活、抑制癌细胞增殖、抑制癌细胞转移、抑制细胞迁移、抑制血管生成、抑制LIV-1信号传导、抑制LIV-1介导的细胞-细胞粘附、抑制LIV-1介导的细胞-细胞膜相互作用、抑制LIV-1介导的细胞-细胞外基质相互作用、抑制LIV-1介导的细胞-细胞外基质降解、和抑制LIV-1表达。4、权利要求l的组合物,其中组合物是无菌可注射的。5、权利要求1的组合物,其中LIV-1调节剂抑制癌细胞生长、癌细胞存活、肿瘤形成和癌细胞增殖中的一种或多种。6、权利要求1的组合物,其中所述的LIV-1调节剂抑制细胞周期蛋白D1、纤连蛋白、RhoB、MT1画MMP、FGF、CDK4、VEGF、EGFR和EGFR磷酸化中的一种或多种。7、权利要求1的组合物,其中所述的LIV-1调节剂调节整联蛋白介导的活性。8、权利要求1的组合物,其中所述的LIV-1调节剂抑制SNAIL途径中的一个或多个基因。9、权利要求1的组合物,其中所述的LIV-1调节剂抑制Snail核定位。10、权利要求1的组合物,其中所述的LIV-1调节剂上调E-钙粘着蛋白、VE-钙粘着蛋白、Muc-l中的一种或多种。11、权利要求l的组合物,其中所述的LIV-1调节剂上调水闸蛋白、封闭蛋白、桥粒斑蛋白、胱天蛋白酶、p21、p53、BID(bcl-相互作用死亡激动剂)、DFF40(DNA片段化因子)和细胞角蛋白中的一种或多种。12、权利要求l的组合物,其中LIV-1调节剂抑制锌转运。13、权利要求1的组合物,其中LIV-1调节剂降低细胞质锌水平。14、权利要求1的组合物,其中UV-1调节剂是以至少1x108Ka的亲和力结合至LIV-1多肽的单克隆抗体。15、权利要求14的组合物,其中LIV-1多肽具有SEQIDNO:2的序列。16、权利要求14的组合物,其中单克隆抗体调节一种或多种LIV-1相关生物学活性。17、权利要求14的组合物,其中单克隆抗体抑制癌细胞生长、癌细胞存活、肺瘤形成和癌细胞增殖中的一种或多种。18、权利要求l的组合物,其中单克隆抗体是单克隆抗体、多克隆抗体、嵌合抗体、人类抗体、人源化抗体、单链抗体、双特异性抗体、多特异性抗体或Fab片段。19、权利要求14的组合物,其中单克隆抗体结合至LIV-1的一个或多个表位,所述的表位具有选自SEQIDNO:3-364和388-391的序列。20、权利要求14的组合物,其中单克隆抗体结合至在TM2和3之间的LIV-1细胞外结构域中的LIV-1表位。21、权利要求19的组合物,其中单克隆抗体结合至SEQIDNO:388的一个或多个表位。22、权利要求14的组合物,其中单克隆抗体结合至LIV-1N端细胞外结构域中的LIV-1表位。23、权利要求22的组合物,其中单克隆抗体结合至SEQIDNO:387的一个或多个表位,24、权利要求1的组合物,其中LIV-1调节剂是具有选自SEQIDNO:367-382的序列的寡核苷酸。25、产生权利要求14的抗体的经分离的细胞。26、产生权利要求14的抗体的杂交瘤细胞。27、产生权利要求14的抗体的非人类转基因动物。28、分离的带有表位的多肽,其包含SEQIDNO:2的一个或多个表位,所迷表位选自SEQIDNO:6-364和387-391。29、权利要求28的分离的带有表位的多肽,其进一步的限制条件是多肽不包含SEQIDNO:2的全部氨基酸序列。30、编码权利要求28的分离的带有表位的多肽的多核苷酸。31、权利要求28的带有表位的多肽,其中每一个所述表位由选自SEQIDNO:6-364和387-391的表位的约6至约20个连续氨基酸组成。32、权利要求28的带有表位的多肽,其包含SEQIDNO:2的至少两个表位,并且其中每一个所述表位由选自SEQIDNO:6-364和387-391的表位的约6至20个连续氨基酸组成。33、权利要求28的带有表位的多肽,其中至少一个所述表位由SEQIDNO:2的至少21个连续氨基酸组成。34、分离的UV-1抗体,其是通过用权利要求28的带有表位的多肽免疫受试者获得的。35、在有需要的患者中治疗癌症或癌症症状的方法,所述方法包括给患者施与治疗有效量的权利要求1的LIV-1调节剂。36、权利要求35的方法,其中在测量细胞生长的体外测试法中,LIV-1调节剂抑制表达LIV-1的癌细胞的生长至少25%。37、权利要求35的方法,其中在测量细胞凋亡的体外测试法中,LIV-1调节剂在小于约lmM的浓度能有效地在至少25%所接触的细胞中诱导细胞凋亡。38、权利要求35的方法,其中与对照相比较,LIV-1调节剂使细胞质锌水平减少至少25%。39、权利要求35的方法,其中所述的LIV-1调节剂抑制细胞周期蛋白Dl、纤连蛋白、RhoB、MT1-MMP、FGF、CDK4、VEGF、EGFR和EGFR磷酸化中的一种或多种。40、权利要求35的方法,其中与对照相比较,LIV-1调节剂抑制LIV-1表达至少25%。41、权利要求35的方法,其中LIV-l调节剂是siRNA、shRNA或反义寡核苷酸。42、权利要求41的方法,其中LIV-1调节剂是具有选自SEQIDNO:367-382的序列的寡核苷酸。43、权利要求35的方法,其中LIV-1调节剂是单克隆抗体。44、权利要求43的方法,其中单克隆抗体结合一个或多个表位,所述的表位具有选自SEQIDNO:3-364和388-391的序列。45、权利要求43的方法,其中单克隆抗体结合至在跨膜结构域(TM)2和3之间的LIV-1细胞外结构域中的LIV-1表位。46、权利要求43的方法,其中单克隆抗体结合至SEQIDNO:388的一个或多个表位。47、权利要求43的方法,其中单克隆抗体结合至LIV-1N端细胞外结构域中的LIV-1表位。48、权利要求43的方法,其中单克隆抗体结合至SEQIDNO:387的一个或多个表位。49、权利要求35的方法,其中癌症是乳腺癌、皮肤癌、食管癌、肝癌、胰腺癌、前列腺癌、子宫癌、子宫颈癌、肺癌、膀胱癌、卵巢癌、多发性骨髓瘤或黑素瘤。50、权利要求35的方法,其中癌症位于非激素调节的组织。51、权利要求49的方法,其中乳腺癌是雌激素受体阳性乳腺癌、雌激素受体阴性乳腺癌和转移性乳腺癌。52、权利要求49的方法,其中乳腺癌选自管腺癌、小叶腺癌和转移性腺癌。53、权利要求35的方法,其中癌症是鳞状细胞癌。54、权利要求35的方法,其还包括给患者施与常规的癌症治疗。55、权利要求35的方法,其还包括用化学治疗、放射治疗或外科手术中的一种或多种治疗患者。56、权利要求35的方法,其中癌症症状选自胸部肿块、乳头变化、胸部嚢肿、胸部疼痛、死亡、重量减轻、虚弱、极度疲劳、进食困难、食欲不振、久咳、恶化的气喘、咳出血、尿血、便血、恶心、呕吐、肝转移、肺转移、骨转移、腹痛下堕、气胀、腹膜腔中有液体、阴道流血、便秘、腹胀、结肠穿孔、急性腹膜炎、疼痛、吐血、重汗、发烧、高血压、贫血、腹泻、黄疸、眩晕、寒战、肌肉痉挛、结肠转移、肺转移、膀胱转移、肝转移、骨转移、肾转移、和胰腺转移、吞咽困难等。57、在患者中调节LIV-1相关生物学活性的方法,所述方法包括给患者施与调节LIV-1相关生物学活性有效量的权利要求1的LIV-1调节剂。58、权利要求57的方法,其中LIV-1调节剂是选择性结合至LIV-1的单克隆抗体。59、权利要求57的方法,其中患者患有或易诱发乳腺癌、皮肤癌、食管癌、肝癌、胰腺癌、前列腺癌、子宫癌、子宫颈癌、肺癌、膀胱癌、卵巢癌、多发性骨髓瘤和黑素瘤中的一种或多种。60、权利要求35的方法,其中LIV-1调节剂是抗体,并且通过体内治疗性抗体基因转移施与受试者。61、鉴定对LIV-1治疗敏感的患者的方法,包括(a)检测患者样本中LIV-1差异表达的存在或不存在,其中在所述样本中存在LIV-1差异表达表明患者是LIV-1治疗的候选者;且在所述样本中不存在LIV-1差异表达表明患者不是LIV-1治疗的候选者;(b)如果患者是LIV-1治疗的候选者,则给患者施与治疗有效量的权利要求1的组合物;和(c)如果患者不是LIV-1治疗的候选者,则给患者施与常规的癌症治疗。62、权利要求61的方法,其中与对照相比较,在患者中LIV-1的表达升高了至少50%。63、权利要求61的方法,其中通过测量LIV-1RNA检测LIV-1差异表达。64、权利要求61的方法,其中通过测量LIV-1表达产物检测LIV-1差异表达。65、权利要求61的方法,其还包括给患者施与常规的癌症治疗。66、抑制表达LIV-1的癌细胞生长的方法,所述方法包括将抑制癌细胞生长有效量的权利要求1的LIV-1调节剂与细胞接触。67、权利要求66的方法,其中与对照相比较,LIV-1调节剂使细胞质锌水平降低至少25%。68、权利要求66的方法,其中与对照相比较,LIV-1调节剂使细胞周期蛋白Dl水平降低至少25%。69、在表达LIV-1的细胞群中抑制癌细胞表型的方法,所述方法包括给所述细胞群施与抑制癌细胞表型有效量的权利要求1的LIV-1调节剂。70、权利要求69的方法,其中癌细胞选自乳腺癌、皮肤癌、食管癌、肝癌、胰腺癌、前列腺癌、子宫癌、子宫颈癌、肺癌、膀胱癌、卵巢癌、多发性骨髓瘤和黑素瘤。71、在样本中检测一种或多种表达LIV-1的癌细胞的方法,所述方法包括将样本与包含连接至显像剂的权利要求1的LIV-1调节剂的组合物接触并检测显像剂在样本中的定位。72、权利要求71的方法,其中组合物包含缀合至显像剂的LIV-1抗体。73、权利要求72的方法,其中显像剂是"F、43K、S2Fe、57Co、67Cu、67Ga、77Br、87MSr、86Y、90Y、"MTc、mIn、123I、125I、127Cs、129Cs、mI、132I、197Hg、2Q3pb或赢Bi。74、抑制两个或多个细胞相互作用的方法,其中至少一个所述细胞表达LIV-l,所述方法包括给包含所述细胞的样本施与有效量的权利要求1的LIV-1调节剂。75、权利要求74的方法,其中相互作用是在体内的。76、权利要求74的方法,其中LIV-1调节剂是与对照相比较使细胞质锌水平降低至少25%的单克隆抗体。77、权利要求74的方法,其中LIV-1调节剂是与对照相比较使细胞周期蛋白Dl水平降低至少25%的单克隆抗体。78、在CHO或骨髓瘤细胞中表达抗LIV-1抗体的方法,其中抗LIV-1抗体抑制一种或多种LIV-1相关生物学活性,所述方法包括在所述CHO或骨髓瘤细胞中表达编码抗LIV-1抗体的核酸。79、鉴定癌抑制剂的方法,所述癌的特征在于与对照相比LIV-1的过量表达,所述方法包括将表达LIV-1的细胞与候选化合物和LIV-1配体接触,并确定LIV-1相关锌转运活性是否受到抑制,其中LIV-1相关锌转运活性的抑制是癌抑制剂的指标。80、鉴定癌抑制剂的方法,所述癌的特征在于与对照相比LIV-1的过量表达,所述方法包括将表达LIV-1的细胞与候选化合物和LIV-1配体接触,并确定LIV-1下游标志物是否受到抑制,其中下游标志物的抑制是癌抑制剂的指标。81、权利要求80的方法,其中下游标志物是细胞周期蛋白Dl或细胞质锌水平。82、确定患者对LIV-1调节剂敏感性的方法,所述方法包括在所述患者的癌样本中检测LIV-1差异表达的证据,其中LIV-1差异表达的证据是患者对所述LIV-1调节剂敏感性的指标。83、权利要求82的方法,其中所述的LIV-1差异表达的证据是LIV-1在所述患者癌样本中的上调。84、从包含LIV-1蛋白的样本中纯化LIV-1蛋白的方法,包括a)提供亲和基质,所述亲和基质包含结合至固体支持物的权利要求1的抗体;b)将样本与亲和基质接触以形成亲和基质-LIV-l蛋白复合体;c)从样本剩余物中分离亲和基质-LIV-l蛋白复合体;以及d)从亲和基质释放UV-1蛋白。85、将细胞毒剂或诊断剂递送至一个或多个表达LIV-1的细胞的方法,所述方法包才舌a)提供缀合至权利要求1的抗体或其片段的细胞毒剂或诊断剂;以及b)将细胞暴露于抗体-剂或片段-剂缀合物。86、确定癌症患者预后的方法,包括确定所述患者的样本中LIV-1-S对LIV-1的比值,其中应用LIV-1-S对LIV-1的比值来确定癌症患者的预后。87、确定癌症患者预后的方法,包括在所述患者的样本中确定结合至细胞质膜的LIV-1的存在或不存在,其中所述患者的样本中不存在结合至细胞质膜的LIV-1指示患者良好的预后。88、权利要求86或87的方法,其中LIV-1由具有SEQIDNO:l的序列的核酸编码。89、权利要求86或87的方法,其中LIV-l具有SEQIDNO:2的序列。90、权利要求86的方法,其中LIV-l-5具有SEQIDNO:365的序列。91、权利要求86的方法,其中至少2:1的LIV-1-S:LIV-1比值是具有良好预后的患者的指标。92、包^#转运蛋白调节剂和一种或多种可药用载体的组合物,其中锌转运蛋白调节剂选自分离的双链RNA(dsRNA);包含选自序列SEQIDNO:383-385的至少10个连续核苷酸的分离的寡核苷酸;结合锌转运蛋白结构域中的表位的抗体,所述锌转运蛋白结构域选自N-端细胞外结构域、在跨膜结构域(TM)2和3之间的细胞外结构域、在TM4和5之间的细胞外结构域、在TM6和7之间的细胞外结构域、以及C-端细胞外结构域。93、权利要求92的组合物,其中锌转运蛋白是SLC39A10、SLC39A11或SLC39A13。94、权利要求92的组合物,其中所述锌转运蛋白调节剂调节整联蛋白介导的活性、抑制锌转运或降低细胞质锌水平。95、权利要求92的组合物,其中寡核苷酸是siRNA或反义寡核苷酸。96、权利要求92的组合物,其中锌转运蛋白调节剂是以至少1x108Ka的亲和力结合至锌转运蛋白的单克隆抗体。97、权利要求97的组合物,其中单克隆抗体结合至锌转运蛋白N端细胞外结构域中的一个或多个表位。98、权利要求97的组合物,其中单克隆抗体结合至在跨膜结构域(TM)2和3之间的锌转运蛋白细胞外结构域中的一个或多个表位。99、权利要求97的组合物,其中单克隆抗体抑制癌细胞生长、癌细胞存活、肿瘤形成和癌细胞增殖中的一种或多种。100、在有需要的患者中治疗癌症或癌症症状的方法,所述方法包括给患者施与治疗有效量的权利要求92的锌转运蛋白调节剂。101、权利要求100的方法,其中锌转运蛋白调节剂具有选自以下的一种或多种活性增加癌细胞凋亡、抑制癌细胞生长、抑制癌细胞存活、抑制肿瘤形成、抑制癌细胞增殖、抑制癌细胞转移、抑制细胞迁移、抑制血管生成、抑制LIV-1信号传导、抑制LIV-1介导的细胞-细胞粘附、抑制LIV-1介导的细胞-细胞膜相互作用、抑制LIV-1介导的细胞-细胞外基质相互作用、抑制LIV-1介导的细胞-细胞外基质降解、和抑制LIV-1表达。102、权利要求100的方法,其中在测定细胞生长的体外测试法中,锌转运蛋白调节剂抑制表达锌转运蛋白的癌细胞的癌细胞生长至少30%。103、权利要求100的方法,其中在测定细胞凋亡的体外测试法中,锌转运蛋白调节剂在小于约lmM的浓度能有效地在至少20%的接触的细胞中诱导细胞凋亡。104、权利要求100的方法,其中锌转运蛋白调节剂抑制锌转运。105、权利要求100的方法,其中锌转运蛋白调节剂调节细胞质锌水平。106、权利要求100的方法,其中所述的锌转运蛋白调节剂调节整联蛋白介导的活性。107、权利要求101的方法,其中与对照相比较,锌转运蛋白调节剂至少25%抑制锌转运蛋白表达。108、权利要求100的方法,其中锌转运蛋白调节剂是单克隆抗体。109、权利要求108的方法,其中抗体具有对除锌转运蛋白之外的多肽的小于约1xl05Ka的结合亲和力。110、权利要求109的方法,其中单克隆抗体诱导细胞凋亡。111、权利要求109的方法,其中单克隆抗体抑制肺瘤形成。112、在患者中调节锌转运蛋白相关生物学活性的方法,所述方法包括给患者施与调节锌转运蛋白相关生物学活性有效量的权利要求92的锌转运蛋白调节剂。113、权利要求112的方法,其中锌转运蛋白调节剂是选择性结合至锌转运蛋白的单克隆抗体。114、权利要求100或112的方法,其中患者患有或易诱发乳腺癌、皮肤癌、食管癌、肝癌、胰腺癌、前列腺癌、子宫癌、子宫颈癌、肺癌、膀胱癌、卵巢癌、多发性骨髓瘤和黑素瘤中的一种或多种。115、抑制表达锌转运蛋白的癌细胞生长的方法,所述方法包括将细胞与抑制癌细胞生长有效量的权利要求92的锌转运蛋白调节剂接触。116、权利要求115的方法,其中锌转运蛋白调节剂是选择性地结合锌转运蛋白并与对照相比较调节细胞质锌水平至少30%的单克隆抗体。117、在样本中检测一种或多种表达锌转运蛋白的癌细胞的方法,所述方法包括将样本与包含连接至显像剂的权利要求92的锌转运蛋白调节剂的组合物接触并检测显像剂在样本中的定位。118、权利要求117的方法,其中组合物包含缀合至显像剂的锌转运蛋白抗体。119、权利要求118的方法,其中显像剂是"F、43K、52Fe、S7Co、67Cu、67Ga、77Br、87MSr、86Y、90Y、"MTc、mIn、123I、125I、127Cs、129Cs、131I、132I、197Hg、203pb或206Bi。120、抑制两个或多个细胞相互作用的方法,其中至少一个所述细胞表达锌转运蛋白,所述方法包括给包含所述细胞的样本施与有效量的权利要求92的锌转运蛋白调节剂。121、权利要求120的方法,其中相互作用是在体内的。122、鉴定癌抑制剂的方法,所述癌的特征在于与对照相比锌转运蛋白的过量表达,所述方法包括将表达锌转运蛋白的细胞与候选化合物和锌转运蛋白配体接触,并确定锌转运活性是否受到抑制,其中锌转运活性的抑制是癌抑制剂的指标。123、鉴定癌抑制剂的方法,所述癌的特征在于与对照相比锌转运蛋白的过量表达,所述方法包括将表达锌转运蛋白的细胞与候选化合物和锌转运蛋白配体接触,并确定锌转运蛋白下游标志物是否受到抑制,其中下游标志物的抑制是癌抑制剂的指标。124、确定患者对锌转运蛋白调节剂敏感性的方法,所述方法包括在所述患者的癌样本中检测锌转运蛋白差异表达的证据,其中锌转运蛋白差异表达的证据是患者对所述锌转运蛋白调节剂敏感性的指标。125、权利要求124的方法,其中所述的锌转运蛋白差异表达的证据是锌转运蛋白在所述患者癌样本中的上调。126、从包含一种或多种锌转运蛋白的样本中纯化锌转运蛋白的方法,所述方法包括a)提供亲和基质,所述亲和基质包含结合至固体支持物的权利要求92的抗体;b)将样本与亲和基质接触以形成亲和基质-锌转运蛋白复合体;c)从样本剩余物中分离亲和基质-锌转运蛋白复合体;以及d)从亲和基质释放锌转运蛋白。127、将细胞毒剂或诊断剂递送至一个或多个表达锌转运蛋白的细胞的方法,所述方法包括a)提供缀合至权利要求92的抗体或其片段的细胞毒剂或诊断剂;以及b)将细胞暴露于抗体-剂或片段-剂缀合物。全文摘要本发明尤其提供了治疗癌症的方法、治疗癌症的组合物以及用于诊断和/或检测癌症的方法和组合物。具体而言,本发明提供了用于治疗、诊断和检测与LIV-1过量表达相关的癌症的方法和组合物。文档编号C07K14/47GK101622273SQ200780021878公开日2010年1月6日申请日期2007年4月12日优先权日2006年4月13日发明者D·齐默尔曼,G·于,M·J·扬塔波尔,R·多,V·尚申请人:诺瓦提斯疫苗和诊断公司